Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDR7

Tgds, dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgdsQ8VDR7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
TgdsQ8VDR7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
TgdsQ8VDR7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
TgdsQ8VDR7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TgdsQ8VDR7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
TgdsQ8VDR7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TgdsQ8VDR7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TgdsQ8VDR7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TgdsQ8VDR7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
TgdsQ8VDR7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TgdsQ8VDR7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TgdsQ8VDR7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TgdsQ8VDR7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TgdsQ8VDR7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
TgdsQ8VDR7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TgdsQ8VDR7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TgdsQ8VDR7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TgdsQ8VDR7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
TgdsQ8VDR7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TgdsQ8VDR7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TgdsQ8VDR7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TgdsQ8VDR7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TgdsQ8VDR7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TgdsQ8VDR7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TgdsQ8VDR7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
TgdsQ8VDR7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TgdsQ8VDR7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TgdsQ8VDR7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TgdsQ8VDR7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
TgdsQ8VDR7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TgdsQ8VDR7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TgdsQ8VDR7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TgdsQ8VDR7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TgdsQ8VDR7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TgdsQ8VDR7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TgdsQ8VDR7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
TgdsQ8VDR7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TgdsQ8VDR7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TgdsQ8VDR7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TgdsQ8VDR7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TgdsQ8VDR7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TgdsQ8VDR7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TgdsQ8VDR7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TgdsQ8VDR7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
TgdsQ8VDR7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TgdsQ8VDR7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TgdsQ8VDR7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TgdsQ8VDR7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TgdsQ8VDR7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TgdsQ8VDR7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TgdsQ8VDR7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TgdsQ8VDR7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TgdsQ8VDR7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
TgdsQ8VDR7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TgdsQ8VDR7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TgdsQ8VDR7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TgdsQ8VDR7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TgdsQ8VDR7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TgdsQ8VDR7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TgdsQ8VDR7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
TgdsQ8VDR7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TgdsQ8VDR7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TgdsQ8VDR7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TgdsQ8VDR7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TgdsQ8VDR7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TgdsQ8VDR7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TgdsQ8VDR7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TgdsQ8VDR7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TgdsQ8VDR7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TgdsQ8VDR7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TgdsQ8VDR7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TgdsQ8VDR7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TgdsQ8VDR7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TgdsQ8VDR7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TgdsQ8VDR7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TgdsQ8VDR7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TgdsQ8VDR7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TgdsQ8VDR7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TgdsQ8VDR7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TgdsQ8VDR7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TgdsQ8VDR7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TgdsQ8VDR7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TgdsQ8VDR7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TgdsQ8VDR7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TgdsQ8VDR7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TgdsQ8VDR7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TgdsQ8VDR7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TgdsQ8VDR7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TgdsQ8VDR7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TgdsQ8VDR7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TgdsQ8VDR7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TgdsQ8VDR7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TgdsQ8VDR7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TgdsQ8VDR7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TgdsQ8VDR7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TgdsQ8VDR7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TgdsQ8VDR7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TgdsQ8VDR7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TgdsQ8VDR7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TgdsQ8VDR7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.3 ms