RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469529.6

TRAF4-208, Transcript of TNF receptor associated factor 4, human

TSL 2

Gene TRAF4, Length 788 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAF4-208	ENST00000469529	FUT10	Q6P4F1	479 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	PAQR9	Q6ZVX9	377 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	SLFN11	Q7Z7L1	901 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	ERICH1	Q86X53	443 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	FUK	Q8N0W3	1084 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	C12orf29	Q8N999	325 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	MSANTD4	Q8NCY6	345 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	TRIM58	Q8NG06	486 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	CPA5	Q8WXQ8	436 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	KCTD13	Q8WZ19	329 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	RABGGTA	Q92696	567 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF558	Q96NG5	402 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	SYT15	Q9BQS2	421 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	DUSP16	Q9BY84	665 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	LZTFL1	Q9NQ48	299 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	CRTAC1	Q9NQ79	661 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	AAAS	Q9NRG9	546 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	SEPT11	Q9NVA2	429 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	ADAM22	Q9P0K1	906 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	HESX1	Q9UBX0	185 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	SALL4	Q9UJQ4	1053 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	STRIP2	Q9ULQ0	834 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	SCN5A	Q14524	2016 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	TCRBV5S1A1T	A0A578	114 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529		F8W810	466 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529		H7C4K7	107 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	LINC00271	P0C7V0	271 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	PPM1A	P35813	382 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	SCNN1A	P37088	669 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	BCAT1	P54687	386 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	USP41	Q3LFD5	358 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	LIN9	Q5TKA1	542 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	TTC30A	Q86WT1	665 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	ZDHHC17	Q8IUH5	632 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC35G2	Q8TBE7	412 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	C18orf8	Q96DM3	657 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	13.49	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	THAP2	Q9H0W7	228 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	CSNK1G1	Q9HCP0	422 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	MRPL47	Q9HD33	250 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	SPG21	Q9NZD8	308 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	GUCA1B	Q9UMX6	200 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	PRG3	Q9Y2Y8	225 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	BACE2	Q9Y5Z0	518 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	COL4A6	Q14031	1691 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	MYBPHL	A2RUH7	354 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529		I3L4J1	428 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	TNNT1	P13805	278 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	ACADSB	P45954	432 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	PLA2G4A	P47712	749 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC8A3	P57103	927 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	TSPY1	Q01534	308 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	TAP1	Q03518	808 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	BST2	Q10589	180 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	ORC1	Q13415	861 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	VARS2	Q5ST30	1063 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	ARC	Q7LC44	396 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC2A14	Q8TDB8	520 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	YME1L1	Q96TA2	773 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	ABCB6	Q9NP58	842 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	PNPLA8	Q9NP80	782 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	PARVA	Q9NVD7	372 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	CYTH4	Q9UIA0	394 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	MAFF	Q9ULX9	164 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	MICAL3	Q7RTP6	2002 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	SIGLEC16	A6NMB1	481 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	ZBBX	A8MT70	800 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	TMCO5B	A8MYB1	307 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529		M0QYV0	167 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	XPO1	O14980	1071 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	ATP2C2	O75185	946 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	SOD2	P04179	222 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	PRLR	P16471	622 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TRAF4-208	ENST00000469529	GNG11	P61952	73 aa		13.47	□□□□□ -0.25

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