RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)J

tW(CCA)J, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)J, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)JtW(CCA)J PRE9P23638 258 aaKnown RBP1.93□□□□□ -2.1
tW(CCA)JtW(CCA)J CDC50P25656 391 aa1.93□□□□□ -2.1
tW(CCA)JtW(CCA)J SFT2P38166 215 aa1.93□□□□□ -2.1
tW(CCA)JtW(CCA)J SLM6P38343 150 aa1.93□□□□□ -2.1
tW(CCA)JtW(CCA)J YEA6P39953 335 aa1.93□□□□□ -2.1
tW(CCA)JtW(CCA)J PRE5P40302 234 aaKnown RBP1.93□□□□□ -2.1
tW(CCA)JtW(CCA)J YGR269WP40326 108 aa1.93□□□□□ -2.1
tW(CCA)JtW(CCA)J RPR2P40571 144 aa1.93□□□□□ -2.1
tW(CCA)JtW(CCA)J MCM22P47167 239 aa1.93□□□□□ -2.1
tW(CCA)JtW(CCA)J IZH1Q03419 316 aa1.93□□□□□ -2.1
tW(CCA)JtW(CCA)J YMR007WQ03675 126 aa1.93□□□□□ -2.1
tW(CCA)JtW(CCA)J YMR244WQ04018 355 aa1.93□□□□□ -2.1
tW(CCA)JtW(CCA)J ERP1Q05359 219 aaKnown RBP1.93□□□□□ -2.1
tW(CCA)JtW(CCA)J YPR195CQ06594 109 aa1.93□□□□□ -2.1
tW(CCA)JtW(CCA)J IZH3Q07959 543 aa1.93□□□□□ -2.1
tW(CCA)JtW(CCA)J ERV2Q12284 196 aa1.93□□□□□ -2.1
tW(CCA)JtW(CCA)J SCM3Q12334 223 aa1.93□□□□□ -2.1
tW(CCA)JtW(CCA)J PUT1P09368 476 aa1.92□□□□□ -2.1
tW(CCA)JtW(CCA)J SAR1P20606 190 aaKnown RBP1.92□□□□□ -2.1
tW(CCA)JtW(CCA)J SPO13P23624 291 aa1.92□□□□□ -2.1
tW(CCA)JtW(CCA)J RPS2P25443 254 aaKnown RBP1.92□□□□□ -2.1
tW(CCA)JtW(CCA)J FPR2P32472 135 aa1.92□□□□□ -2.1
tW(CCA)JtW(CCA)J DER1P38307 211 aa1.92□□□□□ -2.1
tW(CCA)JtW(CCA)J MBB1P39534 108 aa1.92□□□□□ -2.1
tW(CCA)JtW(CCA)J RPL13BP40212 199 aaKnown RBP1.92□□□□□ -2.1
tW(CCA)JtW(CCA)J GAT4P40569 121 aa1.92□□□□□ -2.1
tW(CCA)JtW(CCA)J IMP2P46972 177 aa1.92□□□□□ -2.1
tW(CCA)JtW(CCA)J PNC1P53184 216 aaKnown RBP1.92□□□□□ -2.1
tW(CCA)JtW(CCA)J HST4P53688 370 aa1.92□□□□□ -2.1
tW(CCA)JtW(CCA)J BOR1P53838 576 aa1.92□□□□□ -2.1
tW(CCA)JtW(CCA)J SGF11Q03067 99 aa1.92□□□□□ -2.1
tW(CCA)JtW(CCA)J MRPS8Q03799 155 aa1.92□□□□□ -2.1
tW(CCA)JtW(CCA)J YMR082CQ04276 118 aa1.92□□□□□ -2.1
tW(CCA)JtW(CCA)J LOA1Q06508 300 aa1.92□□□□□ -2.1
tW(CCA)JtW(CCA)J BER1Q06688 274 aaKnown RBP1.92□□□□□ -2.1
tW(CCA)JtW(CCA)J FCF2Q12035 217 aaPredicted RBP1.92□□□□□ -2.1
tW(CCA)JtW(CCA)J PRR2Q12310 699 aa1.92□□□□□ -2.1
tW(CCA)JtW(CCA)J RPL13AQ12690 199 aaPredicted RBP1.92□□□□□ -2.1
tW(CCA)JtW(CCA)J YNL146C-AQ3E7Z1 64 aa1.92□□□□□ -2.1
tW(CCA)JtW(CCA)J YHR213W-AQ8TGT4 77 aa1.92□□□□□ -2.1
tW(CCA)JtW(CCA)J YOL085CQ99345 113 aa1.92□□□□□ -2.1
tW(CCA)JtW(CCA)J DDI2P0CH63 225 aa1.91□□□□□ -2.1
tW(CCA)JtW(CCA)J DDI3P0CH64 225 aa1.91□□□□□ -2.1
tW(CCA)JtW(CCA)J ACB1P31787 87 aa1.91□□□□□ -2.1
tW(CCA)JtW(CCA)J YPC1P38298 316 aa1.91□□□□□ -2.1
tW(CCA)JtW(CCA)J BOL3P39724 118 aa1.91□□□□□ -2.1
tW(CCA)JtW(CCA)J YEA4P40004 342 aa1.91□□□□□ -2.1
tW(CCA)JtW(CCA)J SWM2P40342 146 aa1.91□□□□□ -2.1
tW(CCA)JtW(CCA)J TAD2P47058 250 aa1.91□□□□□ -2.1
tW(CCA)JtW(CCA)J AIM24P47127 394 aa1.91□□□□□ -2.1
tW(CCA)JtW(CCA)J YNR071CP53757 342 aa1.91□□□□□ -2.1
tW(CCA)JtW(CCA)J GIS2P53849 153 aaKnown RBP RIP-Chip data1.91□□□□□ -2.1not detected
tW(CCA)JtW(CCA)J FMP41P53889 259 aaKnown RBP1.91□□□□□ -2.1
tW(CCA)JtW(CCA)J YDL242WQ07746 117 aa1.91□□□□□ -2.1
tW(CCA)JtW(CCA)J VAM10Q08474 114 aa1.91□□□□□ -2.1
tW(CCA)JtW(CCA)J YPR145C-AQ2V2P0 78 aa1.91□□□□□ -2.1
tW(CCA)JtW(CCA)J RPL2AP0CX45 254 aaKnown RBP1.9□□□□□ -2.11
tW(CCA)JtW(CCA)J RPL2BP0CX46 254 aaKnown RBP1.9□□□□□ -2.11
tW(CCA)JtW(CCA)J RPS11AP0CX47 156 aaKnown RBP1.9□□□□□ -2.11
tW(CCA)JtW(CCA)J RPS11BP0CX48 156 aaKnown RBP1.9□□□□□ -2.11
tW(CCA)JtW(CCA)J RPB3P16370 318 aaKnown RBP1.9□□□□□ -2.11
tW(CCA)JtW(CCA)J MAG1P22134 296 aaKnown RBP1.9□□□□□ -2.11
tW(CCA)JtW(CCA)J NPL6P32832 435 aa1.9□□□□□ -2.11
tW(CCA)JtW(CCA)J AFR1P33304 620 aa1.9□□□□□ -2.11
tW(CCA)JtW(CCA)J YBL059WP34224 193 aa1.9□□□□□ -2.11
tW(CCA)JtW(CCA)J SAP30P38429 201 aa1.9□□□□□ -2.11
tW(CCA)JtW(CCA)J PET100P38958 111 aa1.9□□□□□ -2.11
tW(CCA)JtW(CCA)J PEX7P39108 375 aa1.9□□□□□ -2.11
tW(CCA)JtW(CCA)J VHS2P40463 436 aa1.9□□□□□ -2.11
tW(CCA)JtW(CCA)J SNX4P47057 423 aa1.9□□□□□ -2.11
tW(CCA)JtW(CCA)J DSK2P48510 373 aa1.9□□□□□ -2.11
tW(CCA)JtW(CCA)J YGL117WP53133 265 aa1.9□□□□□ -2.11
tW(CCA)JtW(CCA)J TOM7P53507 60 aa1.9□□□□□ -2.11
tW(CCA)JtW(CCA)J AVO2Q04749 426 aa1.9□□□□□ -2.11
tW(CCA)JtW(CCA)J YPL162CQ12042 273 aa1.9□□□□□ -2.11
tW(CCA)JtW(CCA)J YGL194C-AQ2V2P6 80 aa1.9□□□□□ -2.11
tW(CCA)JtW(CCA)J HTB2P02294 131 aa1.89□□□□□ -2.11
tW(CCA)JtW(CCA)J Q0255P03881 472 aa1.89□□□□□ -2.11
tW(CCA)JtW(CCA)J MRP2P10663 115 aaPredicted RBP1.89□□□□□ -2.11
tW(CCA)JtW(CCA)J CKS1P20486 150 aaKnown RBP1.89□□□□□ -2.11
tW(CCA)JtW(CCA)J HSP12P22943 109 aaKnown RBP1.89□□□□□ -2.11
tW(CCA)JtW(CCA)J EMP24P32803 203 aaKnown RBP1.89□□□□□ -2.11
tW(CCA)JtW(CCA)J YGL015CP33199 130 aa1.89□□□□□ -2.11
tW(CCA)JtW(CCA)J TRS20P38334 175 aa1.89□□□□□ -2.11
tW(CCA)JtW(CCA)J YHR022CP38763 256 aa1.89□□□□□ -2.11
tW(CCA)JtW(CCA)J SAS2P40963 338 aa1.89□□□□□ -2.11
tW(CCA)JtW(CCA)J CDC40P40968 455 aaPredicted RBP1.89□□□□□ -2.11
tW(CCA)JtW(CCA)J JAC1P53193 184 aa1.89□□□□□ -2.11
tW(CCA)JtW(CCA)J ORM1P53224 222 aa1.89□□□□□ -2.11
tW(CCA)JtW(CCA)J YNR066CP53752 436 aa1.89□□□□□ -2.11
tW(CCA)JtW(CCA)J MRPS16Q02608 121 aa1.89□□□□□ -2.11
tW(CCA)JtW(CCA)J ADD37Q03233 198 aa1.89□□□□□ -2.11
tW(CCA)JtW(CCA)J TMA23Q03525 211 aa1.89□□□□□ -2.11
tW(CCA)JtW(CCA)J ATC1Q04005 294 aa1.89□□□□□ -2.11
tW(CCA)JtW(CCA)J YLR179CQ06252 201 aaKnown RBP1.89□□□□□ -2.11
tW(CCA)JtW(CCA)J SDO1Q07953 250 aaKnown RBP1.89□□□□□ -2.11
tW(CCA)JtW(CCA)J FIT2Q08906 153 aa1.89□□□□□ -2.11
tW(CCA)JtW(CCA)J YPR063CQ12160 140 aa1.89□□□□□ -2.11
tW(CCA)JtW(CCA)J YOR015WQ12169 119 aa1.89□□□□□ -2.11
tW(CCA)JtW(CCA)J TMA17Q12513 150 aa1.89□□□□□ -2.11
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