RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428585.5

CARF-208, Transcript of calcium responsive transcription factor, human

TSL 2 BASIC

Gene CARF, Length 2,513 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CARF-208	ENST00000428585	SERPINF1	P36955	418 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CARF-208	ENST00000428585	IL12RB1	P42701	662 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CARF-208	ENST00000428585	SEPHS1	P49903	392 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CARF-208	ENST00000428585	TPM4	P67936	248 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CARF-208	ENST00000428585	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CARF-208	ENST00000428585	ANKRD39	Q53RE8	183 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CARF-208	ENST00000428585	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CARF-208	ENST00000428585	MCTP1	Q6DN14	999 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CARF-208	ENST00000428585	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CARF-208	ENST00000428585	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CARF-208	ENST00000428585	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CARF-208	ENST00000428585	CREG2	Q8IUH2	290 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CARF-208	ENST00000428585	TMEM105	Q8N8V8	129 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CARF-208	ENST00000428585	ZNF610	Q8N9Z0	462 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CARF-208	ENST00000428585	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CARF-208	ENST00000428585	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CARF-208	ENST00000428585	STON2	Q8WXE9	905 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CARF-208	ENST00000428585	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CARF-208	ENST00000428585	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CARF-208	ENST00000428585	CNDP2	Q96KP4	475 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CARF-208	ENST00000428585	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CARF-208	ENST00000428585	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CARF-208	ENST00000428585	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CARF-208	ENST00000428585	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CARF-208	ENST00000428585	MTF2	Q9Y483	593 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CARF-208	ENST00000428585	FHOD1	Q9Y613	1164 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CARF-208	ENST00000428585	ZFP37	Q9Y6Q3	630 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CARF-208	ENST00000428585	DNAH14	Q0VDD8	3507 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CARF-208	ENST00000428585	MYO15A	Q9UKN7	3530 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CARF-208	ENST00000428585	FIGNL2	A6NMB9	653 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CARF-208	ENST00000428585	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CARF-208	ENST00000428585	KDM1A	O60341	852 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CARF-208	ENST00000428585	FSBP	O95073	299 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CARF-208	ENST00000428585	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.61
CARF-208	ENST00000428585	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.61
CARF-208	ENST00000428585	HNF4A	P41235	474 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CARF-208	ENST00000428585	ECI1	P42126	302 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CARF-208	ENST00000428585	CLCN2	P51788	898 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CARF-208	ENST00000428585	CASP6	P55212	293 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CARF-208	ENST00000428585	ARF3	P61204	181 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.61
CARF-208	ENST00000428585	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
CARF-208	ENST00000428585	PROSER3	Q2NL68	480 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CARF-208	ENST00000428585	SETMAR	Q53H47	684 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.61
CARF-208	ENST00000428585	KAZN	Q674X7	775 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CARF-208	ENST00000428585	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CARF-208	ENST00000428585	RAPH1	Q70E73	1250 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CARF-208	ENST00000428585	MOGAT3	Q86VF5	341 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CARF-208	ENST00000428585	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CARF-208	ENST00000428585	AVL9	Q8NBF6	648 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CARF-208	ENST00000428585	CCDC112	Q8NEF3	446 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CARF-208	ENST00000428585	PCDH19	Q8TAB3	1148 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CARF-208	ENST00000428585	RUBCN	Q92622	972 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CARF-208	ENST00000428585	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CARF-208	ENST00000428585	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
CARF-208	ENST00000428585	CEP95	Q96GE4	821 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CARF-208	ENST00000428585	ACAP3	Q96P50	834 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CARF-208	ENST00000428585	SLX1A	Q9BQ83	275 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CARF-208	ENST00000428585	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.61
CARF-208	ENST00000428585	SIL1	Q9H173	461 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CARF-208	ENST00000428585	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CARF-208	ENST00000428585	PYCARD	Q9ULZ3	195 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CARF-208	ENST00000428585	PRR5-ARHGAP8	B1AHC4	643 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CARF-208	ENST00000428585	SGSM2	O43147	1006 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CARF-208	ENST00000428585	SIAH2	O43255	324 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CARF-208	ENST00000428585	IL18RAP	O95256	599 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CARF-208	ENST00000428585	HOXC6	P09630	235 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CARF-208	ENST00000428585	IL1R1	P14778	569 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CARF-208	ENST00000428585	CTSS	P25774	331 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CARF-208	ENST00000428585	ATP5D	P30049	168 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CARF-208	ENST00000428585	RNF144A	P50876	292 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CARF-208	ENST00000428585	EVC	P57679	992 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CARF-208	ENST00000428585	GPR85	P60893	370 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CARF-208	ENST00000428585	ARHGAP8	P85298	464 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CARF-208	ENST00000428585	SHC2	P98077	582 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CARF-208	ENST00000428585	IFT88	Q13099	833 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CARF-208	ENST00000428585	DAG1	Q14118	895 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CARF-208	ENST00000428585	EFR3A	Q14156	821 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CARF-208	ENST00000428585	TIGD6	Q17RP2	521 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CARF-208	ENST00000428585	TIGD5	Q53EQ6	642 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CARF-208	ENST00000428585	KRTCAP3	Q53RY4	240 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CARF-208	ENST00000428585	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CARF-208	ENST00000428585	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CARF-208	ENST00000428585	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CARF-208	ENST00000428585	VN1R5	Q7Z5H4	357 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CARF-208	ENST00000428585	WDR63	Q8IWG1	891 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CARF-208	ENST00000428585	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CARF-208	ENST00000428585	ZNF687	Q8N1G0	1237 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CARF-208	ENST00000428585	RNF214	Q8ND24	703 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CARF-208	ENST00000428585	TOR1AIP2	Q8NFQ8	470 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CARF-208	ENST00000428585	PUM2	Q8TB72	1066 aa	Known RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62
CARF-208	ENST00000428585	SPATA18	Q8TC71	538 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CARF-208	ENST00000428585	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CARF-208	ENST00000428585	FNIP1	Q8TF40	1166 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CARF-208	ENST00000428585	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CARF-208	ENST00000428585	SLC2A13	Q96QE2	648 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CARF-208	ENST00000428585	YME1L1	Q96TA2	773 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CARF-208	ENST00000428585	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CARF-208	ENST00000428585	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CARF-208	ENST00000428585	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CARF-208	ENST00000428585	RABL2A	Q9UBK7	228 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62

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