RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587269.5

SMAD2-208, Transcript of SMAD family member 2, humanhuman

TSL 3

Gene SMAD2, Length 1,042 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD2-208ENST00000587269 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP44.65■■■■■ 4.74
SMAD2-208ENST00000587269 KCNA6P17658 529 aa44.64■■■■■ 4.74
SMAD2-208ENST00000587269 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP44.64■■■■■ 4.74
SMAD2-208ENST00000587269 RIMS2Q9UQ26 1411 aa44.62■■■■■ 4.73
SMAD2-208ENST00000587269 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP44.58■■■■■ 4.73
SMAD2-208ENST00000587269 MYO5BQ9ULV0 1848 aa44.57■■■■■ 4.73
SMAD2-208ENST00000587269 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa44.57■■■■■ 4.72
SMAD2-208ENST00000587269 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa44.54■■■■■ 4.72
SMAD2-208ENST00000587269 ZFYVE9O95405 1425 aa44.53■■■■■ 4.72
SMAD2-208ENST00000587269 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP44.49■■■■■ 4.71
SMAD2-208ENST00000587269 TMEM94Q12767 1356 aa44.48■■■■■ 4.71
SMAD2-208ENST00000587269 TRIM52Q96A61 297 aa44.46■■■■■ 4.71
SMAD2-208ENST00000587269 ALKQ9UM73 1620 aa44.45■■■■■ 4.71
SMAD2-208ENST00000587269 NAIPQ13075 1403 aa44.44■■■■■ 4.7
SMAD2-208ENST00000587269 TBX22Q9Y458 520 aa44.43■■■■■ 4.7
SMAD2-208ENST00000587269 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP44.41■■■■■ 4.7
SMAD2-208ENST00000587269 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP44.41■■■■■ 4.7
SMAD2-208ENST00000587269 ILDR2Q71H61 639 aa44.4■■■■■ 4.7
SMAD2-208ENST00000587269 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP44.38■■■■■ 4.7
SMAD2-208ENST00000587269 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP44.37■■■■■ 4.69
SMAD2-208ENST00000587269 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa44.35■■■■■ 4.69
SMAD2-208ENST00000587269 MSH6P52701 1360 aa44.31■■■■■ 4.68
SMAD2-208ENST00000587269 NWD1Q149M9 1564 aa44.31■■■■■ 4.68
SMAD2-208ENST00000587269 HFM1A2PYH4 1435 aa44.31■■■■■ 4.68
SMAD2-208ENST00000587269 C14orf37Q86TY3 774 aa44.28■■■■■ 4.68
SMAD2-208ENST00000587269 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP44.27■■■■■ 4.68
SMAD2-208ENST00000587269 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP44.26■■■■■ 4.68
SMAD2-208ENST00000587269 FAM135BQ49AJ0 1406 aa44.23■■■■■ 4.67
SMAD2-208ENST00000587269 DIP2AQ14689 1571 aa44.22■■■■■ 4.67
SMAD2-208ENST00000587269 PIK3R4Q99570 1358 aa44.22■■■■■ 4.67
SMAD2-208ENST00000587269 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa44.22■■■■■ 4.67
SMAD2-208ENST00000587269 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP44.2■■■■■ 4.67
SMAD2-208ENST00000587269 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP44.18■■■■■ 4.66
SMAD2-208ENST00000587269 TRPM2O94759 1503 aa44.15■■■■■ 4.66
SMAD2-208ENST00000587269 SOCS7O14512 581 aa44.15■■■■■ 4.66
SMAD2-208ENST00000587269 SLAIN2Q9P270 581 aa44.15■■■■■ 4.66
SMAD2-208ENST00000587269 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa44.15■■■■■ 4.66
SMAD2-208ENST00000587269 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa44.12■■■■■ 4.65
SMAD2-208ENST00000587269 CLTCL1P53675 1640 aa44.11■■■■■ 4.65
SMAD2-208ENST00000587269 KIF1BO60333 1816 aa44.1■■■■■ 4.65
SMAD2-208ENST00000587269 ATF3P18847 181 aa44.07■■■■■ 4.65
SMAD2-208ENST00000587269 C19orf44Q9H6X5 657 aa44.06■■■■■ 4.64
SMAD2-208ENST00000587269 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa44.05■■■■■ 4.64
SMAD2-208ENST00000587269 CADPS2Q86UW7 1296 aa44.04■■■■■ 4.64
SMAD2-208ENST00000587269 VGFO15240 615 aaPredicted RBP44.02■■■■■ 4.64
SMAD2-208ENST00000587269 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa44.01■■■■■ 4.64
SMAD2-208ENST00000587269 PTPRUQ92729 1446 aa43.97■■■■■ 4.63
SMAD2-208ENST00000587269 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa43.96■■■■■ 4.63
SMAD2-208ENST00000587269 FOXD1Q16676 465 aa43.95■■■■■ 4.63
SMAD2-208ENST00000587269 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa43.95■■■■■ 4.63
SMAD2-208ENST00000587269 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP43.93■■■■■ 4.62
SMAD2-208ENST00000587269 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa43.92■■■■■ 4.62
SMAD2-208ENST00000587269 METP08581 1390 aa43.92■■■■■ 4.62
SMAD2-208ENST00000587269 MPHOSPH9Q99550 1183 aa43.91■■■■■ 4.62
SMAD2-208ENST00000587269 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP43.87■■■■■ 4.61
SMAD2-208ENST00000587269 CCDC144AA2RUR9 1427 aa43.84■■■■■ 4.61
SMAD2-208ENST00000587269 PHLPP1O60346 1717 aa43.82■■■■■ 4.61
SMAD2-208ENST00000587269 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP43.8■■■■■ 4.6
SMAD2-208ENST00000587269 RGL3Q3MIN7 710 aa43.78■■■■■ 4.6
SMAD2-208ENST00000587269 SETD5Q9C0A6 1442 aa43.78■■■■■ 4.6
SMAD2-208ENST00000587269 JCADQ9P266 1359 aa43.76■■■■■ 4.6
SMAD2-208ENST00000587269 DCCP43146 1447 aa43.75■■■■■ 4.59
SMAD2-208ENST00000587269 BRINP3Q76B58 766 aa43.68■■■■■ 4.58
SMAD2-208ENST00000587269 PPLO60437 1756 aa43.67■■■■■ 4.58
SMAD2-208ENST00000587269 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa43.65■■■■■ 4.58
SMAD2-208ENST00000587269 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa43.61■■■■■ 4.57
SMAD2-208ENST00000587269 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP43.6■■■■■ 4.57
SMAD2-208ENST00000587269 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP43.59■■■■■ 4.57
SMAD2-208ENST00000587269 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa43.59■■■■■ 4.57
SMAD2-208ENST00000587269 PTCH1Q13635 1447 aa43.58■■■■■ 4.57
SMAD2-208ENST00000587269 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP43.58■■■■■ 4.57
SMAD2-208ENST00000587269 MST1RQ04912 1400 aa43.57■■■■■ 4.57
SMAD2-208ENST00000587269 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa43.57■■■■■ 4.57
SMAD2-208ENST00000587269 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP43.57■■■■■ 4.57
SMAD2-208ENST00000587269 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa43.56■■■■■ 4.56
SMAD2-208ENST00000587269 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa43.56■■■■■ 4.56
SMAD2-208ENST00000587269 ROBO2Q9HCK4 1378 aa43.55■■■■■ 4.56
SMAD2-208ENST00000587269 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP43.53■■■■■ 4.56
SMAD2-208ENST00000587269 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa43.51■■■■■ 4.56
SMAD2-208ENST00000587269 STK26Q9P289 416 aa43.5■■■■■ 4.55
SMAD2-208ENST00000587269 NALCNQ8IZF0 1738 aa43.5■■■■■ 4.55
SMAD2-208ENST00000587269 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP43.47■■■■■ 4.55
SMAD2-208ENST00000587269 POTEAQ6S8J7 498 aa43.44■■■■■ 4.54
SMAD2-208ENST00000587269 PRAG1Q86YV5 1406 aa43.42■■■■■ 4.54
SMAD2-208ENST00000587269 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP43.42■■■■■ 4.54
SMAD2-208ENST00000587269 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP43.42■■■■■ 4.54
SMAD2-208ENST00000587269 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP43.42■■■■■ 4.54
SMAD2-208ENST00000587269 C1orf167Q5SNV9 1468 aa43.4■■■■■ 4.54
SMAD2-208ENST00000587269 TMEM132EQ6IEE7 984 aa43.4■■■■■ 4.54
SMAD2-208ENST00000587269 SHPRHQ149N8 1683 aa43.39■■■■■ 4.54
SMAD2-208ENST00000587269 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP43.38■■■■■ 4.53
SMAD2-208ENST00000587269 IFT172Q9UG01 1749 aa43.38■■■■■ 4.53
SMAD2-208ENST00000587269 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP43.35■■■■■ 4.53
SMAD2-208ENST00000587269 NHSL1Q5SYE7 1610 aa43.34■■■■■ 4.53
SMAD2-208ENST00000587269 PIK3C2GO75747 1445 aa43.34■■■■■ 4.53
SMAD2-208ENST00000587269 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP43.33■■■■■ 4.53
SMAD2-208ENST00000587269 WAPLQ7Z5K2 1190 aa43.33■■■■■ 4.53
SMAD2-208ENST00000587269 ORAI2Q96SN7 254 aa43.33■■■■■ 4.53
SMAD2-208ENST00000587269 HRCP23327 699 aa43.32■■■■■ 4.53
SMAD2-208ENST00000587269 ABCC11Q96J66 1382 aa43.3■■■■■ 4.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms