RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574899.1

PHF23-211, Transcript of PHD finger protein 23, humanhuman

TSL 3

Gene PHF23, Length 370 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF23-211ENST00000574899 PIP4K2BP78356 416 aa35.3■■■■□ 3.24
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PHF23-211ENST00000574899 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP35.27■■■■□ 3.24
PHF23-211ENST00000574899 HFM1A2PYH4 1435 aa35.23■■■■□ 3.23
PHF23-211ENST00000574899 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa35.22■■■■□ 3.23
PHF23-211ENST00000574899 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP35.21■■■■□ 3.23
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PHF23-211ENST00000574899 BCANQ96GW7 911 aa35.18■■■■□ 3.22
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PHF23-211ENST00000574899 TMEM94Q12767 1356 aa35.13■■■■□ 3.21
PHF23-211ENST00000574899 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa35.12■■■■□ 3.21
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PHF23-211ENST00000574899 KIF1BO60333 1816 aa35.04■■■■□ 3.2
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PHF23-211ENST00000574899 PIK3R4Q99570 1358 aa34.89■■■■□ 3.18
PHF23-211ENST00000574899 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa34.89■■■■□ 3.18
PHF23-211ENST00000574899 FAM135BQ49AJ0 1406 aa34.87■■■■□ 3.17
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PHF23-211ENST00000574899 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa34.83■■■■□ 3.17
PHF23-211ENST00000574899 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP34.82■■■■□ 3.16
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PHF23-211ENST00000574899 PPLO60437 1756 aa34.82■■■■□ 3.16
PHF23-211ENST00000574899 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP34.79■■■■□ 3.16
PHF23-211ENST00000574899 MPHOSPH9Q99550 1183 aa34.79■■■■□ 3.16
PHF23-211ENST00000574899 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa34.79■■■■□ 3.16
PHF23-211ENST00000574899 SETD5Q9C0A6 1442 aa34.76■■■■□ 3.16
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PHF23-211ENST00000574899 C14orf37Q86TY3 774 aa34.72■■■■□ 3.15
PHF23-211ENST00000574899 PHLPP1O60346 1717 aa34.68■■■■□ 3.14
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PHF23-211ENST00000574899 CCDC144AA2RUR9 1427 aa34.67■■■■□ 3.14
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PHF23-211ENST00000574899 C19orf44Q9H6X5 657 aa34.67■■■■□ 3.14
PHF23-211ENST00000574899 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa34.66■■■■□ 3.14
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PHF23-211ENST00000574899 ATF3P18847 181 aa34.6■■■■□ 3.13
PHF23-211ENST00000574899 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP34.59■■■■□ 3.13
PHF23-211ENST00000574899 RGL3Q3MIN7 710 aa34.59■■■■□ 3.13
PHF23-211ENST00000574899 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa34.58■■■■□ 3.13
PHF23-211ENST00000574899 DCCP43146 1447 aa34.55■■■■□ 3.12
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PHF23-211ENST00000574899 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa34.54■■■■□ 3.12
PHF23-211ENST00000574899 ROBO2Q9HCK4 1378 aa34.53■■■■□ 3.12
PHF23-211ENST00000574899 MST1RQ04912 1400 aa34.53■■■■□ 3.12
PHF23-211ENST00000574899 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP34.52■■■■□ 3.12
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PHF23-211ENST00000574899 PTCH1Q13635 1447 aa34.52■■■■□ 3.12
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PHF23-211ENST00000574899 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP34.47■■■■□ 3.11
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PHF23-211ENST00000574899 WAPLQ7Z5K2 1190 aa34.29■■■■□ 3.08
PHF23-211ENST00000574899 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa34.28■■■■□ 3.08
PHF23-211ENST00000574899 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa34.27■■■■□ 3.08
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PHF23-211ENST00000574899 ORAI2Q96SN7 254 aa34.26■■■■□ 3.08
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