RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316939.2

GADD45GIP1-201, Transcript of GADD45G interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GADD45GIP1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DNAH12Q6ZR08 3092 aa23.19■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TNFRSF8P28908 595 aa23.18■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 THPOP40225 353 aa23.18■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 STILQ15468 1287 aa23.18■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa23.18■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa23.18■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CPNE8Q86YQ8 564 aa23.18■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C3orf20Q8ND61 904 aa23.18■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRAIPQ9BWF2 469 aa23.18■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ERVK-5Q9HDB9 667 aa23.18■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM53CQ9NYF3 392 aa23.18■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TMEM191CA6NGB0 347 aa23.17■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SPDYE4A6NLX3 237 aa23.17■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HSPA6P17066 643 aa23.17■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LRPAP1P30533 357 aa23.17■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RWDD2BP57060 319 aa23.17■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ORC1Q13415 861 aa23.17■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PTPN20Q4JDL3 420 aa23.17■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM26DQ5JW98 314 aa23.17■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 UNC93AQ86WB7 457 aa23.17■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PTGESO14684 152 aa23.17■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FKTNO75072 461 aa23.17■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CAND2O75155 1236 aa23.17■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MICAL2O94851 1124 aa23.17■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 INHAP05111 366 aa23.17■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PPP2R5EQ16537 467 aa23.17■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MAP9Q49MG5 647 aa23.17■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DNAJC24Q6P3W2 148 aa23.17■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LCLAT1Q6UWP7 414 aa23.17■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LIMS2Q7Z4I7 341 aa23.17■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AP1M1Q9BXS5 423 aa23.17■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa23.17■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SAGE1Q9NXZ1 904 aa23.17■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IP6K2Q9UHH9 426 aa23.17■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CYTH4Q9UIA0 394 aa23.17■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SOWAHAQ2M3V2 549 aa23.16■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SEL1L2Q5TEA6 688 aa23.16■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LHX8Q68G74 356 aa23.16■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PLVAPQ9BX97 442 aa23.16■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 WDR35Q9P2L0 1181 aa23.16■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 L1RE1Q9UN81 338 aa23.16■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SQORQ9Y6N5 450 aa23.16■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KPNA7A9QM74 516 aa23.15■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GPD2P43304 727 aa23.15■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TAF6P49848 677 aa23.15■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SV2CQ496J9 727 aa23.15■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GLT1D1Q96MS3 346 aa23.15■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FUT8Q9BYC5 575 aa23.15■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa23.14■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 M0QYV0 167 aa23.14■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PSTPIP1O43586 416 aa23.14■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PYGMP11217 842 aa23.14■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ITGA4P13612 1032 aa23.14■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GABRB2P47870 512 aa23.14■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC7A5Q01650 507 aa23.14■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KLHL7Q8IXQ5 586 aa23.14■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C18orf8Q96DM3 657 aa23.14■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RNF19AQ9NV58 838 aa23.14■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC38A7Q9NVC3 462 aa23.14■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PADI3Q9ULW8 664 aa23.14■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NOD1Q9Y239 953 aa23.14■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP23.14■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SART1O43290 800 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RAD51CO43502 376 aa23.14■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF623O75123 536 aa23.14■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZMYND10O75800 440 aa23.14■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RAB27AP51159 221 aa23.14■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CBX1P83916 185 aa23.14■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PAK2Q13177 524 aa23.14■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NIPA2Q8N8Q9 360 aa23.14■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GSTCDQ8NEC7 633 aa23.14■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CPXM1Q96SM3 734 aa23.14■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GDF3Q9NR23 364 aa23.14■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GIT1Q9Y2X7 761 aa23.14■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SPTLC1O15269 473 aa23.13■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GLI1P08151 1106 aa23.13■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PDCLQ13371 301 aa23.13■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DSC3Q14574 896 aa23.13■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LPIN1Q14693 890 aa23.13■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CYP4A22Q5TCH4 519 aa23.13■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RHOT1Q8IXI2 618 aa23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms