RNA–Protein interactions for RNA: YPR069C

SPE3, Transcript of Spermidine synthase, yeastyeast

Gene SPE3, Length 882 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE3YPR069C MIT1P40002 666 aa5.33□□□□□ -1.56
SPE3YPR069C IRC24P40580 263 aa5.33□□□□□ -1.56
SPE3YPR069C MSE1P48525 536 aa5.33□□□□□ -1.56
SPE3YPR069C SSU72P53538 206 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
SPE3YPR069C THI74Q04083 370 aa5.33□□□□□ -1.56
SPE3YPR069C PEX10Q05568 337 aa5.33□□□□□ -1.56
SPE3YPR069C PEX27Q08580 376 aa5.33□□□□□ -1.56
SPE3YPR069C LAG1P38703 411 aa5.32□□□□□ -1.56
SPE3YPR069C YPI1P43587 155 aa5.32□□□□□ -1.56
SPE3YPR069C ARP3P47117 449 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
SPE3YPR069C SMX3P54999 86 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
SPE3YPR069C TY1A-DR2Q03964 440 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
SPE3YPR069C FSH2Q05015 223 aa5.32□□□□□ -1.56
SPE3YPR069C YPL199CQ08954 240 aa5.32□□□□□ -1.56
SPE3YPR069C ATG31Q12421 196 aa5.32□□□□□ -1.56
SPE3YPR069C TAR1Q8TGM6 124 aa5.32□□□□□ -1.56
SPE3YPR069C CAP2P13517 287 aa5.31□□□□□ -1.56
SPE3YPR069C POP8P38208 133 aa5.31□□□□□ -1.56
SPE3YPR069C YBR184WP38299 523 aa5.31□□□□□ -1.56
SPE3YPR069C CAX4P53223 239 aa5.31□□□□□ -1.56
SPE3YPR069C NCE103P53615 221 aa5.31□□□□□ -1.56
SPE3YPR069C RTT103Q05543 409 aa5.31□□□□□ -1.56
SPE3YPR069C YGL258W-AQ3E740 77 aa5.31□□□□□ -1.56
SPE3YPR069C SRL3P36167 246 aa5.3□□□□□ -1.56
SPE3YPR069C QDR3P38227 689 aa5.3□□□□□ -1.56
SPE3YPR069C DOG2P38773 246 aa5.3□□□□□ -1.56
SPE3YPR069C DOG1P38774 246 aa5.3□□□□□ -1.56
SPE3YPR069C YAR068WP39564 161 aa5.3□□□□□ -1.56
SPE3YPR069C HPA3P39979 161 aa5.3□□□□□ -1.56
SPE3YPR069C DFG10P40526 253 aa5.3□□□□□ -1.56
SPE3YPR069C AGX1P43567 385 aa5.3□□□□□ -1.56
SPE3YPR069C IRC18P47056 224 aa5.3□□□□□ -1.56
SPE3YPR069C SWT21P53873 357 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
SPE3YPR069C TRI1Q05024 226 aa5.3□□□□□ -1.56
SPE3YPR069C PAM18Q07914 168 aa5.3□□□□□ -1.56
SPE3YPR069C YBR255C-AQ3E776 120 aa5.3□□□□□ -1.56
SPE3YPR069C CYC3P06182 269 aa5.29□□□□□ -1.56
SPE3YPR069C LSM12P38828 187 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
SPE3YPR069C AIM25P47140 327 aa5.29□□□□□ -1.56
SPE3YPR069C BUL1P48524 976 aa5.29□□□□□ -1.56
SPE3YPR069C GTF1P53260 183 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
SPE3YPR069C DCP1Q12517 231 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
SPE3YPR069C QCR2P07257 368 aa5.28□□□□□ -1.56
SPE3YPR069C PAN3P36102 679 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
SPE3YPR069C IMD2P38697 523 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
SPE3YPR069C YER137CP40083 148 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
SPE3YPR069C ARO8P53090 500 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
SPE3YPR069C MSO1P53604 210 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
SPE3YPR069C ERV25P54837 211 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
SPE3YPR069C EST3Q03096 181 aa5.28□□□□□ -1.56
SPE3YPR069C FMP42Q04991 504 aa5.28□□□□□ -1.56
SPE3YPR069C ATG39Q06159 398 aa5.28□□□□□ -1.56
SPE3YPR069C YPR013CQ12145 317 aa5.28□□□□□ -1.56
SPE3YPR069C ATG5Q12380 294 aa5.28□□□□□ -1.56
SPE3YPR069C CYC1P00044 109 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
SPE3YPR069C NRG2P38082 220 aa5.27□□□□□ -1.57
SPE3YPR069C COS8P38723 381 aa5.27□□□□□ -1.57
SPE3YPR069C SER2P42941 309 aa5.27□□□□□ -1.57
SPE3YPR069C YFR035CP43608 114 aa5.27□□□□□ -1.57
SPE3YPR069C ALG13P53178 202 aa5.27□□□□□ -1.57
SPE3YPR069C FEX1Q08913 375 aa5.27□□□□□ -1.57
SPE3YPR069C FEX2Q08991 375 aa5.27□□□□□ -1.57
SPE3YPR069C CDS1P38221 457 aa5.26□□□□□ -1.57
SPE3YPR069C POR2P40478 281 aa5.26□□□□□ -1.57
SPE3YPR069C TDA4P47153 279 aa5.26□□□□□ -1.57
SPE3YPR069C YGR050CP53231 118 aa5.26□□□□□ -1.57
SPE3YPR069C RRG8Q06109 277 aa5.26□□□□□ -1.57
SPE3YPR069C NGL1Q08213 363 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
SPE3YPR069C TIM18Q08749 192 aa5.26□□□□□ -1.57
SPE3YPR069C HTZ1Q12692 134 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
SPE3YPR069C PUP1P25043 261 aa5.25□□□□□ -1.57
SPE3YPR069C MLF3P32047 452 aa5.25□□□□□ -1.57
SPE3YPR069C RRT1P38192 103 aa5.25□□□□□ -1.57
SPE3YPR069C ERV15P38312 142 aa5.25□□□□□ -1.57
SPE3YPR069C BFR1P38934 470 aaKnown RBP RIP-Chip data5.25□□□□□ -1.57not detected
SPE3YPR069C HAM1P47119 197 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
SPE3YPR069C NIF3P53081 288 aa5.25□□□□□ -1.57
SPE3YPR069C TPN1P53099 579 aa5.25□□□□□ -1.57
SPE3YPR069C MCM21Q06675 368 aa5.25□□□□□ -1.57
SPE3YPR069C RDS3Q06835 107 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
SPE3YPR069C YOR352WQ08816 343 aa5.25□□□□□ -1.57
SPE3YPR069C YPS3Q12303 508 aa5.25□□□□□ -1.57
SPE3YPR069C NKP1Q12493 238 aa5.25□□□□□ -1.57
SPE3YPR069C YCP4P25349 247 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
SPE3YPR069C YBL071CP38185 102 aa5.24□□□□□ -1.57
SPE3YPR069C YAP1802P53309 568 aa5.24□□□□□ -1.57
SPE3YPR069C FYV6P53913 173 aa5.24□□□□□ -1.57
SPE3YPR069C COX12Q01519 83 aa5.24□□□□□ -1.57
SPE3YPR069C RXT3Q07458 294 aa5.24□□□□□ -1.57
SPE3YPR069C YCT1Q12235 531 aa5.24□□□□□ -1.57
SPE3YPR069C YCR016WP25617 290 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
SPE3YPR069C MRP17P28778 131 aa5.23□□□□□ -1.57
SPE3YPR069C SPT14P32363 452 aa5.23□□□□□ -1.57
SPE3YPR069C IPI1P38803 334 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
SPE3YPR069C RTC3P38804 111 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
SPE3YPR069C SIM1P40472 476 aa5.23□□□□□ -1.57
SPE3YPR069C LSM7P53905 115 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
SPE3YPR069C DYN2Q02647 92 aa5.23□□□□□ -1.57
SPE3YPR069C PHO92Q06390 306 aa5.23□□□□□ -1.57
SPE3YPR069C IES3Q12345 250 aa5.23□□□□□ -1.57
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