RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542443.5

TRDN-204, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-204ENST00000542443 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 ROCK1Q13464 1354 aa6.2□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa6.2□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa6.2□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 CAPN8A6NHC0 703 aa6.2□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa6.2□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 H3BUI4 141 aa6.2□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 MYL1P05976 194 aa6.2□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 SBK3P0C264 359 aa6.2□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 PRDX5P30044 214 aa6.2□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 GPSM2P81274 684 aa6.2□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.2□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 MAP9Q49MG5 647 aa6.2□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 LAIR1Q6GTX8 287 aa6.2□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 SWSAP1Q6NVH7 229 aa6.2□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 Q6ZPA2 131 aa6.2□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 SH2D3CQ8N5H7 860 aa6.2□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 ZFP28Q8NHY6 868 aa6.2□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 ARMT1Q9H993 441 aa6.2□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 SORCS3Q9UPU3 1222 aa6.2□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 NUDCQ9Y266 331 aa6.2□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa6.19□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 DNMBPQ6XZF7 1577 aa6.19□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 TMEM191CA6NGB0 347 aa6.19□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 FOXN1O15353 648 aa6.19□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 POMCP01189 267 aa6.19□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 SLC6A4P31645 630 aa6.19□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 RAP2BP61225 183 aa6.19□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 FGL2Q14314 439 aa6.19□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 UBXN2BQ14CS0 331 aa6.19□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 EFCAB12Q6NXP0 572 aa6.19□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 KSR2Q6VAB6 950 aa6.19□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 CCDC149Q6ZUS6 474 aa6.19□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 HTR3DQ70Z44 454 aa6.19□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 MAEAQ7L5Y9 396 aa6.19□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa6.19□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 MRGPREQ86SM8 312 aa6.19□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 DNAJC10Q8IXB1 793 aa6.19□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 SYNE4Q8N205 404 aa6.19□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 CPT1CQ8TCG5 803 aa6.19□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 FBXO34Q9NWN3 711 aa6.19□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 FHOD3Q2V2M9 1422 aa6.18□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 GAPVD1Q14C86 1478 aa6.18□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 PPFIA2O75334 1257 aa6.18□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 SLC43A1O75387 559 aa6.18□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 ALAS1P13196 640 aa6.18□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 MGAT1P26572 445 aa6.18□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 CACNB3P54284 484 aa6.18□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 FAM193AP78312 1265 aa6.18□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 VPS72Q15906 364 aa6.18□□□□□ -1.42
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TRDN-204ENST00000542443 PPP1R3BQ86XI6 285 aa6.18□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 RNF169Q8NCN4 708 aa6.18□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 PJA1Q8NG27 643 aa6.18□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa6.18□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 NT5C1BQ96P26 610 aa6.18□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 C1orf43Q9BWL3 253 aa6.18□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 BHMT2Q9H2M3 363 aa6.18□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa6.18□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 SPON1Q9HCB6 807 aa6.18□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 SLC52A1Q9NWF4 448 aa6.18□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa6.17□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 E9PCH4 1651 aa6.17□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 GOLIM4O00461 696 aa6.17□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 HAUS5O94927 633 aa6.17□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 PIK3CGP48736 1102 aa6.17□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 CCDC184Q52MB2 194 aa6.17□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 CCDC93Q567U6 631 aa6.17□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 RNF220Q5VTB9 566 aa6.17□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 PCSK4Q6UW60 755 aa6.17□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 OR10H5Q8NGA6 315 aa6.17□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 CRAMP1Q96RY5 1269 aa6.17□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 PACSIN1Q9BY11 444 aa6.17□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 C22orf23Q9BZE7 217 aa6.17□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 GSTO2Q9H4Y5 243 aa6.17□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 JKAMPQ9P055 326 aa6.17□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 STAP2Q9UGK3 403 aa6.17□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa6.17□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
TRDN-204ENST00000542443 PRSS29PA6NIE9 313 aa6.16□□□□□ -1.42
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