RNA–Protein interactions for RNA: YDR349C

YPS7, Transcript of Putative GPI-anchored aspartic protease, yeastyeast

Gene YPS7, Length 1,791 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPS7YDR349C MAG1P22134 296 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
YPS7YDR349C UPS2P35200 230 aa3.09□□□□□ -1.91
YPS7YDR349C YKL162CP36052 402 aa3.09□□□□□ -1.91
YPS7YDR349C SLM6P38343 150 aa3.09□□□□□ -1.91
YPS7YDR349C YEA6P39953 335 aa3.09□□□□□ -1.91
YPS7YDR349C LSM8P47093 109 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
YPS7YDR349C PDR17P53844 350 aa3.09□□□□□ -1.91
YPS7YDR349C DID2P69771 204 aa3.09□□□□□ -1.91
YPS7YDR349C FEX1Q08913 375 aa3.09□□□□□ -1.91
YPS7YDR349C ATG5Q12380 294 aa3.09□□□□□ -1.91
YPS7YDR349C YCR024C-BQ3E7Z8 88 aa3.09□□□□□ -1.91
YPS7YDR349C PIS1P06197 220 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C ANB1P19211 157 aa3.08□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C YPS1P32329 569 aa3.08□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C MIG3P39943 394 aa3.08□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C LCB3P47013 409 aa3.08□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C RRT7Q07829 113 aa3.08□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C LCL2Q08045 131 aa3.08□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C YPL264CQ08980 353 aa3.08□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C YHR213W-AQ8TGT4 77 aa3.08□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C CYC3P06182 269 aa3.07□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C RPL18AP0CX49 186 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C RPL18BP0CX50 186 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C SEC22P22214 214 aa3.07□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C FPR2P32472 135 aa3.07□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C NSA2P40078 261 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C CAX4P53223 239 aa3.07□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C CWC27Q02770 301 aa3.07□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C EST3Q03096 181 aa3.07□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C YLR179CQ06252 201 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C PBP4Q07362 185 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C FCF2Q12035 217 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C YDR157WA0A023PZE8 133 aa3.07□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C YEA4P40004 342 aa3.07□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C DFG10P40526 253 aa3.07□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C LST8P41318 303 aa3.07□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C TDA4P47153 279 aa3.07□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C GTO3Q04806 366 aa3.07□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C ANT1Q06497 328 aa3.07□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C MHR1Q06630 226 aa3.07□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C VAM10Q08474 114 aa3.07□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C AGC1Q12482 902 aa3.07□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C YPL229WQ99395 206 aa3.07□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C URA5P13298 226 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C FCY2P17064 533 aa3.06□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C RNA15P25299 296 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C YKR045CP36138 183 aa3.06□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C YBL071CP38185 102 aa3.06□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C YPT31P38555 223 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C ASP1P38986 381 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C HAC1P41546 238 aa3.06□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C RIB4P50861 169 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C LST7P53237 242 aa3.06□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C DYN2Q02647 92 aa3.06□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C RUB1Q03919 77 aa3.06□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C YMR082CQ04276 118 aa3.06□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C PBA1Q05778 276 aa3.06□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C DCN1Q12395 269 aa3.06□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C PAA1Q12447 191 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C YER078W-AQ3E7A2 54 aa3.06□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C COA2Q3E823 68 aa3.06□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C YBR298C-AQ8TGK4 73 aa3.06□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C POP5P28005 173 aa3.05□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C MRPL38P35996 138 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C TRS20P38334 175 aa3.05□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C DOG2P38773 246 aa3.05□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C DOG1P38774 246 aa3.05□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C GCV3P39726 170 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C KEG1P43614 200 aa3.05□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C YJR111CP47148 283 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C CPD1P53314 239 aa3.05□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C HCH1P53834 153 aa3.05□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C FRQ1Q06389 190 aa3.05□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C YPR195CQ06594 109 aa3.05□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C FYV7Q12247 151 aa3.05□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C SOD1P00445 154 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C RPS25BP0C0T4 108 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C UBI4P0CG63 381 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C RRT1P38192 103 aa3.05□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C YBR292CP38357 123 aa3.05□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C TAD2P47058 250 aa3.05□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C YNR066CP53752 436 aa3.05□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C PRR2Q12310 699 aa3.05□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C RPS25AQ3E792 108 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C HHF1P02309 103 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C YBL059WP34224 193 aa3.04□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C SHG1P38337 142 aa3.04□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C KRE9P39005 276 aa3.04□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C MIC26P50087 233 aa3.04□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C JAC1P53193 184 aa3.04□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C BOR1P53838 576 aa3.04□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C ATC1Q04005 294 aa3.04□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C SDH7Q04401 133 aa3.04□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C SDO1Q07953 250 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C YGL194C-AQ2V2P6 80 aa3.04□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C QCR9P22289 66 aa3.03□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C CNB1P25296 175 aa3.03□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C GSP1P32835 219 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C GSP2P32836 220 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
YPS7YDR349C SHB17P36136 271 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 22.5 ms