RNA–Protein interactions for RNA: YNR040W

YNR040W, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene YNR040W, Length 771 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNR040W	YNR040W	YMR166C	Q03829	368 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YNR040W	YNR040W	CNL1	Q06333	122 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YNR040W	YNR040W	YDL085C-A	Q3E7B7	68 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
YNR040W	YNR040W	IRA2	P19158	3079 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YNR040W	YNR040W	IRA1	P18963	3092 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YNR040W	YNR040W	CYC3	P06182	269 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YNR040W	YNR040W	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
YNR040W	YNR040W	ATP5	P09457	212 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YNR040W	YNR040W	MDM10	P18409	493 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YNR040W	YNR040W	CDC43	P18898	376 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YNR040W	YNR040W	YPS1	P32329	569 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YNR040W	YNR040W	FZF1	P32805	299 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YNR040W	YNR040W	PAU16	P35994	123 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YNR040W	YNR040W	TEM1	P38987	245 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YNR040W	YNR040W	MBB1	P39534	108 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YNR040W	YNR040W	YER134C	P40081	178 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YNR040W	YNR040W	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
YNR040W	YNR040W	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
YNR040W	YNR040W	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
YNR040W	YNR040W	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
YNR040W	YNR040W	YKL102C	P34249	101 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YNR040W	YNR040W	GLC8	P41818	229 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YNR040W	YNR040W	IMP2	P46972	177 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YNR040W	YNR040W	YNL092W	P53934	400 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YNR040W	YNR040W	UPS3	Q04006	179 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YNR040W	YNR040W	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
YNR040W	YNR040W	IRC23	Q08416	157 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YNR040W	YNR040W	TIM18	Q08749	192 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YNR040W	YNR040W	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
YNR040W	YNR040W	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
YNR040W	YNR040W	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
YNR040W	YNR040W	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
YNR040W	YNR040W	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
YNR040W	YNR040W	POR2	P40478	281 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YNR040W	YNR040W	YIL012W	P40551	113 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YNR040W	YNR040W	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
YNR040W	YNR040W	GTO3	Q04806	366 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YNR040W	YNR040W	FSF1	Q12029	327 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
YNR040W	YNR040W	HTL1	Q9URQ5	78 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YNR040W	YNR040W	YBR056W-A	I2HB52	66 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YNR040W	YNR040W	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
YNR040W	YNR040W	RPL12B	P0CX54	165 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YNR040W	YNR040W	VMA11	P32842	164 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YNR040W	YNR040W	YMR141C	P40211	102 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YNR040W	YNR040W	YJL027C	P47063	138 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
YNR040W	YNR040W	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
YNR040W	YNR040W	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
YNR040W	YNR040W	YLR342W-A	Q3E810	57 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YNR040W	YNR040W	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
YNR040W	YNR040W	YCR007C	P25354	239 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YNR040W	YNR040W	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
YNR040W	YNR040W	SNF11	P38956	169 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YNR040W	YNR040W	YJL028W	P47062	111 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YNR040W	YNR040W	YGR219W	P53307	113 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YNR040W	YNR040W	CAB4	P53332	305 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YNR040W	YNR040W	PKR1	Q03880	122 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
YNR040W	YNR040W	MHR1	Q06630	226 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YNR040W	YNR040W	GEP3	Q08622	556 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YNR040W	YNR040W	NAT5	Q08689	176 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YNR040W	YNR040W	VMA16	P23968	213 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YNR040W	YNR040W	COX16	P47081	118 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YNR040W	YNR040W	YMR317W	Q04893	1140 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YNR040W	YNR040W	HAP3	P13434	144 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YNR040W	YNR040W	CMC1	P36064	111 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YNR040W	YNR040W	MIC12	P38341	106 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YNR040W	YNR040W	YHR140W	P38842	239 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YNR040W	YNR040W	GLE2	P40066	365 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YNR040W	YNR040W	YER188W	P40103	239 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YNR040W	YNR040W	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
YNR040W	YNR040W	HAC1	P41546	238 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YNR040W	YNR040W	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
YNR040W	YNR040W	YPI1	P43587	155 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YNR040W	YNR040W	MST27	P53176	234 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YNR040W	YNR040W	BRP1	P53194	125 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YNR040W	YNR040W	YGR017W	P53210	297 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YNR040W	YNR040W	DIA1	P54005	336 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YNR040W	YNR040W	DPP1	Q05521	289 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YNR040W	YNR040W	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
YNR040W	YNR040W	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YNR040W	YNR040W	YFL068W	P0CX99	160 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YNR040W	YNR040W	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YNR040W	YNR040W	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YNR040W	YNR040W	CPT1	P17898	393 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YNR040W	YNR040W	MSL1	P40567	111 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
YNR040W	YNR040W	GPI19	Q04082	140 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YNR040W	YNR040W	PAU23	Q07987	124 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YNR040W	YNR040W	YOL160W	Q08321	113 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YNR040W	YNR040W	YPL162C	Q12042	273 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YNR040W	YNR040W	TIM22	Q12328	207 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YNR040W	YNR040W	PAU17	Q12370	124 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YNR040W	YNR040W	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YNR040W	YNR040W	YNL194C	P40169	301 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YNR040W	YNR040W	YGL230C	P53074	147 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YNR040W	YNR040W	POP3	P53833	195 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YNR040W	YNR040W	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YNR040W	YNR040W	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YNR040W	YNR040W	GRH1	Q04410	372 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YNR040W	YNR040W	MSC3	Q05812	728 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YNR040W	YNR040W	YDL157C	Q12082	118 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YNR040W	YNR040W	Q0297	Q9ZZV8	51 aa		4.65	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 108.2 ms