RNA–Protein interactions for RNA: YML028W

TSA1, Transcript of Thioredoxin peroxidase, yeast

Gene TSA1, Length 591 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TSA1	YML028W	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	ATG33	Q06485	197 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	CSI2	Q08054	341 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	YOR015W	Q12169	119 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	RAX2	Q12465	1220 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	DIF1	O13577	133 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	RPS25B	P0C0T4	108 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	QCR9	P22289	66 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	CNB1	P25296	175 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	ACP1	P32463	125 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	SHB17	P36136	271 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	RIB5	P38145	238 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	YGR269W	P40326	108 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	HXT14	P42833	540 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	YAP1802	P53309	568 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	CAF40	P53829	373 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	DYN2	Q02647	92 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	STD1	Q02794	444 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	YML108W	Q03759	105 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	FRQ1	Q06389	190 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	GEP5	Q12393	293 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	RPS25A	Q3E792	108 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	Q0297	Q9ZZV8	51 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	SPO13	P23624	291 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	CDC50	P25656	391 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	AHT1	P29589	182 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	WSS1	P38838	269 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	FLO5	P38894	1075 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	POG1	P40473	351 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	YIL024C	P40543	189 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	YOR352W	Q08816	343 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	POC4	Q12245	148 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	PCC1	Q3E833	88 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	ELO2	P25358	347 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	BNA1	P47096	177 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	CRH1	P53301	507 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	PAU4	P53427	120 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	RAD28	Q12021	506 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	USV1	Q12132	391 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	ATO3	Q12359	275 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	PHO85	P17157	305 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	FPR2	P32472	135 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	VMA11	P32842	164 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	YJR015W	P47090	510 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	YJR096W	P47137	282 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	BOR1	P53838	576 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	ARR3	Q06598	404 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	PAU1	P0CE88	120 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	PAU14	P0CE89	120 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	PAU6	P0CE90	120 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	PAU18	P0CE91	120 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	PAU8	P0CE92	120 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	PAU11	P0CE93	120 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	MRS3	P10566	314 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	DAL3	P32459	195 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	YBL059W	P34224	193 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	RPL14A	P36105	138 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	QDR3	P38227	689 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	PAU13	P38725	120 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	RPL14B	P38754	138 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	MIC27	P50945	234 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	YGR151C	P53287	111 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	PAU10	Q03050	120 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	AVO2	Q04749	426 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	RXT3	Q07458	294 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	NDE2	Q07500	545 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	PAU20	Q08322	120 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	JID1	Q12350	301 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	POM34	Q12445	299 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	PAU9	Q3E770	120 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TSA1	YML028W	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	SEC59	P20048	519 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	YBL071C	P38185	102 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	DER1	P38307	211 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	RTS2	P40962	232 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	SAS2	P40963	338 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	LST8	P41318	303 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	YJL163C	P46996	555 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	YNL234W	P53857	426 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	SNO1	Q03144	224 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	YMR007W	Q03675	126 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	ATC1	Q04005	294 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	SHH3	Q04487	196 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	YMR253C	Q04835	414 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TSA1	YML028W	CTR3	Q06686	241 aa		4.9	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 25.7 ms