RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZSWIM3Q96MP5 696 aa28.36■■■□□ 2.13
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CRISPLD1Q9H336 500 aa28.36■■■□□ 2.13
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SEMA4AQ9H3S1 761 aa28.36■■■□□ 2.13
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BRD9Q9H8M2 597 aa28.36■■■□□ 2.13
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 R4GN57 208 aa28.36■■■□□ 2.13
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CENPPQ6IPU0 288 aa28.35■■■□□ 2.13
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ADSSL1Q8N142 457 aa28.35■■■□□ 2.13
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NELL2Q99435 816 aa28.35■■■□□ 2.13
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ANK1P16157 1881 aa28.35■■■□□ 2.13
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TEAD2Q15562 447 aa28.34■■■□□ 2.13
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF852Q6ZMS4 543 aa28.34■■■□□ 2.13
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KCNG4Q8TDN1 519 aa28.34■■■□□ 2.13
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DNAJC19Q96DA6 116 aa28.34■■■□□ 2.13
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DPP3Q9NY33 737 aa28.34■■■□□ 2.13
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EXOC7Q9UPT5 735 aa28.34■■■□□ 2.13
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MTMR6Q9Y217 621 aa28.34■■■□□ 2.13
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa28.34■■■□□ 2.13
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CYP11A1P05108 521 aa28.33■■■□□ 2.13
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAGEA9P43362 315 aa28.33■■■□□ 2.13
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATAD1Q8NBU5 361 aa28.33■■■□□ 2.13
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ACCSQ96QU6 501 aa28.33■■■□□ 2.13
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 USP28Q96RU2 1077 aa28.33■■■□□ 2.13
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM209Q96SK2 561 aa28.33■■■□□ 2.13
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRRC3Q9BY71 257 aa28.33■■■□□ 2.13
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GPR88Q9GZN0 384 aa28.33■■■□□ 2.13
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DNAJC25Q9H1X3 360 aa28.33■■■□□ 2.13
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa28.33■■■□□ 2.13
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRPV4Q9HBA0 871 aa28.33■■■□□ 2.13
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TBC1D7Q9P0N9 293 aa28.33■■■□□ 2.13
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DSEQ9UL01 958 aa28.33■■■□□ 2.13
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IRF7Q92985 503 aa28.32■■■□□ 2.12
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FOXD4L1Q9NU39 408 aa28.32■■■□□ 2.12
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ASB3Q9Y575 518 aa28.32■■■□□ 2.12
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TSC2P49815 1807 aa28.32■■■□□ 2.12
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NCAM2O15394 837 aa28.31■■■□□ 2.12
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LAMTOR5O43504 91 aa28.31■■■□□ 2.12
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IL18RAPO95256 599 aa28.31■■■□□ 2.12
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GCNT3O95395 438 aa28.31■■■□□ 2.12
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VIPR2P41587 438 aa28.31■■■□□ 2.12
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KCNA1Q09470 495 aa28.31■■■□□ 2.12
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HSFX1Q9UBD0 423 aa28.31■■■□□ 2.12
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa28.31■■■□□ 2.12
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPTBN4Q9H254 2564 aa28.3■■■□□ 2.12
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa28.3■■■□□ 2.12
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SCN1AP35498 2009 aa28.3■■■□□ 2.12
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A0A1W2PRU2 124 aa28.3■■■□□ 2.12
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IDEP14735 1019 aa28.3■■■□□ 2.12
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NT5DC4Q86YG4 428 aa28.3■■■□□ 2.12
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EFCAB13Q8IY85 973 aa28.3■■■□□ 2.12
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 THEM5Q8N1Q8 247 aa28.3■■■□□ 2.12
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TTC9BQ8N6N2 239 aa28.3■■■□□ 2.12
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CLDN23Q96B33 292 aa28.3■■■□□ 2.12
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OLFML3Q9NRN5 406 aa28.3■■■□□ 2.12
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa28.3■■■□□ 2.12
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAN2B1O00754 1011 aa28.29■■■□□ 2.12
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SOAT2O75908 522 aa28.29■■■□□ 2.12
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