RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493436.5

SH3BP4-211, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 481 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-211ENST00000493436 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 USP37Q86T82 979 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 RSAD2Q8WXG1 361 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 HPS3Q969F9 1004 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 MAGEF1Q9HAY2 307 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 CYP4F11Q9HBI6 524 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 MUC6Q6W4X9 2439 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 KMT2EQ8IZD2 1858 aa18.12■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 ANO9A1A5B4 782 aa18.12■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 ARHGEF37A1IGU5 675 aa18.12■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 PIRO00625 290 aa18.12■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 OAZ2O95190 189 aa18.12■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 SEC24AO95486 1093 aa18.12■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 LRG1P02750 347 aa18.12■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 CPB1P15086 417 aa18.12■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 CNNM4Q6P4Q7 775 aa18.12■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 EFCAB13Q8IY85 973 aa18.12■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 TCEAL8Q8IYN2 117 aa18.12■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 GLIS3Q8NEA6 775 aa18.12■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 FAM122AQ96E09 287 aa18.12■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 SENP8Q96LD8 212 aa18.12■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 C7orf25Q9BPX7 421 aa18.12■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 CBWD1Q9BRT8 395 aa18.12■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 PCIF1Q9H4Z3 704 aa18.12■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 DPP3Q9NY33 737 aa18.12■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 GOLGA8IPA6NC78 632 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 GOLGA8JA6NMD2 632 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 SPTLC1O15269 473 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 TYMPP19971 482 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 PAX3P23760 479 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 PLA2G5P39877 138 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 ADCY1Q08828 1119 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 OVOS1Q6IE37 1185 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 ARMCX5Q6P1M9 558 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 NT5DC4Q86YG4 428 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 BRSK2Q8IWQ3 736 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 ITFG1Q8TB96 612 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 NXPE3Q969Y0 559 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 CDH7Q9ULB5 785 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 KCNH3Q9ULD8 1083 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 DUSP12Q9UNI6 340 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 ZDHHC9Q9Y397 364 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 TSC2P49815 1807 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 EXTL3O43909 919 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 ODC1P11926 461 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 CASP1P29466 404 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 AFMP43652 599 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 TAF6P49848 677 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 WNT7BP56706 349 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 FAM26FQ5R3K3 315 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 UNC13DQ70J99 1090 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 SLC44A3Q8N4M1 653 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 FGF13Q92913 245 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 KCNH6Q9H252 994 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 BLZF1Q9H2G9 400 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 MAFFQ9ULX9 164 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 INSL5Q9Y5Q6 135 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 OR6C75A6NL08 312 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP18.09■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 NARSO43776 548 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 RHOP08100 348 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 OR4Q2P0C623 313 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 PTPN2P17706 415 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 KRT85P78386 507 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 HTR4Q13639 388 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 CEP57L1Q8IYX8 460 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 GPD1LQ8N335 351 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 CHAMP1Q96JM3 812 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 SPATA32Q96LK8 384 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 FBXL21Q9UKT6 434 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 ANHXE9PGG2 379 aa18.08■□□□□ 0.48
SH3BP4-211ENST00000493436 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
SH3BP4-211ENST00000493436 HOXD13P35453 343 aa18.08■□□□□ 0.48
SH3BP4-211ENST00000493436 VCPP55072 806 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
SH3BP4-211ENST00000493436 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
SH3BP4-211ENST00000493436 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa18.08■□□□□ 0.48
SH3BP4-211ENST00000493436 ELMOD1Q8N336 334 aa18.08■□□□□ 0.48
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF507Q8TCN5 953 aa18.08■□□□□ 0.48
SH3BP4-211ENST00000493436 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
SH3BP4-211ENST00000493436 ING5Q8WYH8 240 aa18.08■□□□□ 0.48
SH3BP4-211ENST00000493436 PGLYRP2Q96PD5 576 aa18.08■□□□□ 0.48
SH3BP4-211ENST00000493436 CORO1BQ9BR76 489 aa18.08■□□□□ 0.48
SH3BP4-211ENST00000493436 MFSD1Q9H3U5 465 aa18.08■□□□□ 0.48
SH3BP4-211ENST00000493436 PDE11AQ9HCR9 933 aa18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms