RNA–Protein interactions for RNA: YDR457W

TOM1, Transcript of E3 ubiquitin ligase of the hect-domain class, yeast

Gene TOM1, Length 9,807 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TOM1	YDR457W	AIM4	P38305	123 aa	Predicted RBP	2.36	□□□□□ -2.03
TOM1	YDR457W	YGL230C	P53074	147 aa		2.36	□□□□□ -2.03
TOM1	YDR457W	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	2.36	□□□□□ -2.03
TOM1	YDR457W	SPG4	Q04438	115 aa		2.36	□□□□□ -2.03
TOM1	YDR457W	YOR385W	Q08909	290 aa		2.36	□□□□□ -2.03
TOM1	YDR457W	CRC1	Q12289	327 aa		2.36	□□□□□ -2.03
TOM1	YDR457W	ENV10	Q99382	181 aa		2.36	□□□□□ -2.03
TOM1	YDR457W	YDR278C	Q05612	105 aa		2.36	□□□□□ -2.03
TOM1	YDR457W	CIS3	P47001	227 aa		2.36	□□□□□ -2.03
TOM1	YDR457W	YLR236C	A0A023PZG4	107 aa		2.36	□□□□□ -2.03
TOM1	YDR457W	AIM19	P40502	157 aa		2.36	□□□□□ -2.03
TOM1	YDR457W	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	2.36	□□□□□ -2.03
TOM1	YDR457W	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	2.36	□□□□□ -2.03
TOM1	YDR457W	RPP1	P38786	293 aa		2.36	□□□□□ -2.03
TOM1	YDR457W	TVP23	P38962	199 aa		2.36	□□□□□ -2.03
TOM1	YDR457W	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	2.36	□□□□□ -2.03
TOM1	YDR457W	PRM7	Q12459	698 aa		2.36	□□□□□ -2.03
TOM1	YDR457W	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		2.36	□□□□□ -2.03
TOM1	YDR457W	DDI2	P0CH63	225 aa		2.35	□□□□□ -2.03
TOM1	YDR457W	DDI3	P0CH64	225 aa		2.35	□□□□□ -2.03
TOM1	YDR457W	NRG2	P38082	220 aa		2.35	□□□□□ -2.03
TOM1	YDR457W	PEX22	P39718	180 aa		2.35	□□□□□ -2.03
TOM1	YDR457W	TPC1	P53257	314 aa		2.35	□□□□□ -2.03
TOM1	YDR457W	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		2.35	□□□□□ -2.03
TOM1	YDR457W	FPR2	P32472	135 aa		2.35	□□□□□ -2.03
TOM1	YDR457W	YAR023C	D6VPM8	179 aa		2.35	□□□□□ -2.03
TOM1	YDR457W	YBR121C-A	P0C5L4	52 aa		2.35	□□□□□ -2.03
TOM1	YDR457W	QCR8	P08525	94 aa		2.35	□□□□□ -2.03
TOM1	YDR457W	VEL1	P53058	206 aa		2.35	□□□□□ -2.03
TOM1	YDR457W	YPL014W	Q02606	381 aa		2.35	□□□□□ -2.03
TOM1	YDR457W	FIT2	Q08906	153 aa		2.35	□□□□□ -2.03
TOM1	YDR457W	COA3	Q3E7B2	85 aa		2.35	□□□□□ -2.03
TOM1	YDR457W	ARC15	P40518	154 aa	RIP-Chip data	2.35	□□□□□ -2.03	not detected
TOM1	YDR457W	DCV1	P43595	202 aa		2.35	□□□□□ -2.03
TOM1	YDR457W	YOR314W	Q12506	109 aa		2.35	□□□□□ -2.03
TOM1	YDR457W	MIG1	P27705	504 aa		2.35	□□□□□ -2.03
TOM1	YDR457W	POR2	P40478	281 aa		2.35	□□□□□ -2.03
TOM1	YDR457W	YDR114C	Q04597	100 aa		2.35	□□□□□ -2.03
TOM1	YDR457W	VMR1	P38735	1592 aa		2.35	□□□□□ -2.03
TOM1	YDR457W	YMR141C	P40211	102 aa		2.35	□□□□□ -2.03
TOM1	YDR457W	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	2.35	□□□□□ -2.03
TOM1	YDR457W	YPR108W-A	Q3E7B3	70 aa		2.35	□□□□□ -2.03
TOM1	YDR457W	MRPL49	P40858	161 aa	Predicted RBP	2.34	□□□□□ -2.03
TOM1	YDR457W	TOM7	P53507	60 aa		2.34	□□□□□ -2.03
TOM1	YDR457W	IGO1	P53897	168 aa		2.34	□□□□□ -2.03
TOM1	YDR457W	HSP150	P32478	413 aa		2.34	□□□□□ -2.03
TOM1	YDR457W	YNL234W	P53857	426 aa		2.34	□□□□□ -2.03
TOM1	YDR457W	ECM23	Q02710	187 aa		2.34	□□□□□ -2.03
TOM1	YDR457W	PEP1	P32319	1579 aa		2.34	□□□□□ -2.03
TOM1	YDR457W	BET5	Q03630	159 aa		2.34	□□□□□ -2.03
TOM1	YDR457W	YLR285C-A	Q3E771	56 aa		2.34	□□□□□ -2.03
TOM1	YDR457W	YMR31	P19955	123 aa		2.34	□□□□□ -2.03
TOM1	YDR457W	YMR082C	Q04276	118 aa		2.34	□□□□□ -2.03
TOM1	YDR457W	YDR215C	Q12240	137 aa		2.34	□□□□□ -2.03
TOM1	YDR457W	NAG1	Q8TGN9	163 aa		2.34	□□□□□ -2.03
TOM1	YDR457W	LDB16	P25587	256 aa		2.34	□□□□□ -2.03
TOM1	YDR457W	VTC1	P40046	129 aa	RIP-Chip data	2.34	□□□□□ -2.03	not detected
TOM1	YDR457W	RPB7	P34087	171 aa		2.34	□□□□□ -2.04
TOM1	YDR457W	YSY6	P38374	65 aa		2.34	□□□□□ -2.04
TOM1	YDR457W	YNL195C	P40168	261 aa		2.34	□□□□□ -2.04
TOM1	YDR457W	YIR021W-A	Q3E739	70 aa		2.34	□□□□□ -2.04
TOM1	YDR457W	HUB1	Q6Q546	73 aa		2.34	□□□□□ -2.04
TOM1	YDR457W	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	2.34	□□□□□ -2.04
TOM1	YDR457W	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	2.34	□□□□□ -2.04
TOM1	YDR457W	RPA12	P32529	125 aa	Known RBP	2.34	□□□□□ -2.04
TOM1	YDR457W	SMP1	P38128	452 aa		2.34	□□□□□ -2.04
TOM1	YDR457W	YLR342W-A	Q3E810	57 aa		2.34	□□□□□ -2.04
TOM1	YDR457W	YOR020W-A	Q3E824	90 aa		2.34	□□□□□ -2.04
TOM1	YDR457W	CCW14	O13547	238 aa		2.34	□□□□□ -2.04
TOM1	YDR457W	STF2	P16965	84 aa		2.33	□□□□□ -2.04
TOM1	YDR457W	MID2	P36027	376 aa		2.33	□□□□□ -2.04
TOM1	YDR457W	LST8	P41318	303 aa		2.33	□□□□□ -2.04
TOM1	YDR457W	YGL149W	P53116	101 aa		2.33	□□□□□ -2.04
TOM1	YDR457W	GAT3	Q07928	141 aa		2.33	□□□□□ -2.04
TOM1	YDR457W	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	2.33	□□□□□ -2.04
TOM1	YDR457W	EDC2	P40023	145 aa	Predicted RBP	2.33	□□□□□ -2.04
TOM1	YDR457W	SBH2	P52871	88 aa		2.33	□□□□□ -2.04
TOM1	YDR457W	VPS71	Q03433	280 aa		2.33	□□□□□ -2.04
TOM1	YDR457W	OST5	Q92316	86 aa		2.33	□□□□□ -2.04
TOM1	YDR457W	QRI5	P32344	111 aa		2.33	□□□□□ -2.04
TOM1	YDR457W	RML2	P32611	393 aa		2.33	□□□□□ -2.04
TOM1	YDR457W	YMR103C	Q04436	120 aa		2.33	□□□□□ -2.04
TOM1	YDR457W	ESC1	Q03661	1658 aa	Known RBP	2.33	□□□□□ -2.04
TOM1	YDR457W	YJR107C-A	P0CT86	78 aa		2.33	□□□□□ -2.04
TOM1	YDR457W	PIR5	P46999	287 aa		2.33	□□□□□ -2.04
TOM1	YDR457W	SCW10	Q04951	389 aa		2.33	□□□□□ -2.04
TOM1	YDR457W	ROX3	P25046	220 aa		2.33	□□□□□ -2.04
TOM1	YDR457W	YAR029W	P39549	74 aa		2.33	□□□□□ -2.04
TOM1	YDR457W	RRT13	P40042	185 aa		2.32	□□□□□ -2.04
TOM1	YDR457W	YGR219W	P53307	113 aa		2.32	□□□□□ -2.04
TOM1	YDR457W	PRM5	P40476	318 aa		2.32	□□□□□ -2.04
TOM1	YDR457W	CCW12	Q12127	133 aa		2.32	□□□□□ -2.04
TOM1	YDR457W	BSC1	Q12140	328 aa		2.32	□□□□□ -2.04
TOM1	YDR457W	ATP20	Q12233	115 aa		2.32	□□□□□ -2.04
TOM1	YDR457W	YOR343C	Q12484	108 aa		2.32	□□□□□ -2.04
TOM1	YDR457W	RPL39	P04650	51 aa		2.32	□□□□□ -2.04
TOM1	YDR457W	ATP15	P21306	62 aa		2.32	□□□□□ -2.04
TOM1	YDR457W	FLO10	P36170	1169 aa		2.32	□□□□□ -2.04
TOM1	YDR457W	NRM1	P53718	249 aa		2.32	□□□□□ -2.04
TOM1	YDR457W	MLF3	P32047	452 aa		2.32	□□□□□ -2.04

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