RNA–Protein interactions for RNA: YML013W

UBX2, Transcript of Bridging factor involved in ER-associated protein degradation (ERAD), yeast

Gene UBX2, Length 1,755 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UBX2	YML013W	RPL13B	P40212	199 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
UBX2	YML013W	SFH5	P47008	294 aa		4.74	□□□□□ -1.65
UBX2	YML013W	YIP1	P53039	248 aa		4.74	□□□□□ -1.65
UBX2	YML013W	DYN2	Q02647	92 aa		4.74	□□□□□ -1.65
UBX2	YML013W	INP1	Q03694	420 aa		4.74	□□□□□ -1.65
UBX2	YML013W	LOA1	Q06508	300 aa		4.74	□□□□□ -1.65
UBX2	YML013W	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
UBX2	YML013W	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
UBX2	YML013W	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
UBX2	YML013W	HSP10	P38910	106 aa		4.73	□□□□□ -1.65
UBX2	YML013W	YEA6	P39953	335 aa		4.73	□□□□□ -1.65
UBX2	YML013W	MST27	P53176	234 aa		4.73	□□□□□ -1.65
UBX2	YML013W	ALG13	P53178	202 aa		4.73	□□□□□ -1.65
UBX2	YML013W	MTM1	P53320	366 aa		4.73	□□□□□ -1.65
UBX2	YML013W	BOR1	P53838	576 aa		4.73	□□□□□ -1.65
UBX2	YML013W	BUD25	P85052	153 aa		4.73	□□□□□ -1.65
UBX2	YML013W	MRX8	Q05473	314 aa		4.73	□□□□□ -1.65
UBX2	YML013W	TAZ1	Q06510	381 aa		4.73	□□□□□ -1.65
UBX2	YML013W	YCR075W-A	Q3E830	75 aa		4.73	□□□□□ -1.65
UBX2	YML013W	ODC2	Q99297	307 aa		4.73	□□□□□ -1.65
UBX2	YML013W	YPR096C	O13587	100 aa		4.73	□□□□□ -1.65
UBX2	YML013W	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
UBX2	YML013W	COX9	P07255	59 aa		4.73	□□□□□ -1.65
UBX2	YML013W	MCH2	P36032	473 aa		4.73	□□□□□ -1.65
UBX2	YML013W	RPL14A	P36105	138 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
UBX2	YML013W	YCR041W	P37265	110 aa		4.73	□□□□□ -1.65
UBX2	YML013W	YBR292C	P38357	123 aa		4.73	□□□□□ -1.65
UBX2	YML013W	RPL14B	P38754	138 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
UBX2	YML013W	FLO5	P38894	1075 aa		4.73	□□□□□ -1.65
UBX2	YML013W	HMF1	P40037	129 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
UBX2	YML013W	BAT2	P47176	376 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
UBX2	YML013W	YGR015C	P53208	328 aa		4.73	□□□□□ -1.65
UBX2	YML013W	PDR17	P53844	350 aa		4.73	□□□□□ -1.65
UBX2	YML013W	RNH201	P53942	307 aa		4.73	□□□□□ -1.65
UBX2	YML013W	BET5	Q03630	159 aa		4.73	□□□□□ -1.65
UBX2	YML013W	SCW10	Q04951	389 aa		4.73	□□□□□ -1.65
UBX2	YML013W	GAT3	Q07928	141 aa		4.73	□□□□□ -1.65
UBX2	YML013W	YOL024W	Q08172	172 aa		4.73	□□□□□ -1.65
UBX2	YML013W	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
UBX2	YML013W	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
UBX2	YML013W	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
UBX2	YML013W	ERG4	P25340	473 aa		4.72	□□□□□ -1.65
UBX2	YML013W	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
UBX2	YML013W	OCH1	P31755	480 aa		4.72	□□□□□ -1.65
UBX2	YML013W	QRI5	P32344	111 aa		4.72	□□□□□ -1.65
UBX2	YML013W	MRP49	P32388	137 aa		4.72	□□□□□ -1.65
UBX2	YML013W	PAU16	P35994	123 aa		4.72	□□□□□ -1.65
UBX2	YML013W	MCR1	P36060	302 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
UBX2	YML013W	SIM1	P40472	476 aa		4.72	□□□□□ -1.65
UBX2	YML013W	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
UBX2	YML013W	YPL062W	Q02781	134 aa		4.72	□□□□□ -1.65
UBX2	YML013W	YMR166C	Q03829	368 aa		4.72	□□□□□ -1.65
UBX2	YML013W	YDL218W	Q07629	317 aa		4.72	□□□□□ -1.65
UBX2	YML013W	THI72	Q08579	599 aa		4.72	□□□□□ -1.65
UBX2	YML013W	VPS13	Q07878	3144 aa		4.72	□□□□□ -1.65
UBX2	YML013W	RPS28B	P0C0X0	67 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	CPT1	P17898	393 aa		4.71	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	SLM6	P38343	150 aa		4.71	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	YEA4	P40004	342 aa		4.71	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	YJR015W	P47090	510 aa		4.71	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	APS2	Q00381	147 aa		4.71	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	FSH2	Q05015	223 aa		4.71	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	YPR114W	Q06107	315 aa		4.71	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	FRE8	Q12209	686 aa		4.71	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	RPS28A	Q3E7X9	67 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	YOL162W	P0CF19	215 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	YKL102C	P34249	101 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	UMP1	P38293	148 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	RPB11	P38902	120 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	YIL012W	P40551	113 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	TTI2	P47168	421 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	ERG25	P53045	309 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	EMC4	P53073	190 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	MMS2	P53152	137 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	THI74	Q04083	370 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	DIC1	Q06143	298 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	YPR174C	Q06616	221 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	ADH1	P00330	348 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	YCR007C	P25354	239 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	YER134C	P40081	178 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	GPI14	P47088	403 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	CDH1	P53197	566 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	PAU4	P53427	120 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	SYM1	Q06563	197 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	YPR011C	Q12251	326 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	YOS1	Q3E834	85 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	PAU1	P0CE88	120 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	PAU14	P0CE89	120 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	PAU6	P0CE90	120 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	PAU18	P0CE91	120 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	PAU8	P0CE92	120 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	PAU11	P0CE93	120 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UBX2	YML013W	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66

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