RNA–Protein interactions for RNA: YGL197W

MDS3, Transcript of Putative component of the TOR regulatory pathway, yeast

Gene MDS3, Length 4,464 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MDS3	YGL197W	RGM1	Q00453	211 aa		0.99	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	AIM36	Q03798	255 aa		0.99	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	0.99	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	SCP1	Q08873	200 aa		0.99	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	FCY1	Q12178	158 aa		0.99	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	RHO1	P06780	209 aa	Known RBP	0.99	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	SGA1	P08019	549 aa		0.99	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	ERD2	P18414	219 aa		0.99	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	MRPL44	P19956	98 aa		0.99	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	MXR2	P25566	168 aa		0.99	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	OCH1	P31755	480 aa		0.99	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	YPL073C	P40323	161 aa		0.99	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	YIL102C	P40488	101 aa		0.99	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	EMC5	P40540	141 aa		0.99	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	TTI2	P47168	421 aa		0.99	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	YGR050C	P53231	118 aa		0.99	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	EST3	Q03096	181 aa		0.99	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	YOR072W	Q08486	104 aa		0.99	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	YPR202W	Q08993	238 aa		0.99	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	SPO24	Q3E752	67 aa		0.99	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	HSP30	P25619	332 aa		0.99	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	0.99	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	0.99	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	MIC12	P38341	106 aa		0.99	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	NSA2	P40078	261 aa	Known RBP	0.99	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	YER135C	P40082	130 aa		0.99	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	YER181C	P40097	107 aa		0.99	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	YNL194C	P40169	301 aa		0.99	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	0.99	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	SOL1	P50278	321 aa		0.99	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	GEP7	P53171	287 aa		0.99	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	PEX31	P53203	462 aa		0.99	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	YNL184C	P53876	108 aa		0.99	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	VBA1	Q04301	562 aa		0.99	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	PSF1	Q12488	208 aa		0.99	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	SEC59	P20048	519 aa		0.99	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	0.99	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	UMP1	P38293	148 aa		0.99	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	CAT5	P41735	233 aa		0.99	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	GNA1	P43577	159 aa	Predicted RBP	0.99	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	CIS3	P47001	227 aa		0.99	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	0.99	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	TMA23	Q03525	211 aa		0.99	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	OST6	Q03723	332 aa		0.99	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	YMR090W	Q04304	227 aa	Known RBP	0.99	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	EMI1	Q04406	187 aa		0.99	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	RAF1	Q06891	181 aa		0.99	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	0.99	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	HUT1	Q12520	339 aa		0.99	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	COA3	Q3E7B2	85 aa		0.99	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	YAL067W-A	Q8TGK6	75 aa		0.99	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	ODC2	Q99297	307 aa		0.99	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	YPR117W	Q06116	2489 aa		0.98	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	REP2	P03872	296 aa		0.98	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	AIM18	P38884	321 aa		0.98	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	RPL33B	P41056	107 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	ERJ5	P43613	295 aa	Predicted RBP	0.98	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	ARP3	P47117	449 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	YIP3	P53633	176 aa		0.98	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	YML096W	Q04489	525 aa		0.98	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	ATG39	Q06159	398 aa		0.98	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	ATG10	Q07879	167 aa		0.98	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	POM33	Q12164	279 aa		0.98	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	YOR029W	Q12243	111 aa		0.98	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	YLR361C-A	Q3E795	98 aa		0.98	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	MBF1	O14467	151 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	HAP3	P13434	144 aa		0.98	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	PEX34	P25584	144 aa		0.98	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	0.98	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	SRP21	P32342	167 aa		0.98	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	NRG2	P38082	220 aa		0.98	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	ATX1	P38636	73 aa		0.98	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	PRS3	P38689	320 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	SBH1	P52870	82 aa		0.98	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	TOS8	P53147	276 aa		0.98	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	GPI19	Q04082	140 aa		0.98	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	DGA1	Q08650	418 aa		0.98	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	YOR015W	Q12169	119 aa		0.98	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	MCT1	Q12283	360 aa		0.98	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	YMR030W-A	Q3E760	96 aa		0.98	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	ATG40	Q99325	256 aa		0.98	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	MATALPHA1	P0CY06	175 aa		0.98	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	HMLALPHA1	P0CY07	175 aa		0.98	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	BET1	P22804	142 aa		0.98	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	HSP12	P22943	109 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	TRX3	P25372	127 aa		0.98	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	POF1	P25576	258 aa		0.98	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	NTF2	P33331	125 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	YOR062C	P36025	268 aa		0.98	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	YFR054C	P43622	192 aa		0.98	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	GPI2	P46961	280 aa		0.98	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	SNO1	Q03144	224 aa		0.98	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	VPS71	Q03433	280 aa		0.98	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	YMR295C	Q03559	197 aa		0.98	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	YDR249C	Q03787	373 aa		0.98	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	THI74	Q04083	370 aa		0.98	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	GEP5	Q12393	293 aa		0.98	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	OPI3	P05375	206 aa		0.97	□□□□□ -2.25
MDS3	YGL197W	HAP2	P06774	265 aa		0.97	□□□□□ -2.25

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