RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259216.4

CFC1-201, Transcript of cripto, FRL-1, cryptic family 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CFC1, Length 1,046 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFC1-201ENST00000259216 OR6B3Q8NGW1 331 aa21.61■■□□□ 1.05
CFC1-201ENST00000259216 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
CFC1-201ENST00000259216 CEP295NLQ96MC4 621 aa21.61■■□□□ 1.05
CFC1-201ENST00000259216 GCNAQ96QF7 691 aa21.61■■□□□ 1.05
CFC1-201ENST00000259216 SLC22A12Q96S37 553 aa21.61■■□□□ 1.05
CFC1-201ENST00000259216 SNX25Q9H3E2 840 aa21.61■■□□□ 1.05
CFC1-201ENST00000259216 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
CFC1-201ENST00000259216 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
CFC1-201ENST00000259216 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
CFC1-201ENST00000259216 FANCMQ8IYD8 2048 aa21.6■■□□□ 1.05
CFC1-201ENST00000259216 PHACTR2O75167 634 aa21.6■■□□□ 1.05
CFC1-201ENST00000259216 KIF20AO95235 890 aa21.6■■□□□ 1.05
CFC1-201ENST00000259216 RAP1GAPP47736 663 aa21.6■■□□□ 1.05
CFC1-201ENST00000259216 FAM160A1Q05DH4 1040 aa21.6■■□□□ 1.05
CFC1-201ENST00000259216 ENPEPQ07075 957 aa21.6■■□□□ 1.05
CFC1-201ENST00000259216 PPP3CAQ08209 521 aa21.6■■□□□ 1.05
CFC1-201ENST00000259216 ASCL5Q7RTU5 278 aa21.6■■□□□ 1.05
CFC1-201ENST00000259216 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa21.6■■□□□ 1.05
CFC1-201ENST00000259216 BPIFB1Q8TDL5 484 aa21.6■■□□□ 1.05
CFC1-201ENST00000259216 TTLL2Q9BWV7 592 aa21.6■■□□□ 1.05
CFC1-201ENST00000259216 B3GNT5Q9BYG0 378 aa21.6■■□□□ 1.05
CFC1-201ENST00000259216 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa21.6■■□□□ 1.05
CFC1-201ENST00000259216 GCNT4Q9P109 453 aa21.6■■□□□ 1.05
CFC1-201ENST00000259216 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
CFC1-201ENST00000259216 USP34Q70CQ2 3546 aa21.59■■□□□ 1.05
CFC1-201ENST00000259216 MAN2B1O00754 1011 aa21.59■■□□□ 1.05
CFC1-201ENST00000259216 VAMP7P51809 220 aa21.59■■□□□ 1.05
CFC1-201ENST00000259216 CYP27A1Q02318 531 aa21.59■■□□□ 1.05
CFC1-201ENST00000259216 EDRF1Q3B7T1 1238 aa21.59■■□□□ 1.05
CFC1-201ENST00000259216 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa21.59■■□□□ 1.05
CFC1-201ENST00000259216 COBLL1Q53SF7 1204 aa21.59■■□□□ 1.05
CFC1-201ENST00000259216 ZNF667Q5HYK9 610 aa21.59■■□□□ 1.05
CFC1-201ENST00000259216 TXNDC11Q6PKC3 985 aa21.59■■□□□ 1.05
CFC1-201ENST00000259216 PAQR9Q6ZVX9 377 aa21.59■■□□□ 1.05
CFC1-201ENST00000259216 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
CFC1-201ENST00000259216 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
CFC1-201ENST00000259216 CHFRQ96EP1 664 aa21.59■■□□□ 1.05
CFC1-201ENST00000259216 C8orf48Q96LL4 319 aa21.59■■□□□ 1.05
CFC1-201ENST00000259216 FAM83CQ9BQN1 747 aa21.59■■□□□ 1.05
CFC1-201ENST00000259216 BCO2Q9BYV7 579 aa21.59■■□□□ 1.05
CFC1-201ENST00000259216 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa21.59■■□□□ 1.05
CFC1-201ENST00000259216 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
CFC1-201ENST00000259216 PRR23AA6NEV1 266 aa21.58■■□□□ 1.05
CFC1-201ENST00000259216 F8VP50 259 aa21.58■■□□□ 1.05
CFC1-201ENST00000259216 HLA-DRAP01903 254 aa21.58■■□□□ 1.05
CFC1-201ENST00000259216 SP9P0CG40 484 aa21.58■■□□□ 1.05
CFC1-201ENST00000259216 TRIM49P0CI25 452 aa21.58■■□□□ 1.05
CFC1-201ENST00000259216 TRIM49CP0CI26 452 aa21.58■■□□□ 1.05
CFC1-201ENST00000259216 MAGEA9P43362 315 aa21.58■■□□□ 1.05
CFC1-201ENST00000259216 ASPAP45381 313 aa21.58■■□□□ 1.05
CFC1-201ENST00000259216 SOX9P48436 509 aa21.58■■□□□ 1.05
CFC1-201ENST00000259216 NOP14P78316 857 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
CFC1-201ENST00000259216 TNK2Q07912 1038 aa21.58■■□□□ 1.05
CFC1-201ENST00000259216 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
CFC1-201ENST00000259216 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa21.58■■□□□ 1.05
CFC1-201ENST00000259216 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
CFC1-201ENST00000259216 YAF2Q8IY57 180 aa21.58■■□□□ 1.05
CFC1-201ENST00000259216 FAM3CQ92520 227 aa21.58■■□□□ 1.05
CFC1-201ENST00000259216 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
CFC1-201ENST00000259216 TIGD1Q96MW7 591 aa21.58■■□□□ 1.05
CFC1-201ENST00000259216 CHRDQ9H2X0 955 aa21.58■■□□□ 1.05
CFC1-201ENST00000259216 GTSE1Q9NYZ3 720 aa21.58■■□□□ 1.05
CFC1-201ENST00000259216 HMGXB4Q9UGU5 601 aa21.58■■□□□ 1.05
CFC1-201ENST00000259216 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa21.58■■□□□ 1.05
CFC1-201ENST00000259216 FAM186AA6NE01 2351 aa21.57■■□□□ 1.04
CFC1-201ENST00000259216 A8MXQ7 604 aa21.57■■□□□ 1.04
CFC1-201ENST00000259216 CLDN5O00501 218 aa21.57■■□□□ 1.04
CFC1-201ENST00000259216 DPYSL4O14531 572 aa21.57■■□□□ 1.04
CFC1-201ENST00000259216 GFRA3O60609 400 aa21.57■■□□□ 1.04
CFC1-201ENST00000259216 CHRNB1P11230 501 aa21.57■■□□□ 1.04
CFC1-201ENST00000259216 CCNE1P24864 410 aa21.57■■□□□ 1.04
CFC1-201ENST00000259216 CTHP32929 405 aa21.57■■□□□ 1.04
CFC1-201ENST00000259216 PRCPP42785 496 aa21.57■■□□□ 1.04
CFC1-201ENST00000259216 SPOPLQ6IQ16 392 aa21.57■■□□□ 1.04
CFC1-201ENST00000259216 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa21.57■■□□□ 1.04
CFC1-201ENST00000259216 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
CFC1-201ENST00000259216 FAM186BQ8IYM0 893 aa21.57■■□□□ 1.04
CFC1-201ENST00000259216 TAS1R2Q8TE23 839 aa21.57■■□□□ 1.04
CFC1-201ENST00000259216 TAF4BQ92750 862 aa21.57■■□□□ 1.04
CFC1-201ENST00000259216 MSANTD3Q96H12 275 aa21.57■■□□□ 1.04
CFC1-201ENST00000259216 GSDMAQ96QA5 445 aa21.57■■□□□ 1.04
CFC1-201ENST00000259216 ELOVL4Q9GZR5 314 aa21.57■■□□□ 1.04
CFC1-201ENST00000259216 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
CFC1-201ENST00000259216 HPS4Q9NQG7 708 aa21.57■■□□□ 1.04
CFC1-201ENST00000259216 TDP1Q9NUW8 608 aa21.57■■□□□ 1.04
CFC1-201ENST00000259216 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
CFC1-201ENST00000259216 MYO15AQ9UKN7 3530 aa21.56■■□□□ 1.04
CFC1-201ENST00000259216 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
CFC1-201ENST00000259216 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa21.56■■□□□ 1.04
CFC1-201ENST00000259216 C2orf78A6NCI8 922 aa21.56■■□□□ 1.04
CFC1-201ENST00000259216 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
CFC1-201ENST00000259216 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
CFC1-201ENST00000259216 AVPR1AP37288 418 aa21.56■■□□□ 1.04
CFC1-201ENST00000259216 GRIK1P39086 918 aa21.56■■□□□ 1.04
CFC1-201ENST00000259216 GCLMP48507 274 aa21.56■■□□□ 1.04
CFC1-201ENST00000259216 PMS1P54277 932 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
CFC1-201ENST00000259216 PLCB2Q00722 1185 aa21.56■■□□□ 1.04
CFC1-201ENST00000259216 ADAM9Q13443 819 aa21.56■■□□□ 1.04
CFC1-201ENST00000259216 MAMSTRQ6ZN01 415 aa21.56■■□□□ 1.04
CFC1-201ENST00000259216 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.1 ms