RNA–Protein interactions for RNA: YHR114W

BZZ1, Transcript of SH3 domain protein implicated in regulating actin polymerization, yeast

Gene BZZ1, Length 1,902 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BZZ1	YHR114W	TRP1	P00912	224 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BZZ1	YHR114W	RPL2A	P0CX45	254 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BZZ1	YHR114W	RPL2B	P0CX46	254 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BZZ1	YHR114W	TIM12	P32830	109 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BZZ1	YHR114W	PCL5	P38794	229 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BZZ1	YHR114W	CPD1	P53314	239 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BZZ1	YHR114W	MSA1	Q08471	629 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BZZ1	YHR114W	BOL1	Q3E793	110 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BZZ1	YHR114W	YLR302C	O13544	120 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BZZ1	YHR114W	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BZZ1	YHR114W	GLE2	P40066	365 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BZZ1	YHR114W	USV1	Q12132	391 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BZZ1	YHR114W	HTL1	Q9URQ5	78 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BZZ1	YHR114W	FLO9	P39712	1322 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BZZ1	YHR114W	MDM10	P18409	493 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BZZ1	YHR114W	TOM6	P33448	61 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BZZ1	YHR114W	YHL042W	P38729	150 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BZZ1	YHR114W	YPI1	P43587	155 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BZZ1	YHR114W	SKI6	P46948	246 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BZZ1	YHR114W	SDC1	Q03323	175 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BZZ1	YHR114W	YHM2	Q04013	314 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BZZ1	YHR114W	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BZZ1	YHR114W	RPP1	P38786	293 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BZZ1	YHR114W	YHR140W	P38842	239 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BZZ1	YHR114W	TIM17	P39515	158 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BZZ1	YHR114W	HST4	P53688	370 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BZZ1	YHR114W	MRX11	Q03079	207 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BZZ1	YHR114W	HPF1	Q05164	967 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BZZ1	YHR114W	IRC25	Q07951	179 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BZZ1	YHR114W	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BZZ1	YHR114W	YLR412C-A	Q3E742	68 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BZZ1	YHR114W	VMA3	P25515	160 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BZZ1	YHR114W	PET191	Q02772	108 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BZZ1	YHR114W	LSM6	Q06406	86 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BZZ1	YHR114W	TIM18	Q08749	192 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BZZ1	YHR114W	YHR139C-A	O13536	103 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BZZ1	YHR114W	MRPS5	P33759	307 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BZZ1	YHR114W	SFT2	P38166	215 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BZZ1	YHR114W	VPS55	P47111	140 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BZZ1	YHR114W	YJR115W	P47152	169 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BZZ1	YHR114W	YOL029C	Q08187	201 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BZZ1	YHR114W	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
BZZ1	YHR114W	YCR006C	P25350	157 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BZZ1	YHR114W	FZF1	P32805	299 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BZZ1	YHR114W	GPI18	P38211	433 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BZZ1	YHR114W	SFT1	P43682	97 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BZZ1	YHR114W	CIS3	P47001	227 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BZZ1	YHR114W	MST27	P53176	234 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BZZ1	YHR114W	YDR461C-A	Q2V2P7	80 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BZZ1	YHR114W	HUG1	Q6Q5K6	68 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BZZ1	YHR114W	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
BZZ1	YHR114W	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
BZZ1	YHR114W	MLF3	P32047	452 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BZZ1	YHR114W	DSE2	P38844	325 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BZZ1	YHR114W	YGR219W	P53307	113 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BZZ1	YHR114W	HSK3	P69852	69 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BZZ1	YHR114W	COX12	Q01519	83 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BZZ1	YHR114W	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
BZZ1	YHR114W	CUP1-1	P0CX80	61 aa		4.84	□□□□□ -1.64
BZZ1	YHR114W	CUP1-2	P0CX81	61 aa		4.84	□□□□□ -1.64
BZZ1	YHR114W	DSS4	P32601	143 aa		4.84	□□□□□ -1.64
BZZ1	YHR114W	REC104	P33323	182 aa		4.84	□□□□□ -1.64
BZZ1	YHR114W	YRA2	P36036	203 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.84	□□□□□ -1.64	not detected
BZZ1	YHR114W	SRX1	P36077	127 aa		4.84	□□□□□ -1.64
BZZ1	YHR114W	SMP1	P38128	452 aa		4.84	□□□□□ -1.64
BZZ1	YHR114W	SVP26	P38869	228 aa		4.84	□□□□□ -1.64
BZZ1	YHR114W	GGC1	P38988	300 aa		4.84	□□□□□ -1.64
BZZ1	YHR114W	YAR029W	P39549	74 aa		4.84	□□□□□ -1.64
BZZ1	YHR114W	FIP1	P45976	327 aa		4.84	□□□□□ -1.64
BZZ1	YHR114W	MMS2	P53152	137 aa		4.84	□□□□□ -1.64
BZZ1	YHR114W	RXT3	Q07458	294 aa		4.84	□□□□□ -1.64
BZZ1	YHR114W	YPL038W-A	Q3E7B4	63 aa		4.84	□□□□□ -1.64
BZZ1	YHR114W	CDC39	P25655	2108 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
BZZ1	YHR114W	CSH1	P38287	376 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BZZ1	YHR114W	YHL018W	P38744	120 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
BZZ1	YHR114W	LST8	P41318	303 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BZZ1	YHR114W	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BZZ1	YHR114W	AQY1	P0CD91	305 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BZZ1	YHR114W	ATP19	P81451	68 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BZZ1	YHR114W	YMR317W	Q04893	1140 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BZZ1	YHR114W	RLM1	Q12224	676 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BZZ1	YHR114W	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BZZ1	YHR114W	YNL277W-A	Q3E7Z0	62 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BZZ1	YHR114W	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BZZ1	YHR114W	CYR1	P08678	2026 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
BZZ1	YHR114W	PBI2	P0CT04	75 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
BZZ1	YHR114W	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
BZZ1	YHR114W	IMP1	P28627	190 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BZZ1	YHR114W	PAU7	P39545	55 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BZZ1	YHR114W	RRT13	P40042	185 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BZZ1	YHR114W	YMR321C	Q04898	105 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BZZ1	YHR114W	YLR281C	Q05863	155 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BZZ1	YHR114W	SUT2	Q12286	268 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BZZ1	YHR114W	KSH1	Q8TGJ3	72 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BZZ1	YHR114W	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
BZZ1	YHR114W	MBB1	P39534	108 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BZZ1	YHR114W	YGR050C	P53231	118 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BZZ1	YHR114W	CUZ1	P53899	274 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BZZ1	YHR114W	YLR012C	Q07927	99 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BZZ1	YHR114W	YPR108W-A	Q3E7B3	70 aa		4.81	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 59.2 ms