RNA–Protein interactions for RNA: YHR081W

LRP1, Transcript of Nuclear exosome-associated nucleic acid binding protein, yeast

Gene LRP1, Length 555 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LRP1	YHR081W	GSC2	P40989	1895 aa		0.21	□□□□□ -2.38
LRP1	YHR081W	LSM8	P47093	109 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
LRP1	YHR081W	RAV2	Q03956	351 aa		0.21	□□□□□ -2.38
LRP1	YHR081W	DDP1	Q99321	188 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
LRP1	YHR081W	URA2	P07259	2214 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
LRP1	YHR081W	BLM10	P43583	2143 aa		0.2	□□□□□ -2.38
LRP1	YHR081W	FIG1	P38224	298 aa		0.2	□□□□□ -2.38
LRP1	YHR081W	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
LRP1	YHR081W	PKR1	Q03880	122 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
LRP1	YHR081W	MED11	Q99278	115 aa		0.2	□□□□□ -2.38
LRP1	YHR081W	MRPL44	P19956	98 aa		0.19	□□□□□ -2.38
LRP1	YHR081W	SPG1	P50088	95 aa		0.19	□□□□□ -2.38
LRP1	YHR081W	YOR385W	Q08909	290 aa		0.19	□□□□□ -2.38
LRP1	YHR081W	TY4B-J	P47024	1803 aa		0.18	□□□□□ -2.38
LRP1	YHR081W	YSF3	P0C074	85 aa	Predicted RBP	0.18	□□□□□ -2.38
LRP1	YHR081W	AIM4	P38305	123 aa	Predicted RBP	0.18	□□□□□ -2.38
LRP1	YHR081W	YGL149W	P53116	101 aa		0.18	□□□□□ -2.38
LRP1	YHR081W	SUI1	P32911	108 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
LRP1	YHR081W	RPS1A	P33442	255 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
LRP1	YHR081W	MRPL11	P36521	249 aa	Predicted RBP	0.17	□□□□□ -2.38
LRP1	YHR081W	RPS29B	P41058	56 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
LRP1	YHR081W	BRP1	P53194	125 aa		0.17	□□□□□ -2.38
LRP1	YHR081W	YDR366C	P87287	132 aa		0.17	□□□□□ -2.38
LRP1	YHR081W	YLR296W	Q05898	108 aa		0.17	□□□□□ -2.38
LRP1	YHR081W	PET20	Q99373	253 aa		0.17	□□□□□ -2.38
LRP1	YHR081W	BNI1	P41832	1953 aa		0.17	□□□□□ -2.38
LRP1	YHR081W	MRPL31	P14063	131 aa	Predicted RBP	0.16	□□□□□ -2.38
LRP1	YHR081W	POR2	P40478	281 aa		0.16	□□□□□ -2.38
LRP1	YHR081W	LDB18	Q07887	179 aa		0.16	□□□□□ -2.38
LRP1	YHR081W	ATP14	Q12349	124 aa		0.16	□□□□□ -2.38
LRP1	YHR081W	HAP3	P13434	144 aa		0.15	□□□□□ -2.39
LRP1	YHR081W	RME1	P32338	300 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.39
LRP1	YHR081W	MOG1	P47123	218 aa		0.15	□□□□□ -2.39
LRP1	YHR081W	GTT2	Q12390	233 aa		0.15	□□□□□ -2.39
LRP1	YHR081W	PET54	P10834	293 aa		0.14	□□□□□ -2.39
LRP1	YHR081W	YMR320W	Q04897	101 aa		0.14	□□□□□ -2.39
LRP1	YHR081W	YLR194C	Q05777	254 aa		0.14	□□□□□ -2.39
LRP1	YHR081W	SNF2	P22082	1703 aa		0.13	□□□□□ -2.39
LRP1	YHR081W	QCR10	P37299	77 aa		0.13	□□□□□ -2.39
LRP1	YHR081W	YJR128W	P47162	119 aa		0.13	□□□□□ -2.39
LRP1	YHR081W	SNT2	P53127	1403 aa		0.13	□□□□□ -2.39
LRP1	YHR081W	YRF1-3	P0CX14	1859 aa		0.12	□□□□□ -2.39
LRP1	YHR081W	YRF1-7	P0CX15	1859 aa		0.12	□□□□□ -2.39
LRP1	YHR081W	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	0.12	□□□□□ -2.39
LRP1	YHR081W	SRX1	P36077	127 aa		0.12	□□□□□ -2.39
LRP1	YHR081W	AIM18	P38884	321 aa		0.12	□□□□□ -2.39
LRP1	YHR081W	HSP10	P38910	106 aa		0.12	□□□□□ -2.39
LRP1	YHR081W	RTC6	O14464	93 aa		0.11	□□□□□ -2.39
LRP1	YHR081W	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	0.11	□□□□□ -2.39
LRP1	YHR081W	YGR039W	P53225	103 aa		0.11	□□□□□ -2.39
LRP1	YHR081W	COF1	Q03048	143 aa	Known RBP	0.11	□□□□□ -2.39
LRP1	YHR081W	FCF2	Q12035	217 aa	Predicted RBP	0.11	□□□□□ -2.39
LRP1	YHR081W	HHO1	P53551	258 aa		0.1	□□□□□ -2.39
LRP1	YHR081W	SDH7	Q04401	133 aa		0.1	□□□□□ -2.39
LRP1	YHR081W	YOR1	P53049	1477 aa		0.1	□□□□□ -2.39
LRP1	YHR081W	PAU21	P0CE86	164 aa		0.09	□□□□□ -2.4
LRP1	YHR081W	PAU22	P0CE87	164 aa		0.09	□□□□□ -2.4
LRP1	YHR081W	RPC19	P28000	142 aa	Known RBP	0.09	□□□□□ -2.4
LRP1	YHR081W	PRS3	P38689	320 aa	Known RBP	0.09	□□□□□ -2.4
LRP1	YHR081W	SPC3	Q12133	184 aa		0.09	□□□□□ -2.4
LRP1	YHR081W	RPL36B	O14455	100 aa	Known RBP	0.08	□□□□□ -2.4
LRP1	YHR081W	RPL36A	P05745	100 aa	Predicted RBP	0.08	□□□□□ -2.4
LRP1	YHR081W	YCR050C	P25630	102 aa		0.08	□□□□□ -2.4
LRP1	YHR081W	YFR035C	P43608	114 aa		0.08	□□□□□ -2.4
LRP1	YHR081W	RBL2	P48606	106 aa	Known RBP	0.08	□□□□□ -2.4
LRP1	YHR081W	ARL3	Q02804	198 aa		0.08	□□□□□ -2.4
LRP1	YHR081W	TLG1	Q03322	224 aa		0.08	□□□□□ -2.4
LRP1	YHR081W	FAS2	P19097	1887 aa	Known RBP	0.07	□□□□□ -2.4
LRP1	YHR081W	YAL064W	P39711	94 aa		0.07	□□□□□ -2.4
LRP1	YHR081W	YIL163C	P40448	117 aa		0.07	□□□□□ -2.4
LRP1	YHR081W	TY1B-H	O13535	1793 aa		0.06	□□□□□ -2.4
LRP1	YHR081W	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	0.06	□□□□□ -2.4
LRP1	YHR081W	MYO1	P08964	1928 aa		0.05	□□□□□ -2.4
LRP1	YHR081W	AUA1	P32450	94 aa		0.05	□□□□□ -2.4
LRP1	YHR081W	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	0.05	□□□□□ -2.4
LRP1	YHR081W	HPM1	P40481	377 aa		0.05	□□□□□ -2.4
LRP1	YHR081W	EFM5	P53200	248 aa	Known RBP	0.05	□□□□□ -2.4
LRP1	YHR081W	ELC1	Q03071	99 aa		0.05	□□□□□ -2.4
LRP1	YHR081W	ENV10	Q99382	181 aa		0.05	□□□□□ -2.4
LRP1	YHR081W	YEA6	P39953	335 aa		0.04	□□□□□ -2.4
LRP1	YHR081W	YGR017W	P53210	297 aa		0.04	□□□□□ -2.4
LRP1	YHR081W	SMD2	Q06217	110 aa	Known RBP	0.04	□□□□□ -2.4
LRP1	YHR081W	RPL14A	P36105	138 aa	Known RBP	0.03	□□□□□ -2.4
LRP1	YHR081W	RPL14B	P38754	138 aa	Known RBP	0.03	□□□□□ -2.4
LRP1	YHR081W	ICS3	P47034	131 aa		0.03	□□□□□ -2.4
LRP1	YHR081W	HPA2	Q06592	156 aa		0.03	□□□□□ -2.4
LRP1	YHR081W	YDR010C	Q12426	110 aa		0.03	□□□□□ -2.4
LRP1	YHR081W	OCA6	Q12454	224 aa		0.03	□□□□□ -2.4
LRP1	YHR081W	BRR2	P32639	2163 aa	Known RBP	0.02	□□□□□ -2.41
LRP1	YHR081W	MPC1	P53157	130 aa	Known RBP	0.02	□□□□□ -2.41
LRP1	YHR081W	LCL1	Q02786	101 aa		0.02	□□□□□ -2.41
LRP1	YHR081W	SEC16	P48415	2195 aa	Known RBP	0.02	□□□□□ -2.41
LRP1	YHR081W	TAO3	P40468	2376 aa		0.01	□□□□□ -2.41
LRP1	YHR081W	YGR240C-A	Q3E786	66 aa		0.01	□□□□□ -2.41
LRP1	YHR081W	RPL22A	P05749	121 aa	Known RBP	0	□□□□□ -2.41
LRP1	YHR081W	YAP3	P38749	330 aa		0	□□□□□ -2.41
LRP1	YHR081W	PHS1	P40857	217 aa		0	□□□□□ -2.41
LRP1	YHR081W	TVP18	Q04767	167 aa		0	□□□□□ -2.41
LRP1	YHR081W	YOL164W-A	Q3E7A5	60 aa		0	□□□□□ -2.41
LRP1	YHR081W	YGL041C-B	Q3E750	60 aa		-0.01	□□□□□ -2.41

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