RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436638.5

ECHDC1-208, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene ECHDC1, Length 766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ECHDC1-208	ENST00000436638	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	ITGB8	P26012	769 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	PPP1R2	P41236	205 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	6.69	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	ADGRE1	Q14246	886 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	MBTPS1	Q14703	1052 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	FAM187B	Q17R55	369 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	TSNAXIP1	Q2TAA8	658 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	SLFN12L	Q6IEE8	588 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	NOTUM	Q6P988	496 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNF365	Q70YC5	407 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	RELL1	Q8IUW5	271 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	TMEM161B	Q8NDZ6	487 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	GPT2	Q8TD30	523 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	FRS2	Q8WU20	508 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	CCDC51	Q96ER9	411 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	AGAP3	Q96P47	875 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	ADAM2	Q99965	735 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	FZD8	Q9H461	694 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	ST6GALNAC4	Q9H4F1	302 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	POLG2	Q9UHN1	485 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	TBX20	Q9UMR3	447 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	LZTS1	Q9Y250	596 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	UBE4B	O95155	1302 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	BIN1	O00499	593 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	DLL1	O00548	723 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	KLRC4	O43908	158 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	TSPAN1	O60635	241 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	MYB	P10242	640 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	EPHA1	P21709	976 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	RAB27A	P51159	221 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	GTF2B	Q00403	316 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	NFKBIB	Q15653	356 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZC2HC1C	Q53FD0	456 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	ISM2	Q6H9L7	571 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	CAVIN1	Q6NZI2	390 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZPBP2	Q6X784	338 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	HS2ST1	Q7LGA3	356 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	NELFCD	Q8IXH7	590 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	MYOCD	Q8IZQ8	938 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	TRIML1	Q8N9V2	468 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	RNF169	Q8NCN4	708 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	HPS3	Q969F9	1004 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	PGBD4	Q96DM1	585 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	CPB2	Q96IY4	423 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	CITED4	Q96RK1	184 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	SRA1	Q9HD15	236 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	LATS2	Q9NRM7	1088 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	MAN1B1	Q9UKM7	699 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	MAFF	Q9ULX9	164 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	ADGRA3	Q8IWK6	1321 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	TMEM238L	A0A1B0GVL6	79 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	ENPP3	O14638	875 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	PSMA7	O14818	248 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	CLDN3	O15551	220 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	B4GALT5	O43286	388 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	CALU	O43852	315 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	DNAJC6	O75061	913 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	TOM1L1	O75674	476 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	NPTXR	O95502	500 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	SKIL	P12757	684 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	ITGA4	P13612	1032 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	MAPK1	P28482	360 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	MAGEA8	P43361	318 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	SNRPF	P62306	86 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	SARNP	P82979	210 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	STK4	Q13043	487 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	ORC1	Q13415	861 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ECHDC1-208	ENST00000436638	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		6.67	□□□□□ -1.34

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