RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BMP6P22004 513 aa17.39■□□□□ 0.37
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC47A2Q86VL8 602 aa17.39■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP17.39■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 A0A0U1RQJ8 604 aa17.39■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 F8VZ95 297 aa17.39■□□□□ 0.37
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ARHGEF6Q15052 776 aa17.38■□□□□ 0.37
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa17.38■□□□□ 0.37
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa17.38■□□□□ 0.37
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF235Q14590 738 aa17.37■□□□□ 0.37
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EMC1Q8N766 993 aa17.37■□□□□ 0.37
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EGFL8Q99944 293 aa17.37■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LRRC4BQ9NT99 713 aa17.37■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HBP1O60381 514 aa17.36■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PCSK7Q16549 785 aa17.36■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC7A14Q8TBB6 771 aa17.36■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PDCD2LQ9BRP1 358 aa17.36■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MGEA5O60502 916 aa17.36■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 E2F6O75461 281 aa17.36■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NPTXRO95502 500 aa17.36■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ACCSLQ4AC99 568 aa17.36■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NT5DC1Q5TFE4 455 aa17.36■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LRRC34Q8IZ02 419 aa17.36■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RNF217Q8TC41 542 aa17.36■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RSAD1Q9HA92 442 aa17.36■□□□□ 0.37
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