Protein–RNA interactions for Protein: P24063

Itgal, Integrin alpha-L, mousemouse

Predictions only

Length 1,163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgalP24063 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
ItgalP24063 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ItgalP24063 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ItgalP24063 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
ItgalP24063 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
ItgalP24063 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
ItgalP24063 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
ItgalP24063 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
ItgalP24063 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
ItgalP24063 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
ItgalP24063 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
ItgalP24063 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
ItgalP24063 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ItgalP24063 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
ItgalP24063 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ItgalP24063 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
ItgalP24063 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ItgalP24063 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ItgalP24063 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ItgalP24063 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
ItgalP24063 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ItgalP24063 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ItgalP24063 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ItgalP24063 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ItgalP24063 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
ItgalP24063 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ItgalP24063 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ItgalP24063 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ItgalP24063 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ItgalP24063 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ItgalP24063 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ItgalP24063 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ItgalP24063 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ItgalP24063 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
ItgalP24063 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ItgalP24063 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ItgalP24063 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ItgalP24063 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ItgalP24063 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ItgalP24063 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
ItgalP24063 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ItgalP24063 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ItgalP24063 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ItgalP24063 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ItgalP24063 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ItgalP24063 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ItgalP24063 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ItgalP24063 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ItgalP24063 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ItgalP24063 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ItgalP24063 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ItgalP24063 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
ItgalP24063 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ItgalP24063 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ItgalP24063 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ItgalP24063 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ItgalP24063 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ItgalP24063 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ItgalP24063 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ItgalP24063 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ItgalP24063 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ItgalP24063 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ItgalP24063 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ItgalP24063 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ItgalP24063 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ItgalP24063 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ItgalP24063 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ItgalP24063 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ItgalP24063 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ItgalP24063 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ItgalP24063 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ItgalP24063 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ItgalP24063 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ItgalP24063 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ItgalP24063 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ItgalP24063 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ItgalP24063 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ItgalP24063 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ItgalP24063 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
ItgalP24063 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ItgalP24063 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ItgalP24063 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ItgalP24063 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ItgalP24063 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ItgalP24063 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ItgalP24063 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ItgalP24063 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ItgalP24063 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ItgalP24063 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
ItgalP24063 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ItgalP24063 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ItgalP24063 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ItgalP24063 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ItgalP24063 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ItgalP24063 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ItgalP24063 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ItgalP24063 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ItgalP24063 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ItgalP24063 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ItgalP24063 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms