RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555904.1

ABCD4-223, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, human

TSL 3

Gene ABCD4, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCD4-223	ENST00000555904	LINC00271	P0C7V0	271 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ABCD4-223	ENST00000555904	CA8	P35219	290 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ABCD4-223	ENST00000555904	ASPA	P45381	313 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ABCD4-223	ENST00000555904	ZNF75D	P51815	510 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ABCD4-223	ENST00000555904	ERVK-21	P61565	698 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ABCD4-223	ENST00000555904	PLCB3	Q01970	1234 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ABCD4-223	ENST00000555904	YWHAH	Q04917	246 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
ABCD4-223	ENST00000555904	UBE3A	Q05086	875 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ABCD4-223	ENST00000555904	KCNMA1	Q12791	1236 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ABCD4-223	ENST00000555904	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ABCD4-223	ENST00000555904	TRIM14	Q14142	442 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ABCD4-223	ENST00000555904	SPECC1L	Q69YQ0	1117 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ABCD4-223	ENST00000555904	RRAGA	Q7L523	313 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ABCD4-223	ENST00000555904	DRC7	Q8IY82	874 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ABCD4-223	ENST00000555904	SPATA18	Q8TC71	538 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ABCD4-223	ENST00000555904	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
ABCD4-223	ENST00000555904	JAKMIP2	Q96AA8	810 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ABCD4-223	ENST00000555904	MRFAP1L1	Q96HT8	127 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ABCD4-223	ENST00000555904	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ABCD4-223	ENST00000555904	NUP58	Q9BVL2	599 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ABCD4-223	ENST00000555904	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
ABCD4-223	ENST00000555904	POLI	Q9UNA4	740 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ABCD4-223	ENST00000555904	LZTS1	Q9Y250	596 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ABCD4-223	ENST00000555904	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ABCD4-223	ENST00000555904	SIK3	Q9Y2K2	1263 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ABCD4-223	ENST00000555904	UCHL5	Q9Y5K5	329 aa	Known RBP eCLIP	13.4	□□□□□ -0.26
ABCD4-223	ENST00000555904	ITIH6	Q6UXX5	1313 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ABCD4-223	ENST00000555904	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ABCD4-223	ENST00000555904		H7C4K7	107 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ABCD4-223	ENST00000555904	LPXN	O60711	386 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ABCD4-223	ENST00000555904	TACC1	O75410	805 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ABCD4-223	ENST00000555904	SOD2	P04179	222 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ABCD4-223	ENST00000555904	UCHL3	P15374	230 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ABCD4-223	ENST00000555904	TYMP	P19971	482 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ABCD4-223	ENST00000555904	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
ABCD4-223	ENST00000555904	LHX1	P48742	406 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ABCD4-223	ENST00000555904	GLUD2	P49448	558 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ABCD4-223	ENST00000555904	KLK7	P49862	253 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ABCD4-223	ENST00000555904	CREM	Q03060	361 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ABCD4-223	ENST00000555904	SOWAHA	Q2M3V2	549 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ABCD4-223	ENST00000555904	KLHDC7A	Q5VTJ3	777 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ABCD4-223	ENST00000555904	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ABCD4-223	ENST00000555904	OVOS1	Q6IE37	1185 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ABCD4-223	ENST00000555904	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ABCD4-223	ENST00000555904	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ABCD4-223	ENST00000555904	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ABCD4-223	ENST00000555904	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ABCD4-223	ENST00000555904	VPS52	Q8N1B4	723 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ABCD4-223	ENST00000555904	THEM5	Q8N1Q8	247 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ABCD4-223	ENST00000555904	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ABCD4-223	ENST00000555904	ZNF397	Q8NF99	534 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
ABCD4-223	ENST00000555904	ARNTL2	Q8WYA1	636 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ABCD4-223	ENST00000555904	TATDN2	Q93075	761 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ABCD4-223	ENST00000555904	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ABCD4-223	ENST00000555904	SPAG5	Q96R06	1193 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ABCD4-223	ENST00000555904	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ABCD4-223	ENST00000555904	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
ABCD4-223	ENST00000555904	BCO2	Q9BYV7	579 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ABCD4-223	ENST00000555904	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ABCD4-223	ENST00000555904	SMYD3	Q9H7B4	428 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ABCD4-223	ENST00000555904	APOBEC3G	Q9HC16	384 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
ABCD4-223	ENST00000555904	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ABCD4-223	ENST00000555904	FBXL5	Q9UKA1	691 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ABCD4-223	ENST00000555904	DNAJC12	Q9UKB3	198 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ABCD4-223	ENST00000555904	TMEM265	A0A087WTH1	108 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ABCD4-223	ENST00000555904	LRRN2	O75325	713 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ABCD4-223	ENST00000555904	ARHGEF15	O94989	841 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ABCD4-223	ENST00000555904	ADCY5	O95622	1261 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ABCD4-223	ENST00000555904	CYP11A1	P05108	521 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ABCD4-223	ENST00000555904	WEE2	P0C1S8	567 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ABCD4-223	ENST00000555904	FAM163B	P0C2L3	166 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ABCD4-223	ENST00000555904	CD58	P19256	250 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ABCD4-223	ENST00000555904	FGFR3	P22607	806 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ABCD4-223	ENST00000555904	PCSK1	P29120	753 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ABCD4-223	ENST00000555904	RAP1GAP	P47736	663 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ABCD4-223	ENST00000555904	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
ABCD4-223	ENST00000555904	GPM6B	Q13491	265 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ABCD4-223	ENST00000555904	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ABCD4-223	ENST00000555904	WSCD1	Q658N2	575 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ABCD4-223	ENST00000555904	ZNF280D	Q6N043	979 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ABCD4-223	ENST00000555904	VSTM4	Q8IW00	320 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ABCD4-223	ENST00000555904	ARHGEF19	Q8IW93	802 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ABCD4-223	ENST00000555904	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ABCD4-223	ENST00000555904	ARID3A	Q99856	593 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ABCD4-223	ENST00000555904	CERS4	Q9HA82	394 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ABCD4-223	ENST00000555904	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
ABCD4-223	ENST00000555904	SIX2	Q9NPC8	291 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ABCD4-223	ENST00000555904	TLR9	Q9NR96	1032 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ABCD4-223	ENST00000555904	MRPL17	Q9NRX2	175 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
ABCD4-223	ENST00000555904	CISH	Q9NSE2	258 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ABCD4-223	ENST00000555904	CEP72	Q9P209	647 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ABCD4-223	ENST00000555904	L1RE1	Q9UN81	338 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ABCD4-223	ENST00000555904	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
ABCD4-223	ENST00000555904	CEP290	O15078	2479 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ABCD4-223	ENST00000555904		A8MXQ7	604 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ABCD4-223	ENST00000555904		H3BNC9	293 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ABCD4-223	ENST00000555904	C2CD2L	O14523	706 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ABCD4-223	ENST00000555904	AP5Z1	O43299	807 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ABCD4-223	ENST00000555904	KRT5	P13647	590 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ABCD4-223	ENST00000555904	WARS	P23381	471 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27

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