RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567642.1

PPP4C-211, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 2

Gene PPP4C, Length 658 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-211ENST00000567642 HSPA1LP34931 641 aa31.86■■■□□ 2.69
PPP4C-211ENST00000567642 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP31.86■■■□□ 2.69
PPP4C-211ENST00000567642 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP31.85■■■□□ 2.69
PPP4C-211ENST00000567642 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP31.82■■■□□ 2.68
PPP4C-211ENST00000567642 RIMS2Q9UQ26 1411 aa31.82■■■□□ 2.68
PPP4C-211ENST00000567642 HDGFP51858 240 aaKnown RBP31.81■■■□□ 2.68
PPP4C-211ENST00000567642 ZFYVE9O95405 1425 aa31.8■■■□□ 2.68
PPP4C-211ENST00000567642 KCNA6P17658 529 aa31.79■■■□□ 2.68
PPP4C-211ENST00000567642 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa31.76■■■□□ 2.67
PPP4C-211ENST00000567642 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa31.75■■■□□ 2.67
PPP4C-211ENST00000567642 ILDR2Q71H61 639 aa31.74■■■□□ 2.67
PPP4C-211ENST00000567642 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP31.73■■■□□ 2.67
PPP4C-211ENST00000567642 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP31.73■■■□□ 2.67
PPP4C-211ENST00000567642 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP31.72■■■□□ 2.67
PPP4C-211ENST00000567642 TMEM94Q12767 1356 aa31.71■■■□□ 2.67
PPP4C-211ENST00000567642 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP31.71■■■□□ 2.67
PPP4C-211ENST00000567642 NWD1Q149M9 1564 aa31.7■■■□□ 2.67
PPP4C-211ENST00000567642 NAIPQ13075 1403 aa31.7■■■□□ 2.67
PPP4C-211ENST00000567642 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP31.69■■■□□ 2.66
PPP4C-211ENST00000567642 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP31.66■■■□□ 2.66
PPP4C-211ENST00000567642 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP31.63■■■□□ 2.65
PPP4C-211ENST00000567642 TBX22Q9Y458 520 aa31.62■■■□□ 2.65
PPP4C-211ENST00000567642 TRIM52Q96A61 297 aa31.61■■■□□ 2.65
PPP4C-211ENST00000567642 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP31.59■■■□□ 2.65
PPP4C-211ENST00000567642 DIP2AQ14689 1571 aa31.58■■■□□ 2.65
PPP4C-211ENST00000567642 HFM1A2PYH4 1435 aa31.58■■■□□ 2.65
PPP4C-211ENST00000567642 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa31.58■■■□□ 2.65
PPP4C-211ENST00000567642 KIF1BO60333 1816 aa31.57■■■□□ 2.64
PPP4C-211ENST00000567642 CLTCL1P53675 1640 aa31.57■■■□□ 2.64
PPP4C-211ENST00000567642 MSH6P52701 1360 aa31.56■■■□□ 2.64
PPP4C-211ENST00000567642 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa31.53■■■□□ 2.64
PPP4C-211ENST00000567642 TRPM2O94759 1503 aa31.53■■■□□ 2.64
PPP4C-211ENST00000567642 FAM135BQ49AJ0 1406 aa31.52■■■□□ 2.64
PPP4C-211ENST00000567642 PIK3R4Q99570 1358 aa31.49■■■□□ 2.63
PPP4C-211ENST00000567642 SOCS7O14512 581 aa31.49■■■□□ 2.63
PPP4C-211ENST00000567642 C14orf37Q86TY3 774 aa31.49■■■□□ 2.63
PPP4C-211ENST00000567642 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP31.47■■■□□ 2.63
PPP4C-211ENST00000567642 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa31.46■■■□□ 2.63
PPP4C-211ENST00000567642 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP31.46■■■□□ 2.63
PPP4C-211ENST00000567642 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa31.44■■■□□ 2.62
PPP4C-211ENST00000567642 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa31.43■■■□□ 2.62
PPP4C-211ENST00000567642 SLAIN2Q9P270 581 aa31.43■■■□□ 2.62
PPP4C-211ENST00000567642 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa31.43■■■□□ 2.62
PPP4C-211ENST00000567642 PTPRUQ92729 1446 aa31.41■■■□□ 2.62
PPP4C-211ENST00000567642 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa31.41■■■□□ 2.62
PPP4C-211ENST00000567642 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP31.41■■■□□ 2.62
PPP4C-211ENST00000567642 PHLPP1O60346 1717 aa31.38■■■□□ 2.61
PPP4C-211ENST00000567642 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP31.36■■■□□ 2.61
PPP4C-211ENST00000567642 C19orf44Q9H6X5 657 aa31.35■■■□□ 2.61
PPP4C-211ENST00000567642 ATF3P18847 181 aa31.34■■■□□ 2.61
PPP4C-211ENST00000567642 FOXD1Q16676 465 aa31.33■■■□□ 2.61
PPP4C-211ENST00000567642 METP08581 1390 aa31.32■■■□□ 2.6
PPP4C-211ENST00000567642 CADPS2Q86UW7 1296 aa31.32■■■□□ 2.6
PPP4C-211ENST00000567642 PPLO60437 1756 aa31.29■■■□□ 2.6
PPP4C-211ENST00000567642 VGFO15240 615 aaPredicted RBP31.28■■■□□ 2.6
PPP4C-211ENST00000567642 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa31.25■■■□□ 2.59
PPP4C-211ENST00000567642 MPHOSPH9Q99550 1183 aa31.24■■■□□ 2.59
PPP4C-211ENST00000567642 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP31.23■■■□□ 2.59
PPP4C-211ENST00000567642 CCDC144AA2RUR9 1427 aa31.21■■■□□ 2.59
PPP4C-211ENST00000567642 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP31.2■■■□□ 2.59
PPP4C-211ENST00000567642 DCCP43146 1447 aa31.19■■■□□ 2.58
PPP4C-211ENST00000567642 JCADQ9P266 1359 aa31.18■■■□□ 2.58
PPP4C-211ENST00000567642 NALCNQ8IZF0 1738 aa31.17■■■□□ 2.58
PPP4C-211ENST00000567642 SETD5Q9C0A6 1442 aa31.16■■■□□ 2.58
PPP4C-211ENST00000567642 RGL3Q3MIN7 710 aa31.16■■■□□ 2.58
PPP4C-211ENST00000567642 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP31.16■■■□□ 2.58
PPP4C-211ENST00000567642 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP31.15■■■□□ 2.58
PPP4C-211ENST00000567642 BRINP3Q76B58 766 aa31.14■■■□□ 2.58
PPP4C-211ENST00000567642 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa31.14■■■□□ 2.58
PPP4C-211ENST00000567642 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP31.12■■■□□ 2.57
PPP4C-211ENST00000567642 MST1RQ04912 1400 aa31.11■■■□□ 2.57
PPP4C-211ENST00000567642 IFT172Q9UG01 1749 aa31.11■■■□□ 2.57
PPP4C-211ENST00000567642 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa31.08■■■□□ 2.57
PPP4C-211ENST00000567642 PTCH1Q13635 1447 aa31.08■■■□□ 2.57
PPP4C-211ENST00000567642 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa31.07■■■□□ 2.57
PPP4C-211ENST00000567642 ROBO2Q9HCK4 1378 aa31.07■■■□□ 2.56
PPP4C-211ENST00000567642 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa31.07■■■□□ 2.56
PPP4C-211ENST00000567642 SHPRHQ149N8 1683 aa31.06■■■□□ 2.56
PPP4C-211ENST00000567642 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa31.05■■■□□ 2.56
PPP4C-211ENST00000567642 NHSL1Q5SYE7 1610 aa31.04■■■□□ 2.56
PPP4C-211ENST00000567642 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa31.04■■■□□ 2.56
PPP4C-211ENST00000567642 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa31.02■■■□□ 2.56
PPP4C-211ENST00000567642 POTEAQ6S8J7 498 aa31.01■■■□□ 2.55
PPP4C-211ENST00000567642 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP31■■■□□ 2.55
PPP4C-211ENST00000567642 PRAG1Q86YV5 1406 aa30.98■■■□□ 2.55
PPP4C-211ENST00000567642 LRP6O75581 1613 aa30.98■■■□□ 2.55
PPP4C-211ENST00000567642 STK26Q9P289 416 aa30.97■■■□□ 2.55
PPP4C-211ENST00000567642 C1orf167Q5SNV9 1468 aa30.96■■■□□ 2.55
PPP4C-211ENST00000567642 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP30.96■■■□□ 2.55
PPP4C-211ENST00000567642 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP30.94■■■□□ 2.54
PPP4C-211ENST00000567642 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP30.94■■■□□ 2.54
PPP4C-211ENST00000567642 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP30.94■■■□□ 2.54
PPP4C-211ENST00000567642 TMEM132EQ6IEE7 984 aa30.92■■■□□ 2.54
PPP4C-211ENST00000567642 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP30.92■■■□□ 2.54
PPP4C-211ENST00000567642 PIK3C2GO75747 1445 aa30.91■■■□□ 2.54
PPP4C-211ENST00000567642 KNDC1Q76NI1 1749 aa30.9■■■□□ 2.54
PPP4C-211ENST00000567642 ORAI2Q96SN7 254 aa30.89■■■□□ 2.54
PPP4C-211ENST00000567642 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP30.89■■■□□ 2.54
PPP4C-211ENST00000567642 WAPLQ7Z5K2 1190 aa30.87■■■□□ 2.53
PPP4C-211ENST00000567642 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa30.85■■■□□ 2.53
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