RNA–Protein interactions for RNA: YDL007W

RPT2, Transcript of ATPase of the 19S regulatory particle of the 26S proteasome, yeast

Gene RPT2, Length 1,314 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPT2	YDL007W	YNR066C	P53752	436 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	INP1	Q03694	420 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	CCE1	Q03702	353 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	UPS3	Q04006	179 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	MSC3	Q05812	728 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	YPL278C	Q08990	100 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	VAM3	Q12241	283 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.7	□□□□□ -1.66	not detected
RPT2	YDL007W	DDI2	P0CH63	225 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	DDI3	P0CH64	225 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	YSR3	P23501	404 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	ERG3	P32353	365 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	MDH3	P32419	343 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.7	□□□□□ -1.66	not detected
RPT2	YDL007W	TIM12	P32830	109 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	MED6	P38782	295 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	RPL13B	P40212	199 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	ATG4	P53867	494 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	RCE1	Q03530	315 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	YMR082C	Q04276	118 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	ROY1	Q04847	553 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	ERV2	Q12284	196 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	FRE7	Q12333	620 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	RPL13A	Q12690	199 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	YPR170W-B	P0C5R9	85 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	RPB5	P20434	215 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	CPR2	P23285	205 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	UTR5	P32630	166 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	UTH1	P36135	365 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	MNL1	P38888	796 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	HSP10	P38910	106 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	YIL067C	P40514	678 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	FLC3	P53121	802 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	FHN1	P53279	174 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	PAU4	P53427	120 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	THI74	Q04083	370 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	ARR3	Q06598	404 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	MCH1	Q07376	486 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	YDL242W	Q07746	117 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	PAU23	Q07987	124 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	MCT1	Q12283	360 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	YDR262W	Q12331	272 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	PAU17	Q12370	124 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	COA2	Q3E823	68 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	PAU1	P0CE88	120 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	PAU14	P0CE89	120 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	PAU6	P0CE90	120 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	PAU18	P0CE91	120 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	PAU8	P0CE92	120 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	PAU11	P0CE93	120 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	TCA17	P32613	152 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	TRS65	P32893	560 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	GCS1	P35197	352 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	PAU13	P38725	120 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	YJL193W	P39542	402 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	BDH1	P39714	382 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	SUR7	P54003	302 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	YLR152C	P54072	576 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	ATG21	Q02887	496 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	PAU10	Q03050	120 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	HRT1	Q08273	121 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	PAU20	Q08322	120 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	PAU9	Q3E770	120 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	MSW1	P04803	379 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	MAK32	P23060	363 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	YCR025C	P25352	136 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	CWP1	P28319	239 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	OM14	P38325	134 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	TRM9	P49957	279 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	LST7	P53237	242 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	HHT1	P61830	136 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	DIG2	Q03373	323 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	MRX8	Q05473	314 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	STP3	Q05937	343 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	YPL257W	Q08974	193 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	YPQ1	Q12010	308 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	YDL157C	Q12082	118 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	FCY22	Q12119	530 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	COX17	Q12287	69 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	ERP4	Q12450	207 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	UBA3	Q99344	299 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPT2	YDL007W	SAL1	D6W196	494 aa		4.66	□□□□□ -1.66

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