RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000624145.3

ANKRD28-215, Transcript of ankyrin repeat domain 28, human

TSL 2 BASIC

Gene ANKRD28, Length 6,383 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ANKRD28-215	ENST00000624145	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
ANKRD28-215	ENST00000624145	ZFP91-CNTF	A0A0A6YYC7	529 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
ANKRD28-215	ENST00000624145	EVA1C	P58658	441 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ANKRD28-215	ENST00000624145	SYCP1	Q15431	976 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ANKRD28-215	ENST00000624145	OLFM4	Q6UX06	510 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ANKRD28-215	ENST00000624145	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ANKRD28-215	ENST00000624145	KLHL34	Q8N239	644 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ANKRD28-215	ENST00000624145	TSPYL1	Q9H0U9	437 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ANKRD28-215	ENST00000624145	EZR	P15311	586 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	ANKRD62	A6NC57	917 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	ERLIN2	O94905	339 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	CCDC73	Q6ZRK6	1079 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	IFT57	Q9NWB7	429 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	GOLGA6L7	A0A1B0GV03	622 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	CCDC97	Q96F63	343 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	FAM13B	Q9NYF5	915 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	REC8	O95072	547 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	XBP1	P17861	261 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	PDILT	Q8N807	584 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	INCENP	Q9NQS7	918 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	EEA1	Q15075	1411 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	SMARCE1	Q969G3	411 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	ERCC6	Q03468	1493 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	TEF	Q10587	303 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	CEP162	Q5TB80	1403 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	CCDC66	A2RUB6	948 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	GOLGA6L10	A6NI86	522 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	LEKR1	Q6ZMV7	388 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	CCP110	O43303	1012 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	NGEF	Q8N5V2	710 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	NEBL	O76041	1014 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	KIAA0754	O94854	1291 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63	6e-7	■■■■□ 23.3
ANKRD28-215	ENST00000624145	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	FILIP1L	Q4L180	1135 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	ROCK1	Q13464	1354 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	DES	P17661	470 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	FOSB	P53539	338 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	PDE3B	Q13370	1112 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	RABEP1	Q15276	862 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	GSE1	Q14687	1217 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	KIF27	Q86VH2	1401 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	FYB1	O15117	783 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	TXLNA	P40222	546 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	CCDC27	Q2M243	656 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	SEPT11	Q9NVA2	429 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	PKD2	Q13563	968 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	FAM161A	Q3B820	660 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	LUC7L	Q9NQ29	371 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	MTERF4	Q7Z6M4	381 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	DYDC1	Q8WWB3	177 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	ERC2	O15083	957 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ANKRD28-215	ENST00000624145	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63

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