RNA–Protein interactions for RNA: YJL024C

APS3, Transcript of Small subunit of the clathrin-associated adaptor complex AP-3, yeast

Gene APS3, Length 585 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
APS3	YJL024C	APA2	P22108	325 aa		4.7	□□□□□ -1.66
APS3	YJL024C	SIP1	P32578	815 aa		4.7	□□□□□ -1.66
APS3	YJL024C	YEA4	P40004	342 aa		4.7	□□□□□ -1.66
APS3	YJL024C	YGR050C	P53231	118 aa		4.7	□□□□□ -1.66
APS3	YJL024C	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
APS3	YJL024C	TIM10	P87108	93 aa		4.7	□□□□□ -1.66
APS3	YJL024C	ODC1	Q03028	310 aa		4.7	□□□□□ -1.66
APS3	YJL024C	YMR090W	Q04304	227 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
APS3	YJL024C	YPD1	Q07688	167 aa		4.7	□□□□□ -1.66
APS3	YJL024C	FCF2	Q12035	217 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
APS3	YJL024C	YDL009C	Q12210	107 aa		4.7	□□□□□ -1.66
APS3	YJL024C	PRR2	Q12310	699 aa		4.7	□□□□□ -1.66
APS3	YJL024C	Q0297	Q9ZZV8	51 aa		4.7	□□□□□ -1.66
APS3	YJL024C	RPL9A	P05738	191 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
APS3	YJL024C	YCR025C	P25352	136 aa		4.69	□□□□□ -1.66
APS3	YJL024C	IES6	P32617	166 aa		4.69	□□□□□ -1.66
APS3	YJL024C	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
APS3	YJL024C	ECM31	P38122	312 aa		4.69	□□□□□ -1.66
APS3	YJL024C	YHR138C	P38841	114 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
APS3	YJL024C	DFG10	P40526	253 aa		4.69	□□□□□ -1.66
APS3	YJL024C	YIR020C	P40575	100 aa		4.69	□□□□□ -1.66
APS3	YJL024C	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
APS3	YJL024C	RPL9B	P51401	191 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
APS3	YJL024C	YGR045C	P53229	120 aa		4.69	□□□□□ -1.66
APS3	YJL024C	CRH1	P53301	507 aa		4.69	□□□□□ -1.66
APS3	YJL024C	HCH1	P53834	153 aa		4.69	□□□□□ -1.66
APS3	YJL024C	APJ1	P53940	528 aa		4.69	□□□□□ -1.66
APS3	YJL024C	FSH2	Q05015	223 aa		4.69	□□□□□ -1.66
APS3	YJL024C	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
APS3	YJL024C	YHR213W-A	Q8TGT4	77 aa		4.69	□□□□□ -1.66
APS3	YJL024C	BPH1	P25356	2167 aa		4.68	□□□□□ -1.66
APS3	YJL024C	YDR157W	A0A023PZE8	133 aa		4.68	□□□□□ -1.66
APS3	YJL024C	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
APS3	YJL024C	EMC5	P40540	141 aa		4.68	□□□□□ -1.66
APS3	YJL024C	SNN1	P48232	102 aa		4.68	□□□□□ -1.66
APS3	YJL024C	YGL114W	P53134	725 aa		4.68	□□□□□ -1.66
APS3	YJL024C	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
APS3	YJL024C	USV1	Q12132	391 aa		4.68	□□□□□ -1.66
APS3	YJL024C	VMA9	Q3E7B6	73 aa		4.68	□□□□□ -1.66
APS3	YJL024C	YOS1	Q3E834	85 aa		4.68	□□□□□ -1.66
APS3	YJL024C	ADE8	P04161	214 aa		4.67	□□□□□ -1.66
APS3	YJL024C	ZRC1	P20107	442 aa		4.67	□□□□□ -1.66
APS3	YJL024C	PMU1	P36069	295 aa		4.67	□□□□□ -1.66
APS3	YJL024C	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
APS3	YJL024C	COX15	P40086	486 aa		4.67	□□□□□ -1.66
APS3	YJL024C	PDR17	P53844	350 aa		4.67	□□□□□ -1.66
APS3	YJL024C	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
APS3	YJL024C	ERV25	P54837	211 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
APS3	YJL024C	YCL001W-A	P87012	153 aa		4.67	□□□□□ -1.66
APS3	YJL024C	MIX17	Q03667	156 aa		4.67	□□□□□ -1.66
APS3	YJL024C	IRC25	Q07951	179 aa		4.67	□□□□□ -1.66
APS3	YJL024C	CSI2	Q08054	341 aa		4.67	□□□□□ -1.66
APS3	YJL024C	AGC1	Q12482	902 aa		4.67	□□□□□ -1.66
APS3	YJL024C	COX19	Q3E731	98 aa		4.67	□□□□□ -1.66
APS3	YJL024C	URA5	P13298	226 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
APS3	YJL024C	UPS2	P35200	230 aa		4.66	□□□□□ -1.66
APS3	YJL024C	PSD1	P39006	500 aa		4.66	□□□□□ -1.66
APS3	YJL024C	YGR269W	P40326	108 aa		4.66	□□□□□ -1.66
APS3	YJL024C	ERG25	P53045	309 aa		4.66	□□□□□ -1.66
APS3	YJL024C	YNR066C	P53752	436 aa		4.66	□□□□□ -1.66
APS3	YJL024C	YNL234W	P53857	426 aa		4.66	□□□□□ -1.66
APS3	YJL024C	DYN2	Q02647	92 aa		4.66	□□□□□ -1.66
APS3	YJL024C	STD1	Q02794	444 aa		4.66	□□□□□ -1.66
APS3	YJL024C	DCS1	Q06151	350 aa		4.66	□□□□□ -1.66
APS3	YJL024C	YDL242W	Q07746	117 aa		4.66	□□□□□ -1.66
APS3	YJL024C	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
APS3	YJL024C	POC4	Q12245	148 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
APS3	YJL024C	ATO3	Q12359	275 aa		4.66	□□□□□ -1.66
APS3	YJL024C	YGL258W-A	Q3E740	77 aa		4.66	□□□□□ -1.66
APS3	YJL024C	SPO24	Q3E752	67 aa		4.66	□□□□□ -1.66
APS3	YJL024C	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		4.66	□□□□□ -1.66
APS3	YJL024C	URA2	P07259	2214 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
APS3	YJL024C	FCY2	P17064	533 aa		4.65	□□□□□ -1.67
APS3	YJL024C	AHT1	P29589	182 aa		4.65	□□□□□ -1.67
APS3	YJL024C	TCA17	P32613	152 aa		4.65	□□□□□ -1.67
APS3	YJL024C	VMA11	P32842	164 aa		4.65	□□□□□ -1.67
APS3	YJL024C	YHL044W	P38727	235 aa		4.65	□□□□□ -1.67
APS3	YJL024C	SPC25	P40014	221 aa		4.65	□□□□□ -1.67
APS3	YJL024C	YJR056C	P47115	236 aa		4.65	□□□□□ -1.67
APS3	YJL024C	MCM22	P47167	239 aa		4.65	□□□□□ -1.67
APS3	YJL024C	ADD37	Q03233	198 aa		4.65	□□□□□ -1.67
APS3	YJL024C	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
APS3	YJL024C	TMA10	Q06177	86 aa		4.65	□□□□□ -1.67
APS3	YJL024C	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
APS3	YJL024C	FRQ1	Q06389	190 aa		4.65	□□□□□ -1.67
APS3	YJL024C	ARR2	Q06597	130 aa		4.65	□□□□□ -1.67
APS3	YJL024C	YOR015W	Q12169	119 aa		4.65	□□□□□ -1.67
APS3	YJL024C	YPS3	Q12303	508 aa		4.65	□□□□□ -1.67
APS3	YJL024C	YPR071W	Q12346	211 aa		4.65	□□□□□ -1.67
APS3	YJL024C	RAX2	Q12465	1220 aa		4.65	□□□□□ -1.67
APS3	YJL024C	HBN1	Q96VH4	193 aa		4.65	□□□□□ -1.67
APS3	YJL024C	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
APS3	YJL024C	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
APS3	YJL024C	LDS1	P31379	325 aa		4.64	□□□□□ -1.67
APS3	YJL024C	MSK1	P32048	576 aa		4.64	□□□□□ -1.67
APS3	YJL024C	YKR045C	P36138	183 aa		4.64	□□□□□ -1.67
APS3	YJL024C	SHG1	P38337	142 aa		4.64	□□□□□ -1.67
APS3	YJL024C	YBR292C	P38357	123 aa		4.64	□□□□□ -1.67
APS3	YJL024C	WSS1	P38838	269 aa		4.64	□□□□□ -1.67
APS3	YJL024C	FLO5	P38894	1075 aa		4.64	□□□□□ -1.67

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