RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503051.1

USP46-AS1-201, USP46 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene USP46-AS1, Length 1,048 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-AS1-201ENST00000503051 MYH10P35580 1976 aa20.59■□□□□ 0.89
USP46-AS1-201ENST00000503051 TRIM49BA6NDI0 452 aa20.59■□□□□ 0.89
USP46-AS1-201ENST00000503051 CLSTN1O94985 981 aa20.59■□□□□ 0.89
USP46-AS1-201ENST00000503051 CD44P16070 742 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
USP46-AS1-201ENST00000503051 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
USP46-AS1-201ENST00000503051 PPP1R2P41236 205 aa20.59■□□□□ 0.89
USP46-AS1-201ENST00000503051 AP3M2P53677 418 aa20.59■□□□□ 0.89
USP46-AS1-201ENST00000503051 EPHA5P54756 1037 aa20.59■□□□□ 0.89
USP46-AS1-201ENST00000503051 LRRC63Q05C16 580 aa20.59■□□□□ 0.89
USP46-AS1-201ENST00000503051 BIRC3Q13489 604 aa20.59■□□□□ 0.89
USP46-AS1-201ENST00000503051 TEAD2Q15562 447 aa20.59■□□□□ 0.89
USP46-AS1-201ENST00000503051 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
USP46-AS1-201ENST00000503051 ADGRF2Q8IZF7 708 aa20.59■□□□□ 0.89
USP46-AS1-201ENST00000503051 PDCL2Q8N4E4 241 aa20.59■□□□□ 0.89
USP46-AS1-201ENST00000503051 TMC2Q8TDI7 906 aa20.59■□□□□ 0.89
USP46-AS1-201ENST00000503051 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
USP46-AS1-201ENST00000503051 ELSPBP1Q96BH3 223 aa20.59■□□□□ 0.89
USP46-AS1-201ENST00000503051 DNAJC25Q9H1X3 360 aa20.59■□□□□ 0.89
USP46-AS1-201ENST00000503051 GDAP2Q9NXN4 497 aa20.59■□□□□ 0.89
USP46-AS1-201ENST00000503051 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
USP46-AS1-201ENST00000503051 KIAA1468Q9P260 1216 aa20.59■□□□□ 0.89
USP46-AS1-201ENST00000503051 A0A1W2PRU2 124 aa20.58■□□□□ 0.89
USP46-AS1-201ENST00000503051 CETN3O15182 167 aa20.58■□□□□ 0.89
USP46-AS1-201ENST00000503051 PHACTR2O75167 634 aa20.58■□□□□ 0.89
USP46-AS1-201ENST00000503051 FGF19O95750 216 aa20.58■□□□□ 0.89
USP46-AS1-201ENST00000503051 TRIM49P0CI25 452 aa20.58■□□□□ 0.89
USP46-AS1-201ENST00000503051 TRIM49CP0CI26 452 aa20.58■□□□□ 0.89
USP46-AS1-201ENST00000503051 KRT13P13646 458 aa20.58■□□□□ 0.89
USP46-AS1-201ENST00000503051 VAMP7P51809 220 aa20.58■□□□□ 0.89
USP46-AS1-201ENST00000503051 TRPC3Q13507 836 aa20.58■□□□□ 0.89
USP46-AS1-201ENST00000503051 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
USP46-AS1-201ENST00000503051 FAM78AQ5JUQ0 283 aa20.58■□□□□ 0.89
USP46-AS1-201ENST00000503051 ANKRD40Q6AI12 368 aa20.58■□□□□ 0.89
USP46-AS1-201ENST00000503051 KLHL10Q6JEL2 608 aa20.58■□□□□ 0.89
USP46-AS1-201ENST00000503051 TMC8Q8IU68 726 aa20.58■□□□□ 0.89
USP46-AS1-201ENST00000503051 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
USP46-AS1-201ENST00000503051 TOP6BLQ8N6T0 577 aa20.58■□□□□ 0.89
USP46-AS1-201ENST00000503051 SHKBP1Q8TBC3 707 aa20.58■□□□□ 0.89
USP46-AS1-201ENST00000503051 PSMG2Q969U7 264 aa20.58■□□□□ 0.89
USP46-AS1-201ENST00000503051 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
USP46-AS1-201ENST00000503051 ASB16Q96NS5 453 aa20.58■□□□□ 0.89
USP46-AS1-201ENST00000503051 LPIN3Q9BQK8 851 aa20.58■□□□□ 0.89
USP46-AS1-201ENST00000503051 MKNK1Q9BUB5 465 aa20.58■□□□□ 0.89
USP46-AS1-201ENST00000503051 GPR88Q9GZN0 384 aa20.58■□□□□ 0.89
USP46-AS1-201ENST00000503051 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa20.58■□□□□ 0.89
USP46-AS1-201ENST00000503051 WDFY4Q6ZS81 3184 aa20.57■□□□□ 0.88
USP46-AS1-201ENST00000503051 GREB1Q4ZG55 1949 aa20.57■□□□□ 0.88
USP46-AS1-201ENST00000503051 H0Y858 1186 aa20.57■□□□□ 0.88
USP46-AS1-201ENST00000503051 GOLGA6L22H0YM25 854 aa20.57■□□□□ 0.88
USP46-AS1-201ENST00000503051 EPB41P11171 864 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
USP46-AS1-201ENST00000503051 CCNE1P24864 410 aa20.57■□□□□ 0.88
USP46-AS1-201ENST00000503051 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
USP46-AS1-201ENST00000503051 GRM2Q14416 872 aa20.57■□□□□ 0.88
USP46-AS1-201ENST00000503051 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
USP46-AS1-201ENST00000503051 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa20.57■□□□□ 0.88
USP46-AS1-201ENST00000503051 C1orf220Q5T0J3 134 aa20.57■□□□□ 0.88
USP46-AS1-201ENST00000503051 TANGO2Q6ICL3 276 aa20.57■□□□□ 0.88
USP46-AS1-201ENST00000503051 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
USP46-AS1-201ENST00000503051 TRIML1Q8N9V2 468 aa20.57■□□□□ 0.88
USP46-AS1-201ENST00000503051 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
USP46-AS1-201ENST00000503051 SPATA18Q8TC71 538 aa20.57■□□□□ 0.88
USP46-AS1-201ENST00000503051 SMARCD2Q92925 531 aa20.57■□□□□ 0.88
USP46-AS1-201ENST00000503051 FAM86C1Q9NVL1 165 aa20.57■□□□□ 0.88
USP46-AS1-201ENST00000503051 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
USP46-AS1-201ENST00000503051 CTNND2Q9UQB3 1225 aa20.57■□□□□ 0.88
USP46-AS1-201ENST00000503051 COL4A3Q01955 1670 aa20.57■□□□□ 0.88
USP46-AS1-201ENST00000503051 PATJQ8NI35 1801 aa20.56■□□□□ 0.88
USP46-AS1-201ENST00000503051 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa20.56■□□□□ 0.88
USP46-AS1-201ENST00000503051 PI15O43692 258 aa20.56■□□□□ 0.88
USP46-AS1-201ENST00000503051 CST3P01034 146 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
USP46-AS1-201ENST00000503051 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
USP46-AS1-201ENST00000503051 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
USP46-AS1-201ENST00000503051 GABRR2P28476 465 aa20.56■□□□□ 0.88
USP46-AS1-201ENST00000503051 PCSK1P29120 753 aa20.56■□□□□ 0.88
USP46-AS1-201ENST00000503051 LHX1P48742 406 aa20.56■□□□□ 0.88
USP46-AS1-201ENST00000503051 MRE11P49959 708 aa20.56■□□□□ 0.88
USP46-AS1-201ENST00000503051 MYL6P60660 151 aa20.56■□□□□ 0.88
USP46-AS1-201ENST00000503051 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
USP46-AS1-201ENST00000503051 ENPEPQ07075 957 aa20.56■□□□□ 0.88
USP46-AS1-201ENST00000503051 NCOA4Q13772 614 aa20.56■□□□□ 0.88
USP46-AS1-201ENST00000503051 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa20.56■□□□□ 0.88
USP46-AS1-201ENST00000503051 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
USP46-AS1-201ENST00000503051 CCDC105Q8IYK2 499 aa20.56■□□□□ 0.88
USP46-AS1-201ENST00000503051 NELFBQ8WX92 580 aa20.56■□□□□ 0.88
USP46-AS1-201ENST00000503051 ACBD6Q9BR61 282 aa20.56■□□□□ 0.88
USP46-AS1-201ENST00000503051 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa20.56■□□□□ 0.88
USP46-AS1-201ENST00000503051 XYLT2Q9H1B5 865 aa20.56■□□□□ 0.88
USP46-AS1-201ENST00000503051 NUP62CLQ9H1M0 184 aa20.56■□□□□ 0.88
USP46-AS1-201ENST00000503051 ATXN3LQ9H3M9 355 aa20.56■□□□□ 0.88
USP46-AS1-201ENST00000503051 BRD9Q9H8M2 597 aa20.56■□□□□ 0.88
USP46-AS1-201ENST00000503051 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
USP46-AS1-201ENST00000503051 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
USP46-AS1-201ENST00000503051 IKBKBO14920 756 aa20.55■□□□□ 0.88
USP46-AS1-201ENST00000503051 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
USP46-AS1-201ENST00000503051 MOSPD3O75425 235 aa20.55■□□□□ 0.88
USP46-AS1-201ENST00000503051 STAU1O95793 577 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
USP46-AS1-201ENST00000503051 ATF6P18850 670 aa20.55■□□□□ 0.88
USP46-AS1-201ENST00000503051 FCARP24071 287 aa20.55■□□□□ 0.88
USP46-AS1-201ENST00000503051 PRKCQQ04759 706 aa20.55■□□□□ 0.88
USP46-AS1-201ENST00000503051 SOWAHAQ2M3V2 549 aa20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.7 ms