RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000047207.6

Ccdc27-201, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ccdc27, Length 2,089 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Clec4gQ8BNX1 294 aa14.86□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Bmt2Q8BXK4 403 aa14.86□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Cfap36Q8C6E0 343 aa14.86□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Pop1Q8K205 1045 aa14.86□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 HemgnQ9ERZ0 503 aa14.86□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 H2-OaQ9QWV1 250 aa14.86□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Rtl9Q32KG4 1339 aa14.85□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Myl4P09541 193 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 ArP19091 899 aa14.85□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 NsfP46460 744 aa14.85□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Il1rapl1P59823 695 aa14.85□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Mfsd14aP70187 490 aa14.85□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Rmdn3Q3UJU9 470 aa14.85□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Churc1Q6DG52 112 aa14.85□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Ssxb5Q6XAS2 159 aa14.85□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Q80ZQ3 298 aa14.85□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Q8BT18 775 aa14.85□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Trip10Q8CJ53 603 aa14.85□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Amhr2Q8K592 568 aa14.85□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Acat1Q8QZT1 424 aa14.85□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Scrn2Q8VCA8 425 aa14.85□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 TgdsQ8VDR7 355 aa14.85□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Klhl35Q9CZ49 574 aa14.85□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Tmem206Q9D771 350 aa14.85□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 1700013H16RikQ9DAC5 291 aa14.85□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 PrccQ9EQC8 491 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Rilpl1Q9JJC6 406 aa14.85□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Ybx3Q9JKB3 361 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Tk2Q9R088 270 aa14.85□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Ptpn4Q9WU22 926 aa14.85□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 IkQ9Z1M8 557 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Ccdc88cQ6VGS5 2009 aa14.85□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Tcp11x2A2AEI7 503 aa14.85□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Gm1661E9Q963 441 aa14.85□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Pcdh9F8VPK8 1237 aa14.85□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Kbtbd2G3X9X1 623 aa14.85□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Dusp8O09112 663 aa14.85□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Ift81O35594 676 aa14.85□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Ppargc1aO70343 797 aa14.85□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Tom1O88746 492 aa14.85□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Crhr1P35347 415 aa14.85□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Adcy7P51829 1099 aa14.85□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Ppp1r12cQ3UMT1 782 aa14.85□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Grm6Q5NCH9 871 aa14.85□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Sh3rf1Q69ZI1 892 aa14.85□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Senp6Q6P7W0 1132 aa14.85□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Vmn2r26Q6TAC4 855 aa14.85□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 TbckQ8BM85 762 aa14.85□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Rpa3Q9CQ71 121 aa14.85□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Snx10Q9CWT3 201 aa14.85□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Pdk2Q9JK42 407 aa14.85□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Mettl1Q9Z120 268 aa14.85□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Ly75Q60767 1723 aa14.84□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Lonrf1D3YY23 762 aa14.84□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 DldO08749 509 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Chil3O35744 398 aa14.84□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 ItgalP24063 1163 aa14.84□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Mmp13P33435 472 aa14.84□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Rab20P35295 233 aa14.84□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 GssP51855 474 aa14.84□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Ezh1P70351 747 aa14.84□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Etv6P97360 485 aa14.84□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Lamc2Q61092 1191 aa14.84□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Arhgap20Q6IFT4 1182 aa14.84□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Slitrk1Q810C1 696 aa14.84□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Il33Q8BVZ5 266 aa14.84□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Abhd8Q8R0P8 439 aa14.84□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Pofut2Q8VHI3 429 aa14.84□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Ier5lQ99J55 406 aa14.84□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Eid1Q9DCR4 169 aa14.84□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Igdcc4Q9EQS9 1252 aa14.84□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Adamtsl1Q8BLI0 1745 aa14.84□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 1700018F24RikB2RW27 314 aa14.83□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Vmn2r59E9PUT5 865 aa14.83□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 PrkchP23298 683 aa14.83□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Ca8P28651 291 aa14.83□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 AdssP46664 456 aa14.83□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 VcpQ01853 806 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Znf112Q0VAW7 879 aa14.83□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Mylk3Q3UIZ8 795 aa14.83□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Grik1Q60934 836 aa14.83□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Tcf12Q61286 706 aa14.83□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Nuak1Q641K5 658 aa14.83□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Frmd5Q6P5H6 517 aa14.83□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Dzip3Q7TPV2 1204 aa14.83□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 CyldQ80TQ2 952 aa14.83□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Tubgcp5Q8BKN5 1024 aa14.83□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Osbpl2Q8BX94 484 aa14.83□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Ascc2Q91WR3 749 aa14.83□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Taf11Q99JX1 211 aa14.83□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 CalcbQ99MP3 130 aa14.83□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Psmd8Q9CX56 353 aa14.83□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Cmtm5Q9D6G9 156 aa14.83□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Jph2Q9ET78 696 aa14.83□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Hes6Q9JHE6 224 aa14.83□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Kif9Q9WV04 790 aa14.83□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Gdf11Q9Z1W4 405 aa14.83□□□□□ -0.03
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Col5a2Q3U962 1497 aa14.83□□□□□ -0.04
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Cdr1E9Q0B4 517 aa14.83□□□□□ -0.04
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Spata31d1dE9Q5W2 1247 aa14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 42.7 ms