RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593701.5

SLC27A1-202, Transcript of solute carrier family 27 member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SLC27A1, Length 688 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A1-202ENST00000593701 GCC2Q8IWJ2 1684 aa30.34■■■□□ 2.45
SLC27A1-202ENST00000593701 NWD1Q149M9 1564 aa30.34■■■□□ 2.45
SLC27A1-202ENST00000593701 FAM135BQ49AJ0 1406 aa30.34■■■□□ 2.45
SLC27A1-202ENST00000593701 ZFYVE9O95405 1425 aa30.33■■■□□ 2.45
SLC27A1-202ENST00000593701 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP30.31■■■□□ 2.44
SLC27A1-202ENST00000593701 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa30.3■■■□□ 2.44
SLC27A1-202ENST00000593701 UNC13BO14795 1591 aa30.3■■■□□ 2.44
SLC27A1-202ENST00000593701 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP30.3■■■□□ 2.44
SLC27A1-202ENST00000593701 RIMS2Q9UQ26 1411 aa30.3■■■□□ 2.44
SLC27A1-202ENST00000593701 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa30.29■■■□□ 2.44
SLC27A1-202ENST00000593701 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa30.27■■■□□ 2.44
SLC27A1-202ENST00000593701 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP30.25■■■□□ 2.43
SLC27A1-202ENST00000593701 CHGAP10645 457 aaKnown RBP30.25■■■□□ 2.43
SLC27A1-202ENST00000593701 E9PCH4 1651 aa30.25■■■□□ 2.43
SLC27A1-202ENST00000593701 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP30.23■■■□□ 2.43
SLC27A1-202ENST00000593701 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP30.22■■■□□ 2.43
SLC27A1-202ENST00000593701 MSH6P52701 1360 aa30.22■■■□□ 2.43
SLC27A1-202ENST00000593701 IQGAP3Q86VI3 1631 aa30.18■■■□□ 2.42
SLC27A1-202ENST00000593701 ROCK1Q13464 1354 aa30.18■■■□□ 2.42
SLC27A1-202ENST00000593701 ITGAEP38570 1179 aa30.17■■■□□ 2.42
SLC27A1-202ENST00000593701 HDGFP51858 240 aaKnown RBP30.16■■■□□ 2.42
SLC27A1-202ENST00000593701 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP30.16■■■□□ 2.42
SLC27A1-202ENST00000593701 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa30.15■■■□□ 2.42
SLC27A1-202ENST00000593701 SLAIN2Q9P270 581 aa30.15■■■□□ 2.42
SLC27A1-202ENST00000593701 TBX22Q9Y458 520 aa30.14■■■□□ 2.42
SLC27A1-202ENST00000593701 NUP155O75694 1391 aa30.13■■■□□ 2.41
SLC27A1-202ENST00000593701 POTEAQ6S8J7 498 aa30.12■■■□□ 2.41
SLC27A1-202ENST00000593701 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP30.12■■■□□ 2.41
SLC27A1-202ENST00000593701 PHLPP1O60346 1717 aa30.12■■■□□ 2.41
SLC27A1-202ENST00000593701 C14orf37Q86TY3 774 aa30.06■■■□□ 2.4
SLC27A1-202ENST00000593701 DIP2AQ14689 1571 aa30.05■■■□□ 2.4
SLC27A1-202ENST00000593701 PTPRUQ92729 1446 aa30.03■■■□□ 2.4
SLC27A1-202ENST00000593701 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
SLC27A1-202ENST00000593701 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP30.02■■■□□ 2.4
SLC27A1-202ENST00000593701 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa30.02■■■□□ 2.4
SLC27A1-202ENST00000593701 JCADQ9P266 1359 aa30.01■■■□□ 2.39
SLC27A1-202ENST00000593701 PIK3R4Q99570 1358 aa30■■■□□ 2.39
SLC27A1-202ENST00000593701 TRPM2O94759 1503 aa29.99■■■□□ 2.39
SLC27A1-202ENST00000593701 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa29.98■■■□□ 2.39
SLC27A1-202ENST00000593701 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa29.97■■■□□ 2.39
SLC27A1-202ENST00000593701 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa29.96■■■□□ 2.39
SLC27A1-202ENST00000593701 C19orf44Q9H6X5 657 aa29.96■■■□□ 2.39
SLC27A1-202ENST00000593701 ATF3P18847 181 aa29.94■■■□□ 2.38
SLC27A1-202ENST00000593701 CADPS2Q86UW7 1296 aa29.94■■■□□ 2.38
SLC27A1-202ENST00000593701 LRP6O75581 1613 aa29.93■■■□□ 2.38
SLC27A1-202ENST00000593701 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
SLC27A1-202ENST00000593701 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
SLC27A1-202ENST00000593701 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
SLC27A1-202ENST00000593701 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
SLC27A1-202ENST00000593701 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa29.9■■■□□ 2.38
SLC27A1-202ENST00000593701 CLTCL1P53675 1640 aa29.87■■■□□ 2.37
SLC27A1-202ENST00000593701 BRINP3Q76B58 766 aa29.87■■■□□ 2.37
SLC27A1-202ENST00000593701 METP08581 1390 aa29.87■■■□□ 2.37
SLC27A1-202ENST00000593701 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa29.84■■■□□ 2.37
SLC27A1-202ENST00000593701 SHPRHQ149N8 1683 aa29.83■■■□□ 2.37
SLC27A1-202ENST00000593701 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa29.82■■■□□ 2.36
SLC27A1-202ENST00000593701 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP29.82■■■□□ 2.36
SLC27A1-202ENST00000593701 DCCP43146 1447 aa29.8■■■□□ 2.36
SLC27A1-202ENST00000593701 MST1RQ04912 1400 aa29.79■■■□□ 2.36
SLC27A1-202ENST00000593701 NAIPQ13075 1403 aa29.79■■■□□ 2.36
SLC27A1-202ENST00000593701 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
SLC27A1-202ENST00000593701 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa29.79■■■□□ 2.36
SLC27A1-202ENST00000593701 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP29.75■■■□□ 2.35
SLC27A1-202ENST00000593701 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP29.75■■■□□ 2.35
SLC27A1-202ENST00000593701 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP29.75■■■□□ 2.35
SLC27A1-202ENST00000593701 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
SLC27A1-202ENST00000593701 NALCNQ8IZF0 1738 aa29.74■■■□□ 2.35
SLC27A1-202ENST00000593701 KIF1BO60333 1816 aa29.73■■■□□ 2.35
SLC27A1-202ENST00000593701 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa29.72■■■□□ 2.35
SLC27A1-202ENST00000593701 NHSL1Q5SYE7 1610 aa29.72■■■□□ 2.35
SLC27A1-202ENST00000593701 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP29.7■■■□□ 2.35
SLC27A1-202ENST00000593701 TRIM52Q96A61 297 aa29.7■■■□□ 2.35
SLC27A1-202ENST00000593701 SETD5Q9C0A6 1442 aa29.69■■■□□ 2.34
SLC27A1-202ENST00000593701 ROBO2Q9HCK4 1378 aa29.62■■■□□ 2.33
SLC27A1-202ENST00000593701 HFM1A2PYH4 1435 aa29.62■■■□□ 2.33
SLC27A1-202ENST00000593701 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP29.61■■■□□ 2.33
SLC27A1-202ENST00000593701 AFF2P51816 1311 aa29.61■■■□□ 2.33
SLC27A1-202ENST00000593701 C1orf167Q5SNV9 1468 aa29.61■■■□□ 2.33
SLC27A1-202ENST00000593701 PNPLA6Q8IY17 1366 aa29.6■■■□□ 2.33
SLC27A1-202ENST00000593701 RXRBP28702 533 aa29.59■■■□□ 2.33
SLC27A1-202ENST00000593701 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
SLC27A1-202ENST00000593701 PTCH1Q13635 1447 aa29.59■■■□□ 2.33
SLC27A1-202ENST00000593701 VGFO15240 615 aaPredicted RBP29.58■■■□□ 2.33
SLC27A1-202ENST00000593701 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP29.58■■■□□ 2.33
SLC27A1-202ENST00000593701 FOXD1Q16676 465 aa29.56■■■□□ 2.32
SLC27A1-202ENST00000593701 C8orf37Q96NL8 207 aa29.55■■■□□ 2.32
SLC27A1-202ENST00000593701 ORAI2Q96SN7 254 aa29.55■■■□□ 2.32
SLC27A1-202ENST00000593701 PPLO60437 1756 aa29.54■■■□□ 2.32
SLC27A1-202ENST00000593701 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa29.51■■■□□ 2.32
SLC27A1-202ENST00000593701 LAMC1P11047 1609 aa29.49■■■□□ 2.31
SLC27A1-202ENST00000593701 PRAG1Q86YV5 1406 aa29.49■■■□□ 2.31
SLC27A1-202ENST00000593701 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
SLC27A1-202ENST00000593701 ADAMTS2O95450 1211 aa29.48■■■□□ 2.31
SLC27A1-202ENST00000593701 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
SLC27A1-202ENST00000593701 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.31
SLC27A1-202ENST00000593701 RGS12O14924 1447 aa29.45■■■□□ 2.3
SLC27A1-202ENST00000593701 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa29.45■■■□□ 2.3
SLC27A1-202ENST00000593701 RGL3Q3MIN7 710 aa29.42■■■□□ 2.3
SLC27A1-202ENST00000593701 NGLY1Q96IV0 654 aa29.42■■■□□ 2.3
SLC27A1-202ENST00000593701 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
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