RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597782.5

TIMM50-210, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 50, humanhuman

TSL 5

Gene TIMM50, Length 456 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM50-210ENST00000597782 KCNA6P17658 529 aa25.54■■□□□ 1.68
TIMM50-210ENST00000597782 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
TIMM50-210ENST00000597782 TMEM94Q12767 1356 aa25.51■■□□□ 1.67
TIMM50-210ENST00000597782 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
TIMM50-210ENST00000597782 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25.51■■□□□ 1.67
TIMM50-210ENST00000597782 CHGAP10645 457 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
TIMM50-210ENST00000597782 IQGAP3Q86VI3 1631 aa25.47■■□□□ 1.67
TIMM50-210ENST00000597782 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
TIMM50-210ENST00000597782 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP25.44■■□□□ 1.66
TIMM50-210ENST00000597782 E9PCH4 1651 aa25.44■■□□□ 1.66
TIMM50-210ENST00000597782 FAM135BQ49AJ0 1406 aa25.43■■□□□ 1.66
TIMM50-210ENST00000597782 RIMS2Q9UQ26 1411 aa25.43■■□□□ 1.66
TIMM50-210ENST00000597782 MSH6P52701 1360 aa25.43■■□□□ 1.66
TIMM50-210ENST00000597782 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa25.43■■□□□ 1.66
TIMM50-210ENST00000597782 NUP155O75694 1391 aa25.42■■□□□ 1.66
TIMM50-210ENST00000597782 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
TIMM50-210ENST00000597782 ZFYVE9O95405 1425 aa25.39■■□□□ 1.66
TIMM50-210ENST00000597782 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
TIMM50-210ENST00000597782 NWD1Q149M9 1564 aa25.39■■□□□ 1.65
TIMM50-210ENST00000597782 MYO5BQ9ULV0 1848 aa25.36■■□□□ 1.65
TIMM50-210ENST00000597782 C14orf37Q86TY3 774 aa25.36■■□□□ 1.65
TIMM50-210ENST00000597782 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa25.35■■□□□ 1.65
TIMM50-210ENST00000597782 TBX22Q9Y458 520 aa25.34■■□□□ 1.65
TIMM50-210ENST00000597782 NAIPQ13075 1403 aa25.32■■□□□ 1.64
TIMM50-210ENST00000597782 SLAIN2Q9P270 581 aa25.31■■□□□ 1.64
TIMM50-210ENST00000597782 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa25.31■■□□□ 1.64
TIMM50-210ENST00000597782 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
TIMM50-210ENST00000597782 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa25.27■■□□□ 1.64
TIMM50-210ENST00000597782 DIP2AQ14689 1571 aa25.27■■□□□ 1.64
TIMM50-210ENST00000597782 PIK3R4Q99570 1358 aa25.26■■□□□ 1.63
TIMM50-210ENST00000597782 HFM1A2PYH4 1435 aa25.26■■□□□ 1.63
TIMM50-210ENST00000597782 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa25.26■■□□□ 1.63
TIMM50-210ENST00000597782 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
TIMM50-210ENST00000597782 ATF3P18847 181 aa25.23■■□□□ 1.63
TIMM50-210ENST00000597782 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
TIMM50-210ENST00000597782 CADPS2Q86UW7 1296 aa25.22■■□□□ 1.63
TIMM50-210ENST00000597782 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa25.21■■□□□ 1.63
TIMM50-210ENST00000597782 TRPM2O94759 1503 aa25.21■■□□□ 1.63
TIMM50-210ENST00000597782 JCADQ9P266 1359 aa25.19■■□□□ 1.62
TIMM50-210ENST00000597782 TRIM52Q96A61 297 aa25.19■■□□□ 1.62
TIMM50-210ENST00000597782 C19orf44Q9H6X5 657 aa25.19■■□□□ 1.62
TIMM50-210ENST00000597782 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
TIMM50-210ENST00000597782 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa25.18■■□□□ 1.62
TIMM50-210ENST00000597782 PHLPP1O60346 1717 aa25.17■■□□□ 1.62
TIMM50-210ENST00000597782 CLTCL1P53675 1640 aa25.15■■□□□ 1.62
TIMM50-210ENST00000597782 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
TIMM50-210ENST00000597782 POTEAQ6S8J7 498 aa25.09■■□□□ 1.61
TIMM50-210ENST00000597782 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
TIMM50-210ENST00000597782 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
TIMM50-210ENST00000597782 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa25.08■■□□□ 1.6
TIMM50-210ENST00000597782 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa25.07■■□□□ 1.6
TIMM50-210ENST00000597782 KIF1BO60333 1816 aa25.07■■□□□ 1.6
TIMM50-210ENST00000597782 DCCP43146 1447 aa25.06■■□□□ 1.6
TIMM50-210ENST00000597782 PTPRUQ92729 1446 aa25.06■■□□□ 1.6
TIMM50-210ENST00000597782 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
TIMM50-210ENST00000597782 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
TIMM50-210ENST00000597782 BRINP3Q76B58 766 aa25.01■■□□□ 1.59
TIMM50-210ENST00000597782 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa25.01■■□□□ 1.59
TIMM50-210ENST00000597782 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa25.01■■□□□ 1.59
TIMM50-210ENST00000597782 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
TIMM50-210ENST00000597782 METP08581 1390 aa25■■□□□ 1.59
TIMM50-210ENST00000597782 VGFO15240 615 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
TIMM50-210ENST00000597782 FOXD1Q16676 465 aa24.99■■□□□ 1.59
TIMM50-210ENST00000597782 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
TIMM50-210ENST00000597782 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa24.95■■□□□ 1.59
TIMM50-210ENST00000597782 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa24.95■■□□□ 1.58
TIMM50-210ENST00000597782 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
TIMM50-210ENST00000597782 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
TIMM50-210ENST00000597782 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
TIMM50-210ENST00000597782 SHPRHQ149N8 1683 aa24.94■■□□□ 1.58
TIMM50-210ENST00000597782 MST1RQ04912 1400 aa24.94■■□□□ 1.58
TIMM50-210ENST00000597782 LRP6O75581 1613 aa24.94■■□□□ 1.58
TIMM50-210ENST00000597782 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa24.93■■□□□ 1.58
TIMM50-210ENST00000597782 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.93■■□□□ 1.58
TIMM50-210ENST00000597782 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
TIMM50-210ENST00000597782 MPHOSPH9Q99550 1183 aa24.91■■□□□ 1.58
TIMM50-210ENST00000597782 CCDC144AA2RUR9 1427 aa24.9■■□□□ 1.58
TIMM50-210ENST00000597782 PPLO60437 1756 aa24.88■■□□□ 1.57
TIMM50-210ENST00000597782 PTCH1Q13635 1447 aa24.86■■□□□ 1.57
TIMM50-210ENST00000597782 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.86■■□□□ 1.57
TIMM50-210ENST00000597782 RXRBP28702 533 aa24.84■■□□□ 1.57
TIMM50-210ENST00000597782 NHSL1Q5SYE7 1610 aa24.83■■□□□ 1.57
TIMM50-210ENST00000597782 NALCNQ8IZF0 1738 aa24.83■■□□□ 1.57
TIMM50-210ENST00000597782 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
TIMM50-210ENST00000597782 C1orf167Q5SNV9 1468 aa24.81■■□□□ 1.56
TIMM50-210ENST00000597782 AFF2P51816 1311 aa24.81■■□□□ 1.56
TIMM50-210ENST00000597782 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
TIMM50-210ENST00000597782 ROBO2Q9HCK4 1378 aa24.8■■□□□ 1.56
TIMM50-210ENST00000597782 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
TIMM50-210ENST00000597782 RGL3Q3MIN7 710 aa24.79■■□□□ 1.56
TIMM50-210ENST00000597782 C8orf37Q96NL8 207 aa24.79■■□□□ 1.56
TIMM50-210ENST00000597782 PNPLA6Q8IY17 1366 aa24.78■■□□□ 1.56
TIMM50-210ENST00000597782 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa24.78■■□□□ 1.56
TIMM50-210ENST00000597782 IFT172Q9UG01 1749 aa24.76■■□□□ 1.55
TIMM50-210ENST00000597782 PRAG1Q86YV5 1406 aa24.76■■□□□ 1.55
TIMM50-210ENST00000597782 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa24.73■■□□□ 1.55
TIMM50-210ENST00000597782 NGLY1Q96IV0 654 aa24.73■■□□□ 1.55
TIMM50-210ENST00000597782 ORAI2Q96SN7 254 aa24.73■■□□□ 1.55
TIMM50-210ENST00000597782 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
TIMM50-210ENST00000597782 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms