Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT3

Snx10, Sorting nexin-10, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx10Q9CWT3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC41.04■■■■■ 4.16
Snx10Q9CWT3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Snx10Q9CWT3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Snx10Q9CWT3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Snx10Q9CWT3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
Snx10Q9CWT3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
Snx10Q9CWT3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
Snx10Q9CWT3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
Snx10Q9CWT3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
Snx10Q9CWT3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Snx10Q9CWT3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Snx10Q9CWT3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Snx10Q9CWT3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
Snx10Q9CWT3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
Snx10Q9CWT3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
Snx10Q9CWT3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Snx10Q9CWT3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Snx10Q9CWT3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Snx10Q9CWT3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Snx10Q9CWT3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Snx10Q9CWT3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Snx10Q9CWT3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Snx10Q9CWT3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Snx10Q9CWT3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Snx10Q9CWT3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Snx10Q9CWT3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Snx10Q9CWT3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
Snx10Q9CWT3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Snx10Q9CWT3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
Snx10Q9CWT3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Snx10Q9CWT3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Snx10Q9CWT3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Snx10Q9CWT3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Snx10Q9CWT3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Snx10Q9CWT3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Snx10Q9CWT3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Snx10Q9CWT3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Snx10Q9CWT3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Snx10Q9CWT3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Snx10Q9CWT3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Snx10Q9CWT3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Snx10Q9CWT3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Snx10Q9CWT3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Snx10Q9CWT3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
Snx10Q9CWT3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Snx10Q9CWT3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Snx10Q9CWT3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Snx10Q9CWT3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Snx10Q9CWT3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Snx10Q9CWT3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Snx10Q9CWT3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Snx10Q9CWT3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Snx10Q9CWT3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Snx10Q9CWT3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Snx10Q9CWT3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Snx10Q9CWT3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
Snx10Q9CWT3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
Snx10Q9CWT3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Snx10Q9CWT3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Snx10Q9CWT3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Snx10Q9CWT3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Snx10Q9CWT3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Snx10Q9CWT3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Snx10Q9CWT3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Snx10Q9CWT3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Snx10Q9CWT3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Snx10Q9CWT3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Snx10Q9CWT3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Snx10Q9CWT3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Snx10Q9CWT3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Snx10Q9CWT3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Snx10Q9CWT3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
Snx10Q9CWT3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
Snx10Q9CWT3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Snx10Q9CWT3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Snx10Q9CWT3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Snx10Q9CWT3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Snx10Q9CWT3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
Snx10Q9CWT3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Snx10Q9CWT3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
Snx10Q9CWT3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Snx10Q9CWT3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Snx10Q9CWT3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Snx10Q9CWT3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Snx10Q9CWT3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
Snx10Q9CWT3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Snx10Q9CWT3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Snx10Q9CWT3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Snx10Q9CWT3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Snx10Q9CWT3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Snx10Q9CWT3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
Snx10Q9CWT3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Snx10Q9CWT3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Snx10Q9CWT3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Snx10Q9CWT3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Snx10Q9CWT3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Snx10Q9CWT3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Snx10Q9CWT3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Snx10Q9CWT3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Snx10Q9CWT3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms