RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520746.1

HDAC2-208, Transcript of histone deacetylase 2, human

TSL 3

Gene HDAC2, Length 497 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC2-208	ENST00000520746	ADAM21	Q9UKJ8	722 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HDAC2-208	ENST00000520746	SLC45A2	Q9UMX9	530 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HDAC2-208	ENST00000520746	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HDAC2-208	ENST00000520746	WNT6	Q9Y6F9	365 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HDAC2-208	ENST00000520746	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746		A0A088AWK7	358 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	FAM227A	F5H4B4	570 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	FCER1A	P12319	257 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	HOXB6	P17509	224 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	SOX10	P56693	466 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	CCDC181	Q5TID7	509 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	CCDC149	Q6ZUS6	474 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	ZNF365	Q70YC5	407 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	LPIN2	Q92539	896 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	TMEM125	Q96AQ2	219 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	NT5C1B	Q96P26	610 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	SHROOM2	Q13796	1616 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	MAPKBP1	O60336	1514 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	KIF27	Q86VH2	1401 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746		A0A1W2PS29	197 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	CAPN8	A6NHC0	703 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	ADM5	C9JUS6	153 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	PRC1	O43663	620 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	GJB1	P08034	283 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	AGFG1	P52594	562 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	GPSM2	P81274	684 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	MTX3	Q5HYI7	312 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	FAM156A	Q8NDB6	213 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	SLC30A5	Q8TAD4	765 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	INTS13	Q9NVM9	706 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	CFAP97	Q9P2B7	532 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	DIP2B	Q9P265	1576 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746		A0A1W2PPL8	197 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	CFAP69	A5D8W1	941 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	LINC00473	A8K010	186 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	ZNF785	A8K8V0	405 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	TPP1	O14773	563 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	HDC	P19113	662 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	GNAL	P38405	381 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	KCNJ5	P48544	419 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	SOX8	P57073	446 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	KIF22	Q14807	665 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	TXNRD1	Q16881	649 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	TMIE	Q8NEW7	156 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	WASF1	Q92558	559 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	KLHL32	Q96NJ5	620 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	ZMAT3	Q9HA38	289 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	VSX1	Q9NZR4	365 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	L1RE1	Q9UN81	338 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	TOP2B	Q02880	1626 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	UACA	Q9BZF9	1416 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	PRAMEF33	A0A0G2JMD5	474 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	LINC01548	A6NM66	108 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	PRAMEF10	O60809	474 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	CAND2	O75155	1236 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	ZBED1	O96006	694 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	ANXA1	P04083	346 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	GNAI2	P04899	355 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	IGKV2-30	P06310	120 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	PRR35	P0CG20	571 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	KIT	P10721	976 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	GATA3	P23771	443 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	PTGER1	P34995	402 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	CACNB3	P54284	484 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	TBX4	P57082	545 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	TFF2	Q03403	129 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HDAC2-208	ENST00000520746	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68

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