RNA–Protein interactions for RNA: YOR328W

PDR10, Transcript of ATP-binding cassette (ABC) transporter, yeast

Gene PDR10, Length 4,695 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PDR10	YOR328W	PPZ2	P33329	710 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	BAP2	P38084	609 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	YBR209W	P38311	105 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	PEX22	P39718	180 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	STP4	Q07351	490 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	RXT3	Q07458	294 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	YPL261C	Q08976	102 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	FCY1	Q12178	158 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	REC114	P32841	428 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	CAC2	Q04199	468 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	YGL194C-A	Q2V2P6	80 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	FLO9	P39712	1322 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	ARO2	P28777	376 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	YJL163C	P46996	555 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	FRE8	Q12209	686 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	COA2	Q3E823	68 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	SPS100	P13130	326 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	MRPL24	P36525	258 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	MRPL19	P53875	158 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	RFU1	Q08003	200 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	SCO1	P23833	295 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	PAU3	P25610	124 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	MTC6	P38849	526 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	YER085C	P40058	173 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	PMP3	P87284	55 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	UPS3	Q04006	179 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	AYT1	Q12226	474 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	YMR253C	Q04835	414 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	GAL1	P04385	528 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	YCR007C	P25354	239 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	VMA21	P41806	77 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	GPI2	P46961	280 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	WSC2	P53832	503 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	UGX2	P32772	223 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	POG1	P40473	351 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	YIL102C	P40488	101 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	RPL39	P04650	51 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	ARG80	P07249	177 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	IMP1	P28627	190 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	YEA6	P39953	335 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	NSA2	P40078	261 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	YNL165W	P53891	406 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	RIM9	Q04734	239 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	IRC21	Q04772	201 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	TIM18	Q08749	192 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	WHI5	Q12416	295 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	YPR010C-A	A5Z2X5	72 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	SNN1	P48232	102 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	YIP5	P53108	310 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	MRX11	Q03079	207 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	ARR2	Q06597	130 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	YOR015W	Q12169	119 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	CDC39	P25655	2108 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	CPT1	P17898	393 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	HHF1	P02309	103 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	MRPL44	P19956	98 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	ERG2	P32352	222 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	NNK1	P36003	928 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	MID1	P41821	548 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	GWT1	P47026	490 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	HNT2	P49775	206 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	HSK3	P69852	69 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	DGK1	Q12382	290 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	IRA2	P19158	3079 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	ATP10	P18496	279 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.18	□□□□□ -1.74	not detected
PDR10	YOR328W	PRM3	Q08931	133 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	TAT1	P38085	619 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	ATG5	Q12380	294 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	CDC50	P25656	391 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	SCM4	P32564	187 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	YPT10	P38146	199 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	AVT5	P38176	459 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	TMA23	Q03525	211 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	NHP6B	P11633	99 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	AEP3	Q12089	606 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PDR10	YOR328W	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74

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