RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505490.2

ALYREF-202, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ALYREF, Length 1,088 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-202ENST00000505490 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP32.62■■■□□ 2.81
ALYREF-202ENST00000505490 MCM2P49736 904 aa32.62■■■□□ 2.81
ALYREF-202ENST00000505490 TMEM150AQ86TG1 271 aa32.62■■■□□ 2.81
ALYREF-202ENST00000505490 LONP2Q86WA8 852 aa32.62■■■□□ 2.81
ALYREF-202ENST00000505490 NT5DC4Q86YG4 428 aa32.62■■■□□ 2.81
ALYREF-202ENST00000505490 EFCAB13Q8IY85 973 aa32.62■■■□□ 2.81
ALYREF-202ENST00000505490 HVCN1Q96D96 273 aa32.62■■■□□ 2.81
ALYREF-202ENST00000505490 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP32.62■■■□□ 2.81
ALYREF-202ENST00000505490 SLC46A2Q9BY10 475 aa32.62■■■□□ 2.81
ALYREF-202ENST00000505490 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP32.62■■■□□ 2.81
ALYREF-202ENST00000505490 ACACBO00763 2458 aa32.62■■■□□ 2.81
ALYREF-202ENST00000505490 DPYSL4O14531 572 aa32.61■■■□□ 2.81
ALYREF-202ENST00000505490 KRT18P05783 430 aaKnown RBP32.61■■■□□ 2.81
ALYREF-202ENST00000505490 CYP4F8P98187 520 aa32.61■■■□□ 2.81
ALYREF-202ENST00000505490 VEPH1Q14D04 833 aa32.61■■■□□ 2.81
ALYREF-202ENST00000505490 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP32.61■■■□□ 2.81
ALYREF-202ENST00000505490 MGAT5BQ3V5L5 792 aa32.61■■■□□ 2.81
ALYREF-202ENST00000505490 WSCD1Q658N2 575 aa32.61■■■□□ 2.81
ALYREF-202ENST00000505490 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP32.61■■■□□ 2.81
ALYREF-202ENST00000505490 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP32.61■■■□□ 2.81
ALYREF-202ENST00000505490 ZHX3Q9H4I2 956 aa32.61■■■□□ 2.81
ALYREF-202ENST00000505490 SMC3Q9UQE7 1217 aa32.61■■■□□ 2.81
ALYREF-202ENST00000505490 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa32.61■■■□□ 2.81
ALYREF-202ENST00000505490 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa32.6■■■□□ 2.81
ALYREF-202ENST00000505490 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP32.6■■■□□ 2.81
ALYREF-202ENST00000505490 FNTBP49356 437 aa32.6■■■□□ 2.81
ALYREF-202ENST00000505490 SPEM2Q0P670 501 aa32.6■■■□□ 2.81
ALYREF-202ENST00000505490 LPAL2Q16609 132 aa32.6■■■□□ 2.81
ALYREF-202ENST00000505490 METTL23Q86XA0 190 aa32.6■■■□□ 2.81
ALYREF-202ENST00000505490 THEM5Q8N1Q8 247 aa32.6■■■□□ 2.81
ALYREF-202ENST00000505490 FAM83CQ9BQN1 747 aa32.6■■■□□ 2.81
ALYREF-202ENST00000505490 IKZF4Q9H2S9 585 aa32.6■■■□□ 2.81
ALYREF-202ENST00000505490 SOBPA7XYQ1 873 aa32.59■■■□□ 2.81
ALYREF-202ENST00000505490 TNK2Q07912 1038 aa32.59■■■□□ 2.81
ALYREF-202ENST00000505490 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP32.59■■■□□ 2.81
ALYREF-202ENST00000505490 CACNA1BQ00975 2339 aa32.59■■■□□ 2.81
ALYREF-202ENST00000505490 KPNA7A9QM74 516 aa32.58■■■□□ 2.81
ALYREF-202ENST00000505490 F11P03951 625 aa32.58■■■□□ 2.81
ALYREF-202ENST00000505490 PON2Q15165 354 aa32.58■■■□□ 2.81
ALYREF-202ENST00000505490 USP49Q70CQ1 688 aa32.58■■■□□ 2.81
ALYREF-202ENST00000505490 CMTM8Q8IZV2 173 aa32.58■■■□□ 2.81
ALYREF-202ENST00000505490 CHFRQ96EP1 664 aa32.58■■■□□ 2.81
ALYREF-202ENST00000505490 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP32.58■■■□□ 2.81
ALYREF-202ENST00000505490 SPAG17Q6Q759 2223 aa32.57■■■□□ 2.8
ALYREF-202ENST00000505490 IL18RAPO95256 599 aa32.57■■■□□ 2.8
ALYREF-202ENST00000505490 POSTNQ15063 836 aa32.57■■■□□ 2.8
ALYREF-202ENST00000505490 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa32.57■■■□□ 2.8
ALYREF-202ENST00000505490 PRR23BQ6ZRT6 265 aa32.57■■■□□ 2.8
ALYREF-202ENST00000505490 SFR1Q86XK3 245 aa32.57■■■□□ 2.8
ALYREF-202ENST00000505490 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP32.57■■■□□ 2.8
ALYREF-202ENST00000505490 TTC8Q8TAM2 541 aa32.57■■■□□ 2.8
ALYREF-202ENST00000505490 CXorf38Q8TB03 319 aa32.57■■■□□ 2.8
ALYREF-202ENST00000505490 FAM200AQ8TCP9 573 aa32.57■■■□□ 2.8
ALYREF-202ENST00000505490 EPSTI1Q96J88 318 aa32.57■■■□□ 2.8
ALYREF-202ENST00000505490 SEL1LQ9UBV2 794 aa32.57■■■□□ 2.8
ALYREF-202ENST00000505490 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP32.57■■■□□ 2.8
ALYREF-202ENST00000505490 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP32.56■■■□□ 2.8
ALYREF-202ENST00000505490 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP32.56■■■□□ 2.8
ALYREF-202ENST00000505490 PTPAQ15257 358 aa32.56■■■□□ 2.8
ALYREF-202ENST00000505490 CSRP2Q16527 193 aa32.56■■■□□ 2.8
ALYREF-202ENST00000505490 SV2CQ496J9 727 aa32.56■■■□□ 2.8
ALYREF-202ENST00000505490 WDR5BQ86VZ2 330 aa32.56■■■□□ 2.8
ALYREF-202ENST00000505490 NETO1Q8TDF5 533 aa32.56■■■□□ 2.8
ALYREF-202ENST00000505490 GIPC2Q8TF65 315 aa32.56■■■□□ 2.8
ALYREF-202ENST00000505490 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP32.56■■■□□ 2.8
ALYREF-202ENST00000505490 DNAJC19Q96DA6 116 aa32.56■■■□□ 2.8
ALYREF-202ENST00000505490 GCNAQ96QF7 691 aa32.56■■■□□ 2.8
ALYREF-202ENST00000505490 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP32.56■■■□□ 2.8
ALYREF-202ENST00000505490 HPS4Q9NQG7 708 aa32.56■■■□□ 2.8
ALYREF-202ENST00000505490 SEMA4GQ9NTN9 838 aa32.56■■■□□ 2.8
ALYREF-202ENST00000505490 TMLHEQ9NVH6 421 aa32.56■■■□□ 2.8
ALYREF-202ENST00000505490 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP32.56■■■□□ 2.8
ALYREF-202ENST00000505490 STK17AQ9UEE5 414 aa32.56■■■□□ 2.8
ALYREF-202ENST00000505490 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP32.55■■■□□ 2.83e-7■■□□□ 13.3
ALYREF-202ENST00000505490 WNT7BP56706 349 aa32.55■■■□□ 2.8
ALYREF-202ENST00000505490 NLRP12P59046 1061 aa32.55■■■□□ 2.8
ALYREF-202ENST00000505490 TMEM196Q5HYL7 178 aa32.55■■■□□ 2.8
ALYREF-202ENST00000505490 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP32.55■■■□□ 2.8
ALYREF-202ENST00000505490 RASSF8Q8NHQ8 419 aa32.55■■■□□ 2.8
ALYREF-202ENST00000505490 POMGNT1Q8WZA1 660 aa32.55■■■□□ 2.8
ALYREF-202ENST00000505490 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP32.55■■■□□ 2.8
ALYREF-202ENST00000505490 SLC30A4O14863 429 aa32.54■■■□□ 2.8
ALYREF-202ENST00000505490 HOXC13P31276 330 aa32.54■■■□□ 2.8
ALYREF-202ENST00000505490 PNPLA4P41247 253 aa32.54■■■□□ 2.8
ALYREF-202ENST00000505490 KCNA1Q09470 495 aa32.54■■■□□ 2.8
ALYREF-202ENST00000505490 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP32.54■■■□□ 2.8
ALYREF-202ENST00000505490 ZNF560Q96MR9 790 aa32.54■■■□□ 2.8
ALYREF-202ENST00000505490 GKN1Q9NS71 199 aa32.54■■■□□ 2.8
ALYREF-202ENST00000505490 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP32.54■■■□□ 2.8
ALYREF-202ENST00000505490 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa32.54■■■□□ 2.8
ALYREF-202ENST00000505490 GREB1Q4ZG55 1949 aa32.53■■■□□ 2.8
ALYREF-202ENST00000505490 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa32.53■■■□□ 2.8
ALYREF-202ENST00000505490 DCDC2BA2VCK2 349 aa32.53■■■□□ 2.8
ALYREF-202ENST00000505490 CDR1P51861 262 aa32.53■■■□□ 2.8
ALYREF-202ENST00000505490 BRSK2Q8IWQ3 736 aa32.53■■■□□ 2.8
ALYREF-202ENST00000505490 PKMYT1Q99640 499 aa32.53■■■□□ 2.8
ALYREF-202ENST00000505490 KIF9Q9HAQ2 790 aa32.53■■■□□ 2.8
ALYREF-202ENST00000505490 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP32.53■■■□□ 2.8
ALYREF-202ENST00000505490 CCL26Q9Y258 94 aa32.53■■■□□ 2.8
ALYREF-202ENST00000505490 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP32.52■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 776 ms