RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000005558.8

IFRD1-201, Transcript of interferon related developmental regulator 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene IFRD1, Length 1,834 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFRD1-201ENST00000005558 CDH8P55286 799 aa20.5■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 DBF4BQ8NFT6 615 aa20.5■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 WHAMMQ8TF30 809 aa20.5■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 SCLYQ96I15 445 aa20.5■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 FAM81BQ96LP2 452 aa20.5■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 TSPAN18Q96SJ8 248 aa20.5■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 ZSWIM1Q9BR11 485 aa20.5■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 GIT1Q9Y2X7 761 aa20.5■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 DUSP10Q9Y6W6 482 aa20.5■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 ZSCAN12O43309 604 aa20.49■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 USP8P40818 1118 aa20.49■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 RAP1GAPP47736 663 aa20.49■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 WDR72Q3MJ13 1102 aa20.49■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 ZNF662Q6ZS27 426 aa20.49■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 GLYCTKQ8IVS8 523 aa20.49■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 AGPAT1Q99943 283 aa20.49■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 PACSIN1Q9BY11 444 aa20.49■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 SMYD3Q9H7B4 428 aa20.49■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 CISHQ9NSE2 258 aa20.49■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 PCDH10Q9P2E7 1040 aa20.49■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 NAGPAQ9UK23 515 aa20.49■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 NME7Q9Y5B8 376 aa20.49■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 CXCL10P02778 98 aa20.48■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 CYP3A5P20815 502 aa20.48■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 CYP2C18P33260 490 aa20.48■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 RAB27AP51159 221 aa20.48■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 FMO1Q01740 532 aa20.48■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa20.48■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 CRIPAKQ8N1N5 446 aa20.48■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 BEST2Q8NFU1 509 aa20.48■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 HIPK3Q9H422 1215 aa20.48■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 C11orf49Q9H6J7 331 aa20.48■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 TAS2R14Q9NYV8 317 aa20.48■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 INPPL1O15357 1258 aa20.48■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 TLR3O15455 904 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 CFHP08603 1231 aa20.48■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 ITGB8P26012 769 aa20.48■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 LRPAP1P30533 357 aa20.48■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 ZNF667Q5HYK9 610 aa20.48■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa20.48■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 FAXDC2Q96IV6 333 aa20.48■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 IMPG2Q9BZV3 1241 aa20.48■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 MCOLN1Q9GZU1 580 aa20.48■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 DEF6Q9H4E7 631 aa20.48■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 SALL4Q9UJQ4 1053 aa20.48■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa20.48■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 DCDC2CA8MYV0 355 aa20.47■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 ENPP3O14638 875 aa20.47■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 OFD1O75665 1012 aa20.47■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 MMEP08473 750 aa20.47■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 KRT5P13647 590 aa20.47■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 ANXA13P27216 316 aa20.47■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 SCNN1GP51170 649 aa20.47■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 VAV2P52735 878 aa20.47■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 CCL23P55773 120 aa20.47■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 TMEM270Q6UE05 265 aa20.47■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 LIMS2Q7Z4I7 341 aa20.47■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 TWNKQ96RR1 684 aa20.47■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP20.47■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa20.47■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 LZTFL1Q9NQ48 299 aa20.47■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 HMGXB4Q9UGU5 601 aa20.47■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 TTC3P53804 2025 aa20.46■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 PJA2O43164 708 aa20.46■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 MAGEA1P43355 309 aa20.46■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 KRT83P78385 493 aa20.46■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 SLC24A5Q71RS6 500 aa20.46■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 LRRC52Q8N7C0 313 aa20.46■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 RSAD1Q9HA92 442 aa20.46■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa20.46■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 ALPK3Q96L96 1907 aa20.46■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 B4GALT3O60512 393 aa20.46■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 CD58P19256 250 aa20.46■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 CDR2Q01850 454 aa20.46■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 CLLU1OSQ5K130 101 aa20.46■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 TAF3Q5VWG9 929 aa20.46■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 CD300LGQ6UXG3 332 aa20.46■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 PAAF1Q9BRP4 392 aa20.46■□□□□ 0.87
IFRD1-201ENST00000005558 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
IFRD1-201ENST00000005558 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
IFRD1-201ENST00000005558 FMNL3Q8IVF7 1028 aa20.45■□□□□ 0.86
IFRD1-201ENST00000005558 RNF169Q8NCN4 708 aa20.45■□□□□ 0.86
IFRD1-201ENST00000005558 C3orf58Q8NDZ4 430 aa20.45■□□□□ 0.86
IFRD1-201ENST00000005558 TFAP2BQ92481 460 aa20.45■□□□□ 0.86
IFRD1-201ENST00000005558 ELOVL4Q9GZR5 314 aa20.45■□□□□ 0.86
IFRD1-201ENST00000005558 MICAL3Q7RTP6 2002 aa20.45■□□□□ 0.86
IFRD1-201ENST00000005558 CCP110O43303 1012 aa20.44■□□□□ 0.86
IFRD1-201ENST00000005558 CCDC172P0C7W6 258 aa20.44■□□□□ 0.86
IFRD1-201ENST00000005558 RAD23BP54727 409 aa20.44■□□□□ 0.86
IFRD1-201ENST00000005558 SPA17Q15506 151 aa20.44■□□□□ 0.86
IFRD1-201ENST00000005558 FTHL17Q9BXU8 183 aa20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 162.4 ms