RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636120.1

PDE4D-228, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 6,659 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-228ENST00000636120 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 MYO1DO94832 1006 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 CHN1P15882 459 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 TM4SF1P30408 202 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 COBLL1Q53SF7 1204 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 CBWD2Q8IUF1 395 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 ULK4Q96C45 1275 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 VCPIP1Q96JH7 1222 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 KIFC3Q9BVG8 833 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 HACD3Q9P035 362 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 CFLARO15519 480 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 ANXA9O76027 345 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 SLITRK3O94933 977 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 KRT16P08779 473 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 CTSHP09668 335 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 ARHGDIAP52565 204 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 GYS2P54840 703 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 MAPK7Q13164 816 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 MORF4L2Q15014 288 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 TFDP3Q5H9I0 405 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 ZPBP2Q6X784 338 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 EXD1Q8NHP7 514 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 GANCQ8TET4 914 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 RMDN1Q96DB5 314 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 NRBF2Q96F24 287 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 AAASQ9NRG9 546 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 STOML1Q9UBI4 398 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 ZBBXA8MT70 800 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 WNT10BO00744 389 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 PTK7Q13308 1070 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 TAS2R42Q7RTR8 314 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 UBA3Q8TBC4 463 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 SNX19Q92543 992 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 MTBPQ96DY7 904 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 TMEM106CQ9BVX2 250 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 SLC13A1Q9BZW2 595 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 MTMR12Q9C0I1 747 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 EPC1Q9H2F5 836 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 KCNMB3Q9NPA1 279 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 APOA4P06727 396 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 APRTP07741 180 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 PTK6Q13882 451 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 CATSPER1Q8NEC5 780 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 PPP2R3CQ969Q6 453 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 SLC4A9Q96Q91 983 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 TMEM134Q9H6X4 195 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 DYRK4Q9NR20 520 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 ATP9BO43861 1147 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 CST8O60676 142 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 KITP10721 976 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 POU5F1BQ06416 359 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 TMEM62Q0P6H9 643 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 GNASQ5JWF2 1037 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 SOCS4Q8WXH5 440 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 TMEM176AQ96HP8 235 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 CBWD1Q9BRT8 395 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 CENPKQ9BS16 269 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 SPON2Q9BUD6 331 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 GPRC5CQ9NQ84 441 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 FAM49BQ9NUQ9 324 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 A0A087X0T9 212 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 FAM86B1E9PN63 330 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 AKAP3O75969 853 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 FAM86B2P0C5J1 330 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 FAM228BP0C875 321 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 TGM2P21980 687 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 IFNA8P32881 189 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 HARS2P49590 506 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 GEMP55040 296 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 RHBDL3P58872 404 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 GCNT1Q02742 428 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 DCAF6Q58WW2 860 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-228ENST00000636120 CYP4A22Q5TCH4 519 aa6.75□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.9 ms