RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615007.4

LYNX1-208, Transcript of Ly6/neurotoxin 1, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LYNX1, Length 1,293 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LYNX1-208	ENST00000615007	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		41.06	■■■■■ 4.16
LYNX1-208	ENST00000615007	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	41.04	■■■■■ 4.16
LYNX1-208	ENST00000615007	BCAN	Q96GW7	911 aa		41.04	■■■■■ 4.16
LYNX1-208	ENST00000615007	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		41.03	■■■■■ 4.16
LYNX1-208	ENST00000615007	HSPA1L	P34931	641 aa		41.03	■■■■■ 4.16
LYNX1-208	ENST00000615007	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		41.03	■■■■■ 4.16
LYNX1-208	ENST00000615007	KCNA6	P17658	529 aa		41.02	■■■■■ 4.16
LYNX1-208	ENST00000615007	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	41.01	■■■■■ 4.16
LYNX1-208	ENST00000615007	NWD1	Q149M9	1564 aa		41	■■■■■ 4.15
LYNX1-208	ENST00000615007	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	41	■■■■■ 4.15
LYNX1-208	ENST00000615007	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		40.99	■■■■■ 4.15
LYNX1-208	ENST00000615007	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	40.98	■■■■■ 4.15
LYNX1-208	ENST00000615007	NAIP	Q13075	1403 aa		40.93	■■■■■ 4.14
LYNX1-208	ENST00000615007	TMEM94	Q12767	1356 aa		40.92	■■■■■ 4.14
LYNX1-208	ENST00000615007	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	40.9	■■■■■ 4.14
LYNX1-208	ENST00000615007	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	40.89	■■■■■ 4.14
LYNX1-208	ENST00000615007	DIP2A	Q14689	1571 aa		40.89	■■■■■ 4.14
LYNX1-208	ENST00000615007	HFM1	A2PYH4	1435 aa		40.85	■■■■■ 4.13
LYNX1-208	ENST00000615007	TBX22	Q9Y458	520 aa		40.83	■■■■■ 4.13
LYNX1-208	ENST00000615007	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	40.82	■■■■■ 4.13
LYNX1-208	ENST00000615007	ILDR2	Q71H61	639 aa		40.81	■■■■■ 4.12
LYNX1-208	ENST00000615007	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	40.81	■■■■■ 4.12
LYNX1-208	ENST00000615007	TRPM2	O94759	1503 aa		40.78	■■■■■ 4.12
LYNX1-208	ENST00000615007	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		40.76	■■■■■ 4.12
LYNX1-208	ENST00000615007	PIK3R4	Q99570	1358 aa		40.76	■■■■■ 4.12
LYNX1-208	ENST00000615007	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	40.76	■■■■■ 4.12
LYNX1-208	ENST00000615007	MSH6	P52701	1360 aa		40.75	■■■■■ 4.11
LYNX1-208	ENST00000615007	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		40.75	■■■■■ 4.11
LYNX1-208	ENST00000615007	CLTCL1	P53675	1640 aa		40.73	■■■■■ 4.11
LYNX1-208	ENST00000615007	KIF1B	O60333	1816 aa		40.72	■■■■■ 4.11
LYNX1-208	ENST00000615007	TRIM52	Q96A61	297 aa		40.7	■■■■■ 4.11
LYNX1-208	ENST00000615007	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	40.7	■■■■■ 4.11
LYNX1-208	ENST00000615007	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	40.69	■■■■■ 4.1
LYNX1-208	ENST00000615007	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		40.68	■■■■■ 4.1
LYNX1-208	ENST00000615007	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		40.67	■■■■■ 4.1
LYNX1-208	ENST00000615007	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		40.65	■■■■■ 4.1
LYNX1-208	ENST00000615007	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		40.62	■■■■■ 4.09
LYNX1-208	ENST00000615007	SOCS7	O14512	581 aa		40.61	■■■■■ 4.09
LYNX1-208	ENST00000615007	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		40.59	■■■■■ 4.09
LYNX1-208	ENST00000615007	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	40.59	■■■■■ 4.09
LYNX1-208	ENST00000615007	C14orf37	Q86TY3	774 aa		40.56	■■■■■ 4.08
LYNX1-208	ENST00000615007	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	40.54	■■■■■ 4.08
LYNX1-208	ENST00000615007	SLAIN2	Q9P270	581 aa		40.53	■■■■■ 4.08
LYNX1-208	ENST00000615007	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		40.53	■■■■■ 4.08
LYNX1-208	ENST00000615007	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	40.52	■■■■■ 4.08
LYNX1-208	ENST00000615007	PTPRU	Q92729	1446 aa		40.5	■■■■■ 4.07
LYNX1-208	ENST00000615007	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	40.5	■■■■■ 4.07
LYNX1-208	ENST00000615007	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		40.47	■■■■■ 4.07
LYNX1-208	ENST00000615007	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		40.46	■■■■■ 4.07
LYNX1-208	ENST00000615007	PHLPP1	O60346	1717 aa		40.45	■■■■■ 4.07
LYNX1-208	ENST00000615007	ATF3	P18847	181 aa		40.43	■■■■■ 4.06
LYNX1-208	ENST00000615007	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	40.41	■■■■■ 4.06
LYNX1-208	ENST00000615007	DCC	P43146	1447 aa		40.4	■■■■■ 4.06
LYNX1-208	ENST00000615007	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		40.4	■■■■■ 4.06
LYNX1-208	ENST00000615007	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	40.4	■■■■■ 4.06
LYNX1-208	ENST00000615007	MET	P08581	1390 aa		40.39	■■■■■ 4.06
LYNX1-208	ENST00000615007	PPL	O60437	1756 aa		40.37	■■■■■ 4.05
LYNX1-208	ENST00000615007	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		40.33	■■■■■ 4.05
LYNX1-208	ENST00000615007	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	40.3	■■■■■ 4.04
LYNX1-208	ENST00000615007	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	40.29	■■■■■ 4.04
LYNX1-208	ENST00000615007	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		40.29	■■■■■ 4.04
LYNX1-208	ENST00000615007	FOXD1	Q16676	465 aa		40.28	■■■■■ 4.04
LYNX1-208	ENST00000615007	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	40.27	■■■■■ 4.04
LYNX1-208	ENST00000615007	JCAD	Q9P266	1359 aa		40.27	■■■■■ 4.04
LYNX1-208	ENST00000615007	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		40.25	■■■■■ 4.03
LYNX1-208	ENST00000615007	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		40.24	■■■■■ 4.03
LYNX1-208	ENST00000615007	PTCH1	Q13635	1447 aa		40.23	■■■■■ 4.03
LYNX1-208	ENST00000615007	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		40.22	■■■■■ 4.03
LYNX1-208	ENST00000615007	MST1R	Q04912	1400 aa		40.17	■■■■■ 4.02
LYNX1-208	ENST00000615007	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		40.17	■■■■■ 4.02
LYNX1-208	ENST00000615007	IFT172	Q9UG01	1749 aa		40.16	■■■■■ 4.02
LYNX1-208	ENST00000615007	BRINP3	Q76B58	766 aa		40.16	■■■■■ 4.02
LYNX1-208	ENST00000615007	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		40.16	■■■■■ 4.02
LYNX1-208	ENST00000615007	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		40.15	■■■■■ 4.02
LYNX1-208	ENST00000615007	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		40.13	■■■■■ 4.02
LYNX1-208	ENST00000615007	SHPRH	Q149N8	1683 aa		40.13	■■■■■ 4.01
LYNX1-208	ENST00000615007	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	40.1	■■■■■ 4.01
LYNX1-208	ENST00000615007	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		40.1	■■■■■ 4.01
LYNX1-208	ENST00000615007	RGL3	Q3MIN7	710 aa		40.09	■■■■■ 4.01
LYNX1-208	ENST00000615007	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		40.09	■■■■■ 4.01
LYNX1-208	ENST00000615007	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		40.08	■■■■■ 4.01
LYNX1-208	ENST00000615007	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		40.06	■■■■■ 4
LYNX1-208	ENST00000615007	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		40.04	■■■■■ 4
LYNX1-208	ENST00000615007	PIK3C2G	O75747	1445 aa		39.98	■■■■□ 3.99
LYNX1-208	ENST00000615007	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		39.97	■■■■□ 3.99
LYNX1-208	ENST00000615007	LRP6	O75581	1613 aa		39.95	■■■■□ 3.99
LYNX1-208	ENST00000615007	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		39.94	■■■■□ 3.98
LYNX1-208	ENST00000615007	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	39.94	■■■■□ 3.98
LYNX1-208	ENST00000615007	TECPR2	O15040	1411 aa		39.92	■■■■□ 3.98
LYNX1-208	ENST00000615007	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		39.92	■■■■□ 3.98
LYNX1-208	ENST00000615007	POTEA	Q6S8J7	498 aa		39.91	■■■■□ 3.98
LYNX1-208	ENST00000615007	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	39.91	■■■■□ 3.98
LYNX1-208	ENST00000615007	LAMC1	P11047	1609 aa		39.91	■■■■□ 3.98
LYNX1-208	ENST00000615007	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	39.9	■■■■□ 3.98
LYNX1-208	ENST00000615007	MYOM2	P54296	1465 aa		39.89	■■■■□ 3.98
LYNX1-208	ENST00000615007	ABCC11	Q96J66	1382 aa		39.85	■■■■□ 3.97
LYNX1-208	ENST00000615007	STK26	Q9P289	416 aa		39.84	■■■■□ 3.97
LYNX1-208	ENST00000615007	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		39.83	■■■■□ 3.97
LYNX1-208	ENST00000615007	HRC	P23327	699 aa		39.81	■■■■□ 3.96
LYNX1-208	ENST00000615007	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	39.81	■■■■□ 3.96

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