RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575186.5

AKAP1-215, Transcript of A-kinase anchoring protein 1, human

TSL 4

Gene AKAP1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP1-215	ENST00000575186	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		32.99	■■■□□ 2.87
AKAP1-215	ENST00000575186	SLAIN2	Q9P270	581 aa		32.97	■■■□□ 2.87
AKAP1-215	ENST00000575186	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	32.97	■■■□□ 2.87
AKAP1-215	ENST00000575186	MSH6	P52701	1360 aa		32.96	■■■□□ 2.87
AKAP1-215	ENST00000575186	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	32.95	■■■□□ 2.87
AKAP1-215	ENST00000575186	ZFYVE9	O95405	1425 aa		32.94	■■■□□ 2.86
AKAP1-215	ENST00000575186	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	32.94	■■■□□ 2.86
AKAP1-215	ENST00000575186	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		32.94	■■■□□ 2.86
AKAP1-215	ENST00000575186	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	32.93	■■■□□ 2.86
AKAP1-215	ENST00000575186	NWD1	Q149M9	1564 aa		32.92	■■■□□ 2.86
AKAP1-215	ENST00000575186	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		32.92	■■■□□ 2.86
AKAP1-215	ENST00000575186	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		32.92	■■■□□ 2.86
AKAP1-215	ENST00000575186	TBX22	Q9Y458	520 aa		32.9	■■■□□ 2.86
AKAP1-215	ENST00000575186	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	32.86	■■■□□ 2.85
AKAP1-215	ENST00000575186	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	32.84	■■■□□ 2.85
AKAP1-215	ENST00000575186	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	32.82	■■■□□ 2.84
AKAP1-215	ENST00000575186	JCAD	Q9P266	1359 aa		32.82	■■■□□ 2.84
AKAP1-215	ENST00000575186	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		32.79	■■■□□ 2.84
AKAP1-215	ENST00000575186	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		32.77	■■■□□ 2.84
AKAP1-215	ENST00000575186	C14orf37	Q86TY3	774 aa		32.77	■■■□□ 2.84
AKAP1-215	ENST00000575186	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		32.77	■■■□□ 2.84
AKAP1-215	ENST00000575186	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	32.75	■■■□□ 2.83
AKAP1-215	ENST00000575186	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		32.73	■■■□□ 2.83
AKAP1-215	ENST00000575186	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		32.73	■■■□□ 2.83
AKAP1-215	ENST00000575186	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		32.72	■■■□□ 2.83
AKAP1-215	ENST00000575186	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		32.71	■■■□□ 2.83
AKAP1-215	ENST00000575186	PHLPP1	O60346	1717 aa		32.71	■■■□□ 2.83
AKAP1-215	ENST00000575186	ROCK1	Q13464	1354 aa		32.7	■■■□□ 2.83
AKAP1-215	ENST00000575186	UNC13B	O14795	1591 aa		32.7	■■■□□ 2.82
AKAP1-215	ENST00000575186	PIK3R4	Q99570	1358 aa		32.7	■■■□□ 2.82
AKAP1-215	ENST00000575186	ATF3	P18847	181 aa		32.69	■■■□□ 2.82
AKAP1-215	ENST00000575186	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		32.67	■■■□□ 2.82
AKAP1-215	ENST00000575186	NUP155	O75694	1391 aa		32.67	■■■□□ 2.82
AKAP1-215	ENST00000575186	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		32.65	■■■□□ 2.82
AKAP1-215	ENST00000575186		E9PCH4	1651 aa		32.63	■■■□□ 2.81
AKAP1-215	ENST00000575186	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	32.63	■■■□□ 2.81
AKAP1-215	ENST00000575186	PTPRU	Q92729	1446 aa		32.61	■■■□□ 2.81
AKAP1-215	ENST00000575186	LRP6	O75581	1613 aa		32.6	■■■□□ 2.81
AKAP1-215	ENST00000575186	ITGAE	P38570	1179 aa		32.6	■■■□□ 2.81
AKAP1-215	ENST00000575186	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	32.6	■■■□□ 2.81
AKAP1-215	ENST00000575186	DIP2A	Q14689	1571 aa		32.6	■■■□□ 2.81
AKAP1-215	ENST00000575186	BRINP3	Q76B58	766 aa		32.58	■■■□□ 2.81
AKAP1-215	ENST00000575186	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		32.57	■■■□□ 2.8
AKAP1-215	ENST00000575186	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	32.56	■■■□□ 2.8
AKAP1-215	ENST00000575186	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	32.56	■■■□□ 2.8
AKAP1-215	ENST00000575186	TRPM2	O94759	1503 aa		32.54	■■■□□ 2.8
AKAP1-215	ENST00000575186	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	32.54	■■■□□ 2.8
AKAP1-215	ENST00000575186	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	32.48	■■■□□ 2.79
AKAP1-215	ENST00000575186	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	32.48	■■■□□ 2.79
AKAP1-215	ENST00000575186	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	32.48	■■■□□ 2.79
AKAP1-215	ENST00000575186	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	32.48	■■■□□ 2.79
AKAP1-215	ENST00000575186	TRIM52	Q96A61	297 aa		32.48	■■■□□ 2.79
AKAP1-215	ENST00000575186	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	32.48	■■■□□ 2.79
AKAP1-215	ENST00000575186	DCC	P43146	1447 aa		32.46	■■■□□ 2.79
AKAP1-215	ENST00000575186	MET	P08581	1390 aa		32.45	■■■□□ 2.79
AKAP1-215	ENST00000575186	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	32.45	■■■□□ 2.79
AKAP1-215	ENST00000575186	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	32.45	■■■□□ 2.79
AKAP1-215	ENST00000575186	RXRB	P28702	533 aa		32.43	■■■□□ 2.78
AKAP1-215	ENST00000575186	SHPRH	Q149N8	1683 aa		32.41	■■■□□ 2.78
AKAP1-215	ENST00000575186	MST1R	Q04912	1400 aa		32.41	■■■□□ 2.78
AKAP1-215	ENST00000575186	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		32.41	■■■□□ 2.78
AKAP1-215	ENST00000575186	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		32.4	■■■□□ 2.78
AKAP1-215	ENST00000575186	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		32.39	■■■□□ 2.78
AKAP1-215	ENST00000575186	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		32.39	■■■□□ 2.78
AKAP1-215	ENST00000575186	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	32.37	■■■□□ 2.77
AKAP1-215	ENST00000575186	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	32.37	■■■□□ 2.77
AKAP1-215	ENST00000575186	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	32.36	■■■□□ 2.77
AKAP1-215	ENST00000575186	AFF2	P51816	1311 aa		32.35	■■■□□ 2.77
AKAP1-215	ENST00000575186	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		32.31	■■■□□ 2.76
AKAP1-215	ENST00000575186	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		32.29	■■■□□ 2.76
AKAP1-215	ENST00000575186	C8orf37	Q96NL8	207 aa		32.26	■■■□□ 2.75
AKAP1-215	ENST00000575186	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		32.26	■■■□□ 2.75
AKAP1-215	ENST00000575186	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	32.26	■■■□□ 2.75
AKAP1-215	ENST00000575186	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		32.26	■■■□□ 2.75
AKAP1-215	ENST00000575186	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	32.24	■■■□□ 2.75
AKAP1-215	ENST00000575186	CLTCL1	P53675	1640 aa		32.22	■■■□□ 2.75
AKAP1-215	ENST00000575186	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		32.22	■■■□□ 2.75
AKAP1-215	ENST00000575186	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	32.21	■■■□□ 2.75
AKAP1-215	ENST00000575186	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		32.21	■■■□□ 2.75
AKAP1-215	ENST00000575186	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	32.2	■■■□□ 2.75
AKAP1-215	ENST00000575186	NAIP	Q13075	1403 aa		32.18	■■■□□ 2.74
AKAP1-215	ENST00000575186	ORAI2	Q96SN7	254 aa		32.18	■■■□□ 2.74
AKAP1-215	ENST00000575186	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		32.18	■■■□□ 2.74
AKAP1-215	ENST00000575186	ADAMTS2	O95450	1211 aa		32.17	■■■□□ 2.74
AKAP1-215	ENST00000575186	NGLY1	Q96IV0	654 aa		32.16	■■■□□ 2.74
AKAP1-215	ENST00000575186	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	32.14	■■■□□ 2.74
AKAP1-215	ENST00000575186	PTCH1	Q13635	1447 aa		32.14	■■■□□ 2.74
AKAP1-215	ENST00000575186	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		32.13	■■■□□ 2.73
AKAP1-215	ENST00000575186	RGS12	O14924	1447 aa		32.12	■■■□□ 2.73
AKAP1-215	ENST00000575186	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	32.12	■■■□□ 2.73
AKAP1-215	ENST00000575186	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		32.12	■■■□□ 2.73
AKAP1-215	ENST00000575186	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	32.07	■■■□□ 2.72
AKAP1-215	ENST00000575186	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		32.05	■■■□□ 2.72
AKAP1-215	ENST00000575186	KIF1B	O60333	1816 aa		32.05	■■■□□ 2.72
AKAP1-215	ENST00000575186	USP21	Q9UK80	565 aa		32.04	■■■□□ 2.72
AKAP1-215	ENST00000575186	HFM1	A2PYH4	1435 aa		32.02	■■■□□ 2.72
AKAP1-215	ENST00000575186	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	32.02	■■■□□ 2.72
AKAP1-215	ENST00000575186	LAMC1	P11047	1609 aa		32.01	■■■□□ 2.72
AKAP1-215	ENST00000575186	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	32	■■■□□ 2.71
AKAP1-215	ENST00000575186	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		31.98	■■■□□ 2.71

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms