RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611205.4

CDKN3-211, Transcript of cyclin dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CDKN3, Length 874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3-211ENST00000611205 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP37.58■■■■□ 3.61
CDKN3-211ENST00000611205 NWD1Q149M9 1564 aa37.56■■■■□ 3.6
CDKN3-211ENST00000611205 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP37.56■■■■□ 3.6
CDKN3-211ENST00000611205 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa37.54■■■■□ 3.6
CDKN3-211ENST00000611205 E9PCH4 1651 aa37.54■■■■□ 3.6
CDKN3-211ENST00000611205 ZFYVE9O95405 1425 aa37.53■■■■□ 3.6
CDKN3-211ENST00000611205 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP37.52■■■■□ 3.6
CDKN3-211ENST00000611205 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP37.52■■■■□ 3.6
CDKN3-211ENST00000611205 RIMS2Q9UQ26 1411 aa37.52■■■■□ 3.6
CDKN3-211ENST00000611205 FAM135BQ49AJ0 1406 aa37.51■■■■□ 3.59
CDKN3-211ENST00000611205 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa37.5■■■■□ 3.59
CDKN3-211ENST00000611205 CHGAP10645 457 aaKnown RBP37.49■■■■□ 3.59
CDKN3-211ENST00000611205 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP37.49■■■■□ 3.59
CDKN3-211ENST00000611205 ROCK1Q13464 1354 aa37.48■■■■□ 3.59
CDKN3-211ENST00000611205 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa37.48■■■■□ 3.59
CDKN3-211ENST00000611205 IQGAP3Q86VI3 1631 aa37.47■■■■□ 3.59
CDKN3-211ENST00000611205 HDGFP51858 240 aaKnown RBP37.47■■■■□ 3.59
CDKN3-211ENST00000611205 ITGAEP38570 1179 aa37.44■■■■□ 3.58
CDKN3-211ENST00000611205 MSH6P52701 1360 aa37.42■■■■□ 3.58
CDKN3-211ENST00000611205 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP37.38■■■■□ 3.57
CDKN3-211ENST00000611205 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP37.37■■■■□ 3.57
CDKN3-211ENST00000611205 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP37.37■■■■□ 3.57
CDKN3-211ENST00000611205 NUP155O75694 1391 aa37.37■■■■□ 3.57
CDKN3-211ENST00000611205 TBX22Q9Y458 520 aa37.33■■■■□ 3.57
CDKN3-211ENST00000611205 PHLPP1O60346 1717 aa37.3■■■■□ 3.56
CDKN3-211ENST00000611205 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP37.3■■■■□ 3.56
CDKN3-211ENST00000611205 SLAIN2Q9P270 581 aa37.29■■■■□ 3.56
CDKN3-211ENST00000611205 DIP2AQ14689 1571 aa37.29■■■■□ 3.56
CDKN3-211ENST00000611205 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa37.28■■■■□ 3.56
CDKN3-211ENST00000611205 C14orf37Q86TY3 774 aa37.25■■■■□ 3.55
CDKN3-211ENST00000611205 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa37.24■■■■□ 3.55
CDKN3-211ENST00000611205 TRPM2O94759 1503 aa37.2■■■■□ 3.55
CDKN3-211ENST00000611205 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa37.19■■■■□ 3.54
CDKN3-211ENST00000611205 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP37.19■■■■□ 3.54
CDKN3-211ENST00000611205 PIK3R4Q99570 1358 aa37.18■■■■□ 3.54
CDKN3-211ENST00000611205 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP37.12■■■■□ 3.53
CDKN3-211ENST00000611205 JCADQ9P266 1359 aa37.12■■■■□ 3.53
CDKN3-211ENST00000611205 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa37.11■■■■□ 3.53
CDKN3-211ENST00000611205 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa37.1■■■■□ 3.53
CDKN3-211ENST00000611205 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP37.1■■■■□ 3.53
CDKN3-211ENST00000611205 POTEAQ6S8J7 498 aa37.1■■■■□ 3.53
CDKN3-211ENST00000611205 CADPS2Q86UW7 1296 aa37.1■■■■□ 3.53
CDKN3-211ENST00000611205 C19orf44Q9H6X5 657 aa37.1■■■■□ 3.53
CDKN3-211ENST00000611205 PTPRUQ92729 1446 aa37.1■■■■□ 3.53
CDKN3-211ENST00000611205 ATF3P18847 181 aa37.09■■■■□ 3.53
CDKN3-211ENST00000611205 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa37.05■■■■□ 3.52
CDKN3-211ENST00000611205 CLTCL1P53675 1640 aa37.03■■■■□ 3.52
CDKN3-211ENST00000611205 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP37.03■■■■□ 3.52
CDKN3-211ENST00000611205 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP37.02■■■■□ 3.52
CDKN3-211ENST00000611205 KIF1BO60333 1816 aa37.01■■■■□ 3.52
CDKN3-211ENST00000611205 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP37■■■■□ 3.51
CDKN3-211ENST00000611205 NAIPQ13075 1403 aa36.96■■■■□ 3.51
CDKN3-211ENST00000611205 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa36.95■■■■□ 3.51
CDKN3-211ENST00000611205 SHPRHQ149N8 1683 aa36.94■■■■□ 3.5
CDKN3-211ENST00000611205 METP08581 1390 aa36.93■■■■□ 3.5
CDKN3-211ENST00000611205 LRP6O75581 1613 aa36.92■■■■□ 3.5
CDKN3-211ENST00000611205 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa36.92■■■■□ 3.5
CDKN3-211ENST00000611205 DCCP43146 1447 aa36.92■■■■□ 3.5
CDKN3-211ENST00000611205 BRINP3Q76B58 766 aa36.91■■■■□ 3.5
CDKN3-211ENST00000611205 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP36.9■■■■□ 3.5
CDKN3-211ENST00000611205 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP36.9■■■■□ 3.5
CDKN3-211ENST00000611205 TRIM52Q96A61 297 aa36.87■■■■□ 3.49
CDKN3-211ENST00000611205 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa36.85■■■■□ 3.49
CDKN3-211ENST00000611205 MST1RQ04912 1400 aa36.85■■■■□ 3.49
CDKN3-211ENST00000611205 NALCNQ8IZF0 1738 aa36.83■■■■□ 3.49
CDKN3-211ENST00000611205 NHSL1Q5SYE7 1610 aa36.81■■■■□ 3.48
CDKN3-211ENST00000611205 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa36.8■■■■□ 3.48
CDKN3-211ENST00000611205 HFM1A2PYH4 1435 aa36.79■■■■□ 3.48
CDKN3-211ENST00000611205 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP36.76■■■■□ 3.48
CDKN3-211ENST00000611205 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP36.76■■■■□ 3.48
CDKN3-211ENST00000611205 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP36.76■■■■□ 3.48
CDKN3-211ENST00000611205 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP36.75■■■■□ 3.47
CDKN3-211ENST00000611205 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP36.74■■■■□ 3.47
CDKN3-211ENST00000611205 VGFO15240 615 aaPredicted RBP36.73■■■■□ 3.47
CDKN3-211ENST00000611205 PPLO60437 1756 aa36.71■■■■□ 3.47
CDKN3-211ENST00000611205 SETD5Q9C0A6 1442 aa36.71■■■■□ 3.47
CDKN3-211ENST00000611205 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP36.68■■■■□ 3.46
CDKN3-211ENST00000611205 PTCH1Q13635 1447 aa36.67■■■■□ 3.46
CDKN3-211ENST00000611205 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP36.66■■■■□ 3.46
CDKN3-211ENST00000611205 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa36.65■■■■□ 3.46
CDKN3-211ENST00000611205 ROBO2Q9HCK4 1378 aa36.63■■■■□ 3.45
CDKN3-211ENST00000611205 C1orf167Q5SNV9 1468 aa36.62■■■■□ 3.45
CDKN3-211ENST00000611205 FOXD1Q16676 465 aa36.6■■■■□ 3.45
CDKN3-211ENST00000611205 AFF2P51816 1311 aa36.59■■■■□ 3.45
CDKN3-211ENST00000611205 PNPLA6Q8IY17 1366 aa36.58■■■■□ 3.45
CDKN3-211ENST00000611205 RXRBP28702 533 aa36.58■■■■□ 3.45
CDKN3-211ENST00000611205 PRAG1Q86YV5 1406 aa36.53■■■■□ 3.44
CDKN3-211ENST00000611205 C8orf37Q96NL8 207 aa36.53■■■■□ 3.44
CDKN3-211ENST00000611205 LAMC1P11047 1609 aa36.52■■■■□ 3.44
CDKN3-211ENST00000611205 ORAI2Q96SN7 254 aa36.52■■■■□ 3.44
CDKN3-211ENST00000611205 CCDC144AA2RUR9 1427 aa36.51■■■■□ 3.43
CDKN3-211ENST00000611205 IFT172Q9UG01 1749 aa36.46■■■■□ 3.43
CDKN3-211ENST00000611205 RGL3Q3MIN7 710 aa36.46■■■■□ 3.43
CDKN3-211ENST00000611205 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP36.46■■■■□ 3.43
CDKN3-211ENST00000611205 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP36.45■■■■□ 3.43
CDKN3-211ENST00000611205 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa36.45■■■■□ 3.43
CDKN3-211ENST00000611205 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP36.43■■■■□ 3.42
CDKN3-211ENST00000611205 ADAMTS2O95450 1211 aa36.43■■■■□ 3.42
CDKN3-211ENST00000611205 MPHOSPH9Q99550 1183 aa36.42■■■■□ 3.42
CDKN3-211ENST00000611205 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa36.41■■■■□ 3.42
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