RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420886.6

SBNO1-202, Transcript of strawberry notch homolog 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SBNO1, Length 10,981 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO1-202ENST00000420886 SH3PXD2BA1X283 911 aa6.71□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 LRRC10BA6NIK2 292 aa6.71□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 MAGEC1O60732 1142 aa6.71□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 SERPINB5P36952 375 aa6.71□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 ROR1Q01973 937 aa6.71□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 ZNF544Q6NX49 715 aa6.71□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 TLDC1Q6P9B6 456 aa6.71□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 CLNKQ7Z7G1 428 aa6.71□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 PPIL6Q8IXY8 311 aa6.71□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 ENKURQ8TC29 256 aa6.71□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 PROX1Q92786 737 aa6.71□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 MTERF3Q96E29 417 aa6.71□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 KLHL32Q96NJ5 620 aa6.71□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 RGS20O76081 388 aa6.71□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 RPA1P27694 616 aa6.71□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 PERM1Q5SV97 790 aa6.71□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 ODR4Q5SWX8 454 aa6.71□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 ZNF790Q6PG37 636 aa6.71□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 KLHL17Q6TDP4 642 aa6.71□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 NLRP10Q86W26 655 aa6.71□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 ANKMY2Q8IV38 441 aa6.71□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 ZSWIM1Q9BR11 485 aa6.71□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa6.71□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 ERBB3P21860 1342 aa6.71□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 MED7O43513 233 aa6.71□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 EPN2O95208 641 aa6.71□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 CD44P16070 742 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 SULT2A1Q06520 285 aa6.71□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 DMC1Q14565 340 aa6.71□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 HERC3Q15034 1050 aa6.71□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 NRF1Q16656 503 aa6.71□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 PDZK1Q5T2W1 519 aa6.71□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 FBXL16Q8N461 479 aa6.71□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 UBASH3BQ8TF42 649 aa6.71□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 OTULINQ96BN8 352 aa6.71□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 BIRC8Q96P09 236 aa6.71□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 PSTPIP2Q9H939 334 aa6.71□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 PCYOX1Q9UHG3 505 aa6.71□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 ABCC3O15438 1527 aa6.71□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 TM7SF2O76062 418 aa6.71□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 MYL4P12829 197 aa6.71□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 LSAMPQ13449 338 aa6.71□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 LAMC2Q13753 1193 aa6.71□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 TMTC4Q5T4D3 741 aa6.71□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 PRMT9Q6P2P2 845 aa6.71□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 ZNF354CQ86Y25 554 aa6.71□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 HSPBAP1Q96EW2 488 aa6.71□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa6.71□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 PNPLA6Q8IY17 1366 aa6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 LRRIQ4A6NIV6 560 aa6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 KLRF2D3W0D1 207 aa6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 FCER1AP12319 257 aa6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 OSBP2Q969R2 916 aa6.7□□□□□ -1.34
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SBNO1-202ENST00000420886 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 MEI4A8MW99 385 aa6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 HALP42357 657 aa6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 TNFAIP2Q03169 654 aa6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 TTC39CQ8N584 583 aa6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
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SBNO1-202ENST00000420886 TBCKQ8TEA7 893 aa6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 MTMR8Q96EF0 704 aa6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
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SBNO1-202ENST00000420886 INTS13Q9NVM9 706 aa6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 APEX2Q9UBZ4 518 aa6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 GIT1Q9Y2X7 761 aa6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 ALG6Q9Y672 507 aa6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 PCM1Q15154 2024 aa6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 FYNP06241 537 aa6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 KRT19P08727 400 aa6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 NPR1P16066 1061 aa6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 ALOX12P18054 663 aa6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.342e-6■■■□□ 18.7
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SBNO1-202ENST00000420886 VPS33BQ9H267 617 aa6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 GTF3C4Q9UKN8 822 aa6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 AGAP1Q9UPQ3 857 aa6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 DOLKQ9UPQ8 538 aa6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 A0A1W2PRG6 482 aa6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 TSPAN4O14817 238 aa6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 FAM228BP0C875 321 aa6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 KCNT1Q5JUK3 1230 aa6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 C6orf10Q5SRN2 563 aa6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 KRT73Q86Y46 540 aa6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 PM20D2Q8IYS1 436 aa6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 A0A087X0T9 212 aa6.7□□□□□ -1.34
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