RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317201.6

HOXA3-201, Transcript of homeobox A3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene HOXA3, Length 2,761 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3-201ENST00000317201 HELQQ8TDG4 1101 aa15.51■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 TAS1R2Q8TE23 839 aa15.51■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 SHC3Q92529 594 aa15.51■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 ZNF516Q92618 1163 aa15.51■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP15.51■□□□□ 0.079e-9■■■■■ 36.7
HOXA3-201ENST00000317201 CFHR5Q9BXR6 569 aa15.51■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 PCDH18Q9HCL0 1135 aa15.51■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 NAGPAQ9UK23 515 aa15.51■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 DOCK3Q8IZD9 2030 aa15.51■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 AKR1A1P14550 325 aa15.51■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 IFNAR2P48551 515 aa15.51■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 NKX3-2P78367 333 aa15.51■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 FAM71AQ8IYT1 594 aa15.51■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 CYP4X1Q8N118 509 aa15.51■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa15.51■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 KATNAL1Q9BW62 490 aa15.51■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 MAGEA13PA6NCF6 341 aa15.5■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa15.5■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 TACC1O75410 805 aa15.5■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 ZCCHC18P0CG32 403 aa15.5■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 PYGMP11217 842 aa15.5■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 CD302Q8IX05 232 aa15.5■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 SNX12Q9UMY4 172 aa15.5■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 AKT3Q9Y243 479 aa15.5■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa15.5■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 MCF2P10911 925 aa15.5■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 TNNI1P19237 187 aa15.5■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 CTGFP29279 349 aa15.5■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 AMHR2Q16671 573 aa15.5■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa15.5■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 OLIG1Q8TAK6 271 aa15.5■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 SELENOSQ9BQE4 189 aa15.5■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 TCHPQ9BT92 498 aa15.5■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 SAMD15Q9P1V8 674 aa15.5■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 TTLL13PA6NNM8 815 aa15.49■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 KRT38O76015 456 aa15.49■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa15.49■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa15.49■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 NFKBIAP25963 317 aa15.49■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 VARSP26640 1264 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 GBP1P32455 592 aa15.49■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 HSD17B3P37058 310 aa15.49■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 ZNF844Q08AG5 666 aa15.49■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 MFSD10Q14728 455 aa15.49■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 WDR60Q8WVS4 1066 aa15.49■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 ZIC5Q96T25 663 aa15.49■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 IL18RAPO95256 599 aa15.49■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 GJB1P08034 283 aa15.49■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 ADAM17P78536 824 aa15.49■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 ARHGAP44Q17R89 818 aa15.49■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 WDR44Q5JSH3 913 aa15.49■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 MFSD14CQ5VZR4 134 aa15.49■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 KREMEN1Q96MU8 473 aa15.49■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 NOX5Q96PH1 765 aa15.49■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 MINDY3Q9H8M7 445 aa15.49■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 HSFX1Q9UBD0 423 aa15.49■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 RABL2BQ9UNT1 228 aa15.49■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 A0A087WZ62 844 aa15.48■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa15.48■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP15.48■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 KIAA0753Q2KHM9 967 aa15.48■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa15.48■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa15.48■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 TMEM53Q6P2H8 277 aa15.48■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 PFDN4Q9NQP4 134 aa15.48■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 C1orf112Q9NSG2 853 aa15.48■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 SH3GLB1Q9Y371 365 aa15.48■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 GMEB1Q9Y692 573 aa15.48■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa15.48■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa15.48■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 EVPLQ92817 2033 aa15.48■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 B4GALT4O60513 344 aa15.48■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 CYBAP13498 195 aa15.48■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 HOXC8P31273 242 aa15.48■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 PSEN2P49810 448 aa15.48■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 PDE6CP51160 858 aa15.48■□□□□ 0.07
HOXA3-201ENST00000317201 ZNF568Q3ZCX4 644 aa15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 90.8 ms