RNA–Protein interactions for RNA: YOL011W

PLB3, Transcript of Phospholipase B (lysophospholipase) involved in lipid metabolism, yeast

Gene PLB3, Length 2,061 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PLB3	YOL011W	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PLB3	YOL011W	YLR146W-A	Q2V2P1	62 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PLB3	YOL011W	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PLB3	YOL011W	DDI2	P0CH63	225 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PLB3	YOL011W	DDI3	P0CH64	225 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PLB3	YOL011W	LSM2	P38203	95 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PLB3	YOL011W	MRPS16	Q02608	121 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PLB3	YOL011W	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
PLB3	YOL011W	ARR3	Q06598	404 aa		4.96	□□□□□ -1.61
PLB3	YOL011W	PRR2	Q12310	699 aa		4.96	□□□□□ -1.61
PLB3	YOL011W	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		4.96	□□□□□ -1.61
PLB3	YOL011W	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PLB3	YOL011W	YHR022C	P38763	256 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PLB3	YOL011W	ERV2	Q12284	196 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PLB3	YOL011W	YDR157W	A0A023PZE8	133 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PLB3	YOL011W	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PLB3	YOL011W	NPL6	P32832	435 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PLB3	YOL011W	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PLB3	YOL011W	SAL1	D6W196	494 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PLB3	YOL011W	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PLB3	YOL011W	VHS2	P40463	436 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PLB3	YOL011W	YJR096W	P47137	282 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PLB3	YOL011W	CTR3	Q06686	241 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PLB3	YOL011W	HMX1	P32339	317 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PLB3	YOL011W	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PLB3	YOL011W	SNO1	Q03144	224 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PLB3	YOL011W	MBB1	P39534	108 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PLB3	YOL011W	DID2	P69771	204 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PLB3	YOL011W	YPR195C	Q06594	109 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PLB3	YOL011W	LSO2	Q3E772	92 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PLB3	YOL011W	YBL059W	P34224	193 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PLB3	YOL011W	DER1	P38307	211 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PLB3	YOL011W	YML108W	Q03759	105 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PLB3	YOL011W	YLR125W	Q12138	136 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PLB3	YOL011W	RPB3	P16370	318 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PLB3	YOL011W	YMR007W	Q03675	126 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PLB3	YOL011W	YDL242W	Q07746	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PLB3	YOL011W	QCR9	P22289	66 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PLB3	YOL011W	YEA4	P40004	342 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PLB3	YOL011W	MRX11	Q03079	207 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PLB3	YOL011W	TMA23	Q03525	211 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PLB3	YOL011W	GCN3	P14741	305 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PLB3	YOL011W	MRPL4	P36517	319 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PLB3	YOL011W	IRC22	P40006	225 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PLB3	YOL011W	YGL117W	P53133	265 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PLB3	YOL011W	CRC1	Q12289	327 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PLB3	YOL011W	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PLB3	YOL011W	HSP12	P22943	109 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PLB3	YOL011W	ATX2	Q12067	313 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PLB3	YOL011W	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PLB3	YOL011W	ANB1	P19211	157 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLB3	YOL011W	SPI1	P40092	148 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLB3	YOL011W	YPS5	P53057	165 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLB3	YOL011W	FIT2	Q08906	153 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLB3	YOL011W	YGR240C-A	Q3E786	66 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLB3	YOL011W	VAR1	P02381	398 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLB3	YOL011W	SPC1	P46965	94 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLB3	YOL011W	YOL085C	Q99345	113 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLB3	YOL011W	CPT1	P17898	393 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLB3	YOL011W	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PLB3	YOL011W	ELF1	P36053	145 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLB3	YOL011W	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PLB3	YOL011W	ATC1	Q04005	294 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLB3	YOL011W	AVO2	Q04749	426 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLB3	YOL011W	AHT1	P29589	182 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PLB3	YOL011W	COA4	Q05809	96 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PLB3	YOL011W	MRS1	P07266	363 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PLB3	YOL011W	CDC50	P25656	391 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PLB3	YOL011W	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PLB3	YOL011W	FCF2	Q12035	217 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PLB3	YOL011W	SPO13	P23624	291 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PLB3	YOL011W	DSK2	P48510	373 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PLB3	YOL011W	MRPL50	P53724	139 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PLB3	YOL011W	YMR253C	Q04835	414 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PLB3	YOL011W	LCL2	Q08045	131 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PLB3	YOL011W	YLR302C	O13544	120 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PLB3	YOL011W	HTB2	P02294	131 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PLB3	YOL011W	ACB1	P31787	87 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PLB3	YOL011W	YCH1	P42937	148 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PLB3	YOL011W	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PLB3	YOL011W	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	not detected
PLB3	YOL011W	Q0255	P03881	472 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PLB3	YOL011W	TOM7	P53507	60 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PLB3	YOL011W	YNR066C	P53752	436 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PLB3	YOL011W	CUP2	P15315	225 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PLB3	YOL011W	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PLB3	YOL011W	ATP23	P53722	227 aa		4.84	□□□□□ -1.64
PLB3	YOL011W	YDR366C	P87287	132 aa		4.84	□□□□□ -1.64
PLB3	YOL011W	COQ3	P27680	312 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PLB3	YOL011W	RRT13	P40042	185 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PLB3	YOL011W	KEG1	P43614	200 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PLB3	YOL011W	CAF40	P53829	373 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PLB3	YOL011W	GIM5	Q04493	163 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PLB3	YOL011W	POP7	P38291	140 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PLB3	YOL011W	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PLB3	YOL011W	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PLB3	YOL011W	PBA1	Q05778	276 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PLB3	YOL011W	YPL229W	Q99395	206 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PLB3	YOL011W	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PLB3	YOL011W	TRS20	P38334	175 aa		4.81	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 29.3 ms