RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637570.1

DCX-211, Transcript of doublecortin, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene DCX, Length 6,162 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCX-211ENST00000637570 NAA25Q14CX7 972 aa7.6□□□□□ -1.19
DCX-211ENST00000637570 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
DCX-211ENST00000637570 TTC36A6NLP5 189 aa7.6□□□□□ -1.19
DCX-211ENST00000637570 NECTIN2Q92692 538 aa7.6□□□□□ -1.19
DCX-211ENST00000637570 MKL2Q9ULH7 1088 aa7.6□□□□□ -1.19
DCX-211ENST00000637570 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
DCX-211ENST00000637570 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
DCX-211ENST00000637570 UBE4AQ14139 1066 aa7.59□□□□□ -1.19
DCX-211ENST00000637570 KCTD17Q8N5Z5 321 aa7.59□□□□□ -1.19
DCX-211ENST00000637570 CCDC113Q9H0I3 377 aa7.59□□□□□ -1.19
DCX-211ENST00000637570 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP7.59□□□□□ -1.19
DCX-211ENST00000637570 IFT57Q9NWB7 429 aa7.59□□□□□ -1.19
DCX-211ENST00000637570 SEPT6Q14141 434 aa7.59□□□□□ -1.2
DCX-211ENST00000637570 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.2
DCX-211ENST00000637570 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.2
DCX-211ENST00000637570 MORC4Q8TE76 937 aa7.58□□□□□ -1.2
DCX-211ENST00000637570 MYO15BQ96JP2 1530 aa7.58□□□□□ -1.2
DCX-211ENST00000637570 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
DCX-211ENST00000637570 CCDC146Q8IYE0 955 aa7.58□□□□□ -1.2
DCX-211ENST00000637570 FAM160A1Q05DH4 1040 aa7.58□□□□□ -1.2
DCX-211ENST00000637570 SLC4A10Q6U841 1118 aa7.58□□□□□ -1.2
DCX-211ENST00000637570 PPP4R2Q9NY27 417 aa7.58□□□□□ -1.2
DCX-211ENST00000637570 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
DCX-211ENST00000637570 RNF214Q8ND24 703 aa7.57□□□□□ -1.2
DCX-211ENST00000637570 RALBP1Q15311 655 aa7.57□□□□□ -1.2
DCX-211ENST00000637570 PIK3R5Q8WYR1 880 aa7.57□□□□□ -1.2
DCX-211ENST00000637570 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
DCX-211ENST00000637570 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
DCX-211ENST00000637570 PDE6BP35913 854 aa7.57□□□□□ -1.2
DCX-211ENST00000637570 TRHP20396 242 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
DCX-211ENST00000637570 STAC3Q96MF2 364 aa7.57□□□□□ -1.2
DCX-211ENST00000637570 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa7.56□□□□□ -1.2
DCX-211ENST00000637570 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP7.56□□□□□ -1.2
DCX-211ENST00000637570 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
DCX-211ENST00000637570 UBA5Q9GZZ9 404 aa7.56□□□□□ -1.2
DCX-211ENST00000637570 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
DCX-211ENST00000637570 H3BQV1 296 aa7.56□□□□□ -1.2
DCX-211ENST00000637570 CA8P35219 290 aa7.56□□□□□ -1.2
DCX-211ENST00000637570 CCDC27Q2M243 656 aa7.56□□□□□ -1.2
DCX-211ENST00000637570 IFFO2Q5TF58 517 aa7.56□□□□□ -1.2
DCX-211ENST00000637570 KSR1Q8IVT5 923 aa7.56□□□□□ -1.2
DCX-211ENST00000637570 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
DCX-211ENST00000637570 STK10O94804 968 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
DCX-211ENST00000637570 ITPRIPQ8IWB1 547 aa7.55□□□□□ -1.2
DCX-211ENST00000637570 CFAP45Q9UL16 551 aa7.55□□□□□ -1.2
DCX-211ENST00000637570 SLC4A1P02730 911 aa7.55□□□□□ -1.2
DCX-211ENST00000637570 SLC9A5Q14940 896 aa7.55□□□□□ -1.2
DCX-211ENST00000637570 RINLQ6ZS11 566 aa7.55□□□□□ -1.2
DCX-211ENST00000637570 RILPL2Q969X0 211 aa7.55□□□□□ -1.2
DCX-211ENST00000637570 CLUAP1Q96AJ1 413 aa7.55□□□□□ -1.2
DCX-211ENST00000637570 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
DCX-211ENST00000637570 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
DCX-211ENST00000637570 CERS3Q8IU89 383 aa7.54□□□□□ -1.2
DCX-211ENST00000637570 WHAMMQ8TF30 809 aa7.54□□□□□ -1.2
DCX-211ENST00000637570 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
DCX-211ENST00000637570 PIBF1Q8WXW3 757 aa7.54□□□□□ -1.2
DCX-211ENST00000637570 FMNL2Q96PY5 1086 aa7.54□□□□□ -1.2
DCX-211ENST00000637570 ATICP31939 592 aa7.54□□□□□ -1.2
DCX-211ENST00000637570 PKD2Q13563 968 aa7.54□□□□□ -1.2
DCX-211ENST00000637570 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
DCX-211ENST00000637570 SKAP1Q86WV1 359 aa7.54□□□□□ -1.2
DCX-211ENST00000637570 BRPF3Q9ULD4 1205 aa7.54□□□□□ -1.2
DCX-211ENST00000637570 PDS5BQ9NTI5 1447 aa7.54□□□□□ -1.2
DCX-211ENST00000637570 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
DCX-211ENST00000637570 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
DCX-211ENST00000637570 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
DCX-211ENST00000637570 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
DCX-211ENST00000637570 ATP2B1P20020 1258 aa7.53□□□□□ -1.2
DCX-211ENST00000637570 NUCB2P80303 420 aa7.53□□□□□ -1.2
DCX-211ENST00000637570 NUTM2FA1L443 756 aa7.53□□□□□ -1.2
DCX-211ENST00000637570 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa7.53□□□□□ -1.2
DCX-211ENST00000637570 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
DCX-211ENST00000637570 SPDYE4A6NLX3 237 aa7.52□□□□□ -1.2
DCX-211ENST00000637570 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
DCX-211ENST00000637570 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa7.52□□□□□ -1.21
DCX-211ENST00000637570 FAM180AQ6UWF9 173 aa7.52□□□□□ -1.21
DCX-211ENST00000637570 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
DCX-211ENST00000637570 ZWINTO95229 277 aa7.52□□□□□ -1.21
DCX-211ENST00000637570 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa7.52□□□□□ -1.21
DCX-211ENST00000637570 MCCP23508 829 aa7.51□□□□□ -1.21
DCX-211ENST00000637570 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
DCX-211ENST00000637570 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
DCX-211ENST00000637570 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
DCX-211ENST00000637570 CCDC70Q6NSX1 233 aa7.51□□□□□ -1.21
DCX-211ENST00000637570 ANLNQ9NQW6 1124 aa7.51□□□□□ -1.21
DCX-211ENST00000637570 HGSO14964 777 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
DCX-211ENST00000637570 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
DCX-211ENST00000637570 GOPCQ9HD26 462 aa7.51□□□□□ -1.21
DCX-211ENST00000637570 FAM177BA6PVY3 158 aa7.51□□□□□ -1.21
DCX-211ENST00000637570 BECN2A8MW95 431 aa7.51□□□□□ -1.21
DCX-211ENST00000637570 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
DCX-211ENST00000637570 NUP133Q8WUM0 1156 aa7.51□□□□□ -1.21
DCX-211ENST00000637570 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
DCX-211ENST00000637570 RMDN2Q96LZ7 410 aa7.5□□□□□ -1.21
DCX-211ENST00000637570 FAM107BQ9H098 131 aa7.5□□□□□ -1.21
DCX-211ENST00000637570 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
DCX-211ENST00000637570 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
DCX-211ENST00000637570 EPS15P42566 896 aa7.5□□□□□ -1.21
DCX-211ENST00000637570 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
DCX-211ENST00000637570 TIGD1Q96MW7 591 aa7.5□□□□□ -1.21
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