RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498417.5

ANKRD54-210, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD54, Length 2,403 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-210ENST00000498417 UBOX5O94941 541 aa16.4■□□□□ 0.22
ANKRD54-210ENST00000498417 CDH8P55286 799 aa16.4■□□□□ 0.22
ANKRD54-210ENST00000498417 PLCB3Q01970 1234 aa16.4■□□□□ 0.22
ANKRD54-210ENST00000498417 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
ANKRD54-210ENST00000498417 MORF4L2Q15014 288 aa16.4■□□□□ 0.22
ANKRD54-210ENST00000498417 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
ANKRD54-210ENST00000498417 SMTNL2Q2TAL5 461 aa16.4■□□□□ 0.22
ANKRD54-210ENST00000498417 ATF7IP2Q5U623 682 aa16.4■□□□□ 0.22
ANKRD54-210ENST00000498417 TRABD2AQ86V40 505 aa16.4■□□□□ 0.22
ANKRD54-210ENST00000498417 MAGEB18Q96M61 343 aa16.4■□□□□ 0.22
ANKRD54-210ENST00000498417 FZD8Q9H461 694 aa16.4■□□□□ 0.22
ANKRD54-210ENST00000498417 PRKAG3Q9UGI9 489 aa16.4■□□□□ 0.22
ANKRD54-210ENST00000498417 PPME1Q9Y570 386 aa16.4■□□□□ 0.22
ANKRD54-210ENST00000498417 SIGLEC16A6NMB1 481 aa16.4■□□□□ 0.22
ANKRD54-210ENST00000498417 ACKR2O00590 384 aa16.4■□□□□ 0.22
ANKRD54-210ENST00000498417 ALOX15BO15296 676 aa16.4■□□□□ 0.22
ANKRD54-210ENST00000498417 CNMDO75829 334 aa16.4■□□□□ 0.22
ANKRD54-210ENST00000498417 IFNB1P01574 187 aa16.4■□□□□ 0.22
ANKRD54-210ENST00000498417 KRT3P12035 628 aa16.4■□□□□ 0.22
ANKRD54-210ENST00000498417 CD19P15391 556 aa16.4■□□□□ 0.22
ANKRD54-210ENST00000498417 PSMA2P25787 234 aa16.4■□□□□ 0.22
ANKRD54-210ENST00000498417 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
ANKRD54-210ENST00000498417 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
ANKRD54-210ENST00000498417 ORC1Q13415 861 aa16.4■□□□□ 0.22
ANKRD54-210ENST00000498417 GALNTL6Q49A17 601 aa16.4■□□□□ 0.22
ANKRD54-210ENST00000498417 KCNT1Q5JUK3 1230 aa16.4■□□□□ 0.22
ANKRD54-210ENST00000498417 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
ANKRD54-210ENST00000498417 GADL1Q6ZQY3 521 aa16.4■□□□□ 0.22
ANKRD54-210ENST00000498417 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa16.4■□□□□ 0.22
ANKRD54-210ENST00000498417 CEP128Q6ZU80 1094 aa16.4■□□□□ 0.22
ANKRD54-210ENST00000498417 SPATA21Q7Z572 469 aa16.4■□□□□ 0.22
ANKRD54-210ENST00000498417 MINDY3Q9H8M7 445 aa16.4■□□□□ 0.22
ANKRD54-210ENST00000498417 ZWILCHQ9H900 591 aa16.4■□□□□ 0.22
ANKRD54-210ENST00000498417 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa16.4■□□□□ 0.22
ANKRD54-210ENST00000498417 SIX4Q9UIU6 781 aa16.4■□□□□ 0.22
ANKRD54-210ENST00000498417 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa16.39■□□□□ 0.21
ANKRD54-210ENST00000498417 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa16.39■□□□□ 0.21
ANKRD54-210ENST00000498417 SGK1O00141 431 aa16.39■□□□□ 0.21
ANKRD54-210ENST00000498417 MGRN1O60291 552 aa16.39■□□□□ 0.21
ANKRD54-210ENST00000498417 SPAG7O75391 227 aa16.39■□□□□ 0.21
ANKRD54-210ENST00000498417 LRCH4O75427 683 aa16.39■□□□□ 0.21
ANKRD54-210ENST00000498417 BANF1O75531 89 aa16.39■□□□□ 0.21
ANKRD54-210ENST00000498417 SUN1O94901 812 aa16.39■□□□□ 0.21
ANKRD54-210ENST00000498417 TNNC2P02585 160 aa16.39■□□□□ 0.21
ANKRD54-210ENST00000498417 TAC1P20366 129 aa16.39■□□□□ 0.21
ANKRD54-210ENST00000498417 DYNLT1P63172 113 aa16.39■□□□□ 0.21
ANKRD54-210ENST00000498417 GAD2Q05329 585 aa16.39■□□□□ 0.21
ANKRD54-210ENST00000498417 CAPN12Q6ZSI9 719 aa16.39■□□□□ 0.21
ANKRD54-210ENST00000498417 POLNQ7Z5Q5 900 aa16.39■□□□□ 0.21
ANKRD54-210ENST00000498417 ZBED8Q8IZ13 594 aa16.39■□□□□ 0.21
ANKRD54-210ENST00000498417 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
ANKRD54-210ENST00000498417 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
ANKRD54-210ENST00000498417 NLRP4Q96MN2 994 aa16.39■□□□□ 0.21
ANKRD54-210ENST00000498417 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
ANKRD54-210ENST00000498417 SDCBP2Q9H190 292 aa16.39■□□□□ 0.21
ANKRD54-210ENST00000498417 C2orf40Q9H1Z8 148 aa16.39■□□□□ 0.21
ANKRD54-210ENST00000498417 LHX5Q9H2C1 402 aa16.39■□□□□ 0.21
ANKRD54-210ENST00000498417 PCDH9Q9HC56 1237 aa16.39■□□□□ 0.21
ANKRD54-210ENST00000498417 CEP83Q9Y592 693 aa16.39■□□□□ 0.21
ANKRD54-210ENST00000498417 GAS2O43903 313 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
ANKRD54-210ENST00000498417 IQCF3P0C7M6 154 aa16.39■□□□□ 0.21
ANKRD54-210ENST00000498417 CXCL8P10145 99 aa16.39■□□□□ 0.21
ANKRD54-210ENST00000498417 RAD23BP54727 409 aa16.39■□□□□ 0.21
ANKRD54-210ENST00000498417 GDF10P55107 478 aa16.39■□□□□ 0.21
ANKRD54-210ENST00000498417 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
ANKRD54-210ENST00000498417 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
ANKRD54-210ENST00000498417 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa16.39■□□□□ 0.21
ANKRD54-210ENST00000498417 TDRPQ86YL5 185 aa16.39■□□□□ 0.21
ANKRD54-210ENST00000498417 EMC1Q8N766 993 aa16.39■□□□□ 0.21
ANKRD54-210ENST00000498417 ACTL9Q8TC94 416 aa16.39■□□□□ 0.21
ANKRD54-210ENST00000498417 COPS5Q92905 334 aa16.39■□□□□ 0.21
ANKRD54-210ENST00000498417 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa16.39■□□□□ 0.21
ANKRD54-210ENST00000498417 TTC25Q96NG3 672 aa16.39■□□□□ 0.21
ANKRD54-210ENST00000498417 CPXM1Q96SM3 734 aa16.39■□□□□ 0.21
ANKRD54-210ENST00000498417 KIF9Q9HAQ2 790 aa16.39■□□□□ 0.21
ANKRD54-210ENST00000498417 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
ANKRD54-210ENST00000498417 FAM47DPA6NHR8 397 aa16.38■□□□□ 0.21
ANKRD54-210ENST00000498417 GOLGA8MH3BSY2 632 aa16.38■□□□□ 0.21
ANKRD54-210ENST00000498417 CHUKO15111 745 aa16.38■□□□□ 0.21
ANKRD54-210ENST00000498417 KRT19P08727 400 aa16.38■□□□□ 0.21
ANKRD54-210ENST00000498417 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
ANKRD54-210ENST00000498417 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa16.38■□□□□ 0.21
ANKRD54-210ENST00000498417 DENND1AQ8TEH3 1009 aa16.38■□□□□ 0.21
ANKRD54-210ENST00000498417 TWNKQ96RR1 684 aa16.38■□□□□ 0.21
ANKRD54-210ENST00000498417 BCO2Q9BYV7 579 aa16.38■□□□□ 0.21
ANKRD54-210ENST00000498417 CDT1Q9H211 546 aa16.38■□□□□ 0.21
ANKRD54-210ENST00000498417 VPS37BQ9H9H4 285 aa16.38■□□□□ 0.21
ANKRD54-210ENST00000498417 STRIP2Q9ULQ0 834 aa16.38■□□□□ 0.21
ANKRD54-210ENST00000498417 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa16.38■□□□□ 0.21
ANKRD54-210ENST00000498417 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
ANKRD54-210ENST00000498417 NOP56O00567 594 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
ANKRD54-210ENST00000498417 IRF6O14896 467 aa16.38■□□□□ 0.21
ANKRD54-210ENST00000498417 CST8O60676 142 aa16.38■□□□□ 0.21
ANKRD54-210ENST00000498417 CD48P09326 243 aa16.38■□□□□ 0.21
ANKRD54-210ENST00000498417 CLCN3P51790 818 aa16.38■□□□□ 0.21
ANKRD54-210ENST00000498417 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
ANKRD54-210ENST00000498417 MGAT5Q09328 741 aa16.38■□□□□ 0.21
ANKRD54-210ENST00000498417 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
ANKRD54-210ENST00000498417 SNCBQ16143 134 aa16.38■□□□□ 0.21
ANKRD54-210ENST00000498417 ANKRD22Q5VYY1 191 aa16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.1 ms