RNA–Protein interactions for RNA: YKL195W

MIA40, Transcript of Mitochondrial oxidoreductase, yeast

Gene MIA40, Length 1,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MIA40	YKL195W	YGR018C	P53211	109 aa		5.29	□□□□□ -1.56
MIA40	YKL195W	YNL234W	P53857	426 aa		5.29	□□□□□ -1.56
MIA40	YKL195W	MRX11	Q03079	207 aa		5.29	□□□□□ -1.56
MIA40	YKL195W	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	5.29	□□□□□ -1.56
MIA40	YKL195W	TMC1	Q08422	150 aa	Predicted RBP	5.29	□□□□□ -1.56
MIA40	YKL195W	FIT2	Q08906	153 aa		5.29	□□□□□ -1.56
MIA40	YKL195W	FCY1	Q12178	158 aa		5.29	□□□□□ -1.56
MIA40	YKL195W	RKI1	Q12189	258 aa		5.29	□□□□□ -1.56
MIA40	YKL195W	SPO24	Q3E752	67 aa		5.29	□□□□□ -1.56
MIA40	YKL195W	YCL001W-B	Q96VH2	84 aa		5.29	□□□□□ -1.56
MIA40	YKL195W	YIR020C	P40575	100 aa		5.28	□□□□□ -1.56
MIA40	YKL195W	YJL213W	P40896	331 aa		5.28	□□□□□ -1.56
MIA40	YKL195W	YJL163C	P46996	555 aa		5.28	□□□□□ -1.56
MIA40	YKL195W	SEN15	Q04675	128 aa		5.28	□□□□□ -1.56
MIA40	YKL195W	TMA17	Q12513	150 aa		5.28	□□□□□ -1.56
MIA40	YKL195W	COA6	Q3E846	104 aa		5.28	□□□□□ -1.56
MIA40	YKL195W	COX2	P00410	251 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MIA40	YKL195W	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
MIA40	YKL195W	QRI5	P32344	111 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MIA40	YKL195W	TIR2	P33890	251 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MIA40	YKL195W	LSM2	P38203	95 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
MIA40	YKL195W	SRP14	P38985	146 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MIA40	YKL195W	HUA1	P40325	198 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MIA40	YKL195W	CPD1	P53314	239 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MIA40	YKL195W	TOM7	P53507	60 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MIA40	YKL195W	YNL092W	P53934	400 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MIA40	YKL195W	AYT1	Q12226	474 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MIA40	YKL195W	CUP2	P15315	225 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MIA40	YKL195W	MRPL38	P35996	138 aa	Predicted RBP	5.26	□□□□□ -1.57
MIA40	YKL195W	MRPL11	P36521	249 aa	Predicted RBP	5.26	□□□□□ -1.57
MIA40	YKL195W	YBR090C	P38253	122 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MIA40	YKL195W	HST4	P53688	370 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MIA40	YKL195W	RAV2	Q03956	351 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MIA40	YKL195W	YIL134C-A	Q45U18	67 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MIA40	YKL195W	MRS1	P07266	363 aa		5.25	□□□□□ -1.57
MIA40	YKL195W	DDI2	P0CH63	225 aa		5.25	□□□□□ -1.57
MIA40	YKL195W	DDI3	P0CH64	225 aa		5.25	□□□□□ -1.57
MIA40	YKL195W	HMRA1	P0CY11	126 aa		5.25	□□□□□ -1.57
MIA40	YKL195W	PAM17	P36147	197 aa		5.25	□□□□□ -1.57
MIA40	YKL195W	YPT10	P38146	199 aa		5.25	□□□□□ -1.57
MIA40	YKL195W	YIL012W	P40551	113 aa		5.25	□□□□□ -1.57
MIA40	YKL195W	BNA1	P47096	177 aa		5.25	□□□□□ -1.57
MIA40	YKL195W	OST3	P48439	350 aa		5.25	□□□□□ -1.57
MIA40	YKL195W	YDL183C	P48569	320 aa		5.25	□□□□□ -1.57
MIA40	YKL195W	OCA2	P53949	197 aa		5.25	□□□□□ -1.57
MIA40	YKL195W	ATP19	P81451	68 aa		5.25	□□□□□ -1.57
MIA40	YKL195W	YPS1	P32329	569 aa		5.24	□□□□□ -1.57
MIA40	YKL195W	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
MIA40	YKL195W	ABM1	P47146	123 aa		5.24	□□□□□ -1.57
MIA40	YKL195W	ERV14	P53173	138 aa		5.24	□□□□□ -1.57
MIA40	YKL195W	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
MIA40	YKL195W	GIM5	Q04493	163 aa		5.24	□□□□□ -1.57
MIA40	YKL195W	ATX2	Q12067	313 aa		5.24	□□□□□ -1.57
MIA40	YKL195W	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
MIA40	YKL195W	RPS22B	Q3E7Y3	130 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
MIA40	YKL195W	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
MIA40	YKL195W	YHR213W	P0CI67	198 aa		5.23	□□□□□ -1.57
MIA40	YKL195W	TIR1	P10863	254 aa		5.23	□□□□□ -1.57
MIA40	YKL195W	FUN14	P18411	198 aa		5.23	□□□□□ -1.57
MIA40	YKL195W	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
MIA40	YKL195W	MIX23	P38162	196 aa		5.23	□□□□□ -1.57
MIA40	YKL195W	YIL077C	P40508	320 aa		5.23	□□□□□ -1.57
MIA40	YKL195W	TDA4	P47153	279 aa		5.23	□□□□□ -1.57
MIA40	YKL195W	COX18	P53239	316 aa		5.23	□□□□□ -1.57
MIA40	YKL195W	UBC7	Q02159	165 aa		5.23	□□□□□ -1.57
MIA40	YKL195W	IRC23	Q08416	157 aa		5.23	□□□□□ -1.57
MIA40	YKL195W	DAD1	Q12248	94 aa		5.23	□□□□□ -1.57
MIA40	YKL195W	HTB2	P02294	131 aa		5.22	□□□□□ -1.57
MIA40	YKL195W	VMA11	P32842	164 aa		5.22	□□□□□ -1.57
MIA40	YKL195W	AME1	P38313	324 aa		5.22	□□□□□ -1.57
MIA40	YKL195W	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
MIA40	YKL195W	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
MIA40	YKL195W	DAD4	P69851	72 aa		5.22	□□□□□ -1.57
MIA40	YKL195W	TRI1	Q05024	226 aa		5.22	□□□□□ -1.57
MIA40	YKL195W	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
MIA40	YKL195W	WIP1	Q2V2P8	89 aa		5.22	□□□□□ -1.57
MIA40	YKL195W	PRP8	P33334	2413 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
MIA40	YKL195W	MRPL44	P19956	98 aa		5.21	□□□□□ -1.58
MIA40	YKL195W	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
MIA40	YKL195W	FZF1	P32805	299 aa		5.21	□□□□□ -1.58
MIA40	YKL195W	MBB1	P39534	108 aa		5.21	□□□□□ -1.58
MIA40	YKL195W	YFR045W	P43617	309 aa		5.21	□□□□□ -1.58
MIA40	YKL195W	YMR166C	Q03829	368 aa		5.21	□□□□□ -1.58
MIA40	YKL195W	CSM4	Q08955	156 aa		5.21	□□□□□ -1.58
MIA40	YKL195W	POM33	Q12164	279 aa		5.21	□□□□□ -1.58
MIA40	YKL195W	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
MIA40	YKL195W	YCR024C-B	Q3E7Z8	88 aa		5.21	□□□□□ -1.58
MIA40	YKL195W	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		5.21	□□□□□ -1.58
MIA40	YKL195W	SDS23	P53172	527 aa		5.2	□□□□□ -1.58
MIA40	YKL195W	DUG3	P53871	357 aa		5.2	□□□□□ -1.58
MIA40	YKL195W	CYC3	P06182	269 aa		5.19	□□□□□ -1.58
MIA40	YKL195W	YER190C-B	P0CX94	160 aa		5.19	□□□□□ -1.58
MIA40	YKL195W	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		5.19	□□□□□ -1.58
MIA40	YKL195W	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		5.19	□□□□□ -1.58
MIA40	YKL195W	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		5.19	□□□□□ -1.58
MIA40	YKL195W	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		5.19	□□□□□ -1.58
MIA40	YKL195W	MRPL31	P14063	131 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
MIA40	YKL195W	SCM4	P32564	187 aa		5.19	□□□□□ -1.58
MIA40	YKL195W	ZRT1	P32804	376 aa		5.19	□□□□□ -1.58
MIA40	YKL195W	PAU7	P39545	55 aa		5.19	□□□□□ -1.58

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