RNA–Protein interactions for RNA: YML027W

YOX1, Transcript of Homeobox transcriptional repressor, yeast

Gene YOX1, Length 1,158 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YOX1	YML027W	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
YOX1	YML027W	YLR342W-A	Q3E810	57 aa		5	□□□□□ -1.61
YOX1	YML027W	MRPL28	P36527	147 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YOX1	YML027W	KRE9	P39005	276 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YOX1	YML027W	GCV3	P39726	170 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YOX1	YML027W	YNL217W	P40152	326 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YOX1	YML027W	YMR141C	P40211	102 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YOX1	YML027W	HUA1	P40325	198 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YOX1	YML027W	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YOX1	YML027W	YJL028W	P47062	111 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YOX1	YML027W	DAD4	P69851	72 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YOX1	YML027W	YCL001W-A	P87012	153 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YOX1	YML027W	AIM34	Q03673	198 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YOX1	YML027W	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YOX1	YML027W	YOR015W	Q12169	119 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YOX1	YML027W	DAD1	Q12248	94 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YOX1	YML027W	RTC6	O14464	93 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YOX1	YML027W	RNA15	P25299	296 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YOX1	YML027W	HMX1	P32339	317 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YOX1	YML027W	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YOX1	YML027W	YDL183C	P48569	320 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YOX1	YML027W	YBR200W-A	Q3E755	54 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YOX1	YML027W	YLL066W-B	Q8TGJ7	56 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YOX1	YML027W	YPL229W	Q99395	206 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YOX1	YML027W	AGA1	P32323	725 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YOX1	YML027W	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YOX1	YML027W	YPT10	P38146	199 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YOX1	YML027W	YGL185C	P53100	379 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YOX1	YML027W	ADD37	Q03233	198 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YOX1	YML027W	YPT53	P36019	220 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YOX1	YML027W	TIM21	P53220	239 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YOX1	YML027W	YGL194C-A	Q2V2P6	80 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YOX1	YML027W	MGA1	P53050	456 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YOX1	YML027W	PAU4	P53427	120 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YOX1	YML027W	DPP1	Q05521	289 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YOX1	YML027W	YLR042C	Q07990	161 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YOX1	YML027W	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YOX1	YML027W	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YOX1	YML027W	RPL12B	P0CX54	165 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YOX1	YML027W	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YOX1	YML027W	RPL14A	P36105	138 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YOX1	YML027W	RPL14B	P38754	138 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YOX1	YML027W	SPC25	P40014	221 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YOX1	YML027W	EMC5	P40540	141 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YOX1	YML027W	DIA1	P54005	336 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YOX1	YML027W	ERI1	P62651	68 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YOX1	YML027W	UPS3	Q04006	179 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YOX1	YML027W	TIM22	Q12328	207 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YOX1	YML027W	RPL33A	P05744	107 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YOX1	YML027W	RPL33B	P41056	107 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YOX1	YML027W	DGA1	Q08650	418 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YOX1	YML027W	SHG1	P38337	142 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YOX1	YML027W	SUR2	P38992	349 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YOX1	YML027W	CYB5	P40312	120 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YOX1	YML027W	POG1	P40473	351 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YOX1	YML027W	JAC1	P53193	184 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YOX1	YML027W	RPS22A	P0C0W1	130 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YOX1	YML027W	PAU1	P0CE88	120 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YOX1	YML027W	PAU14	P0CE89	120 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YOX1	YML027W	PAU6	P0CE90	120 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YOX1	YML027W	PAU18	P0CE91	120 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YOX1	YML027W	PAU8	P0CE92	120 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YOX1	YML027W	PAU11	P0CE93	120 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YOX1	YML027W	YCR023C	P25351	611 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YOX1	YML027W	PAU13	P38725	120 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YOX1	YML027W	SVP26	P38869	228 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YOX1	YML027W	YIL163C	P40448	117 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YOX1	YML027W	ATP19	P81451	68 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YOX1	YML027W	PAU10	Q03050	120 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YOX1	YML027W	ATG33	Q06485	197 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YOX1	YML027W	PAU20	Q08322	120 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YOX1	YML027W	YOR105W	Q08504	108 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YOX1	YML027W	COX19	Q3E731	98 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YOX1	YML027W	PAU9	Q3E770	120 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YOX1	YML027W	PCC1	Q3E833	88 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YOX1	YML027W	YPR010C-A	A5Z2X5	72 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YOX1	YML027W	YBR013C	P38215	129 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YOX1	YML027W	YFR045W	P43617	309 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YOX1	YML027W	YDR034C-A	P0C289	58 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YOX1	YML027W	TEM1	P38987	245 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YOX1	YML027W	YGR026W	P53217	278 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YOX1	YML027W	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YOX1	YML027W	DIF1	O13577	133 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YOX1	YML027W	POF1	P25576	258 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YOX1	YML027W	PMP3	P87284	55 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YOX1	YML027W	RRT15	Q3E811	62 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YOX1	YML027W	YMR122W-A	Q3E842	84 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YOX1	YML027W	FZF1	P32805	299 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YOX1	YML027W	MIX23	P38162	196 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YOX1	YML027W	YDR115W	Q04598	105 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YOX1	YML027W	TIR1	P10863	254 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YOX1	YML027W	UBC5	P15732	148 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YOX1	YML027W	PGD1	P40356	397 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YOX1	YML027W	MOG1	P47123	218 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YOX1	YML027W	RIB5	P38145	238 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YOX1	YML027W	BET5	Q03630	159 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YOX1	YML027W	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YOX1	YML027W	YAR023C	D6VPM8	179 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YOX1	YML027W	SEC59	P20048	519 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YOX1	YML027W	YHR140W	P38842	239 aa		4.84	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 43.2 ms