RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567147.5

RNPS1-222, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RNPS1, Length 830 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-222ENST00000567147 BCANQ96GW7 911 aa26.77■■□□□ 1.88
RNPS1-222ENST00000567147 PHLPP1O60346 1717 aa26.73■■□□□ 1.87
RNPS1-222ENST00000567147 LMTK2Q8IWU2 1503 aa26.73■■□□□ 1.87
RNPS1-222ENST00000567147 ADGRB3O60242 1522 aa26.72■■□□□ 1.87
RNPS1-222ENST00000567147 NWD1Q149M9 1564 aa26.71■■□□□ 1.87
RNPS1-222ENST00000567147 MSH6P52701 1360 aa26.7■■□□□ 1.86
RNPS1-222ENST00000567147 ROCK1Q13464 1354 aa26.7■■□□□ 1.86
RNPS1-222ENST00000567147 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
RNPS1-222ENST00000567147 NOS1P29475 1434 aa26.69■■□□□ 1.86
RNPS1-222ENST00000567147 MYO5BQ9ULV0 1848 aa26.69■■□□□ 1.86
RNPS1-222ENST00000567147 SLAIN2Q9P270 581 aa26.68■■□□□ 1.86
RNPS1-222ENST00000567147 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
RNPS1-222ENST00000567147 JCADQ9P266 1359 aa26.62■■□□□ 1.85
RNPS1-222ENST00000567147 SLC52A1Q9NWF4 448 aa26.62■■□□□ 1.85
RNPS1-222ENST00000567147 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.61■■□□□ 1.85
RNPS1-222ENST00000567147 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
RNPS1-222ENST00000567147 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
RNPS1-222ENST00000567147 ZFYVE9O95405 1425 aa26.59■■□□□ 1.85
RNPS1-222ENST00000567147 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa26.58■■□□□ 1.84
RNPS1-222ENST00000567147 RIMS2Q9UQ26 1411 aa26.57■■□□□ 1.84
RNPS1-222ENST00000567147 LRP6O75581 1613 aa26.57■■□□□ 1.84
RNPS1-222ENST00000567147 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
RNPS1-222ENST00000567147 C14orf37Q86TY3 774 aa26.56■■□□□ 1.84
RNPS1-222ENST00000567147 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
RNPS1-222ENST00000567147 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa26.54■■□□□ 1.84
RNPS1-222ENST00000567147 CHGAP10645 457 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
RNPS1-222ENST00000567147 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
RNPS1-222ENST00000567147 NUP155O75694 1391 aa26.53■■□□□ 1.84
RNPS1-222ENST00000567147 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
RNPS1-222ENST00000567147 TRIM52Q96A61 297 aa26.52■■□□□ 1.84
RNPS1-222ENST00000567147 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
RNPS1-222ENST00000567147 UNC13BO14795 1591 aa26.5■■□□□ 1.83
RNPS1-222ENST00000567147 TBX22Q9Y458 520 aa26.48■■□□□ 1.83
RNPS1-222ENST00000567147 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa26.47■■□□□ 1.83
RNPS1-222ENST00000567147 HDGFP51858 240 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
RNPS1-222ENST00000567147 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP26.46■■□□□ 1.832e-11■■■■■ 34.9
RNPS1-222ENST00000567147 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa26.45■■□□□ 1.82
RNPS1-222ENST00000567147 ATF3P18847 181 aa26.44■■□□□ 1.82
RNPS1-222ENST00000567147 SHPRHQ149N8 1683 aa26.44■■□□□ 1.82
RNPS1-222ENST00000567147 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
RNPS1-222ENST00000567147 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
RNPS1-222ENST00000567147 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa26.42■■□□□ 1.82
RNPS1-222ENST00000567147 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
RNPS1-222ENST00000567147 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
RNPS1-222ENST00000567147 CADPS2Q86UW7 1296 aa26.42■■□□□ 1.82
RNPS1-222ENST00000567147 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
RNPS1-222ENST00000567147 C19orf44Q9H6X5 657 aa26.42■■□□□ 1.82
RNPS1-222ENST00000567147 E9PCH4 1651 aa26.41■■□□□ 1.82
RNPS1-222ENST00000567147 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP26.41■■□□□ 1.82
RNPS1-222ENST00000567147 NAIPQ13075 1403 aa26.39■■□□□ 1.82
RNPS1-222ENST00000567147 IQGAP3Q86VI3 1631 aa26.39■■□□□ 1.82
RNPS1-222ENST00000567147 DIP2AQ14689 1571 aa26.37■■□□□ 1.81
RNPS1-222ENST00000567147 BRINP3Q76B58 766 aa26.37■■□□□ 1.81
RNPS1-222ENST00000567147 RXRBP28702 533 aa26.36■■□□□ 1.81
RNPS1-222ENST00000567147 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa26.36■■□□□ 1.81
RNPS1-222ENST00000567147 PTPRUQ92729 1446 aa26.36■■□□□ 1.81
RNPS1-222ENST00000567147 TRPM2O94759 1503 aa26.34■■□□□ 1.81
RNPS1-222ENST00000567147 PIK3R4Q99570 1358 aa26.33■■□□□ 1.8
RNPS1-222ENST00000567147 AFF2P51816 1311 aa26.3■■□□□ 1.8
RNPS1-222ENST00000567147 HFM1A2PYH4 1435 aa26.3■■□□□ 1.8
RNPS1-222ENST00000567147 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa26.29■■□□□ 1.8
RNPS1-222ENST00000567147 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
RNPS1-222ENST00000567147 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa26.26■■□□□ 1.79
RNPS1-222ENST00000567147 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
RNPS1-222ENST00000567147 NHSL1Q5SYE7 1610 aa26.25■■□□□ 1.79
RNPS1-222ENST00000567147 MST1RQ04912 1400 aa26.23■■□□□ 1.79
RNPS1-222ENST00000567147 C8orf37Q96NL8 207 aa26.23■■□□□ 1.79
RNPS1-222ENST00000567147 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
RNPS1-222ENST00000567147 DCCP43146 1447 aa26.22■■□□□ 1.79
RNPS1-222ENST00000567147 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.22■■□□□ 1.79
RNPS1-222ENST00000567147 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
RNPS1-222ENST00000567147 METP08581 1390 aa26.2■■□□□ 1.78
RNPS1-222ENST00000567147 RGS12O14924 1447 aa26.19■■□□□ 1.78
RNPS1-222ENST00000567147 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
RNPS1-222ENST00000567147 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
RNPS1-222ENST00000567147 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
RNPS1-222ENST00000567147 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa26.18■■□□□ 1.78
RNPS1-222ENST00000567147 PNPLA6Q8IY17 1366 aa26.16■■□□□ 1.78
RNPS1-222ENST00000567147 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa26.15■■□□□ 1.78
RNPS1-222ENST00000567147 NALCNQ8IZF0 1738 aa26.15■■□□□ 1.78
RNPS1-222ENST00000567147 ADAMTS2O95450 1211 aa26.13■■□□□ 1.77
RNPS1-222ENST00000567147 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
RNPS1-222ENST00000567147 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa26.12■■□□□ 1.77
RNPS1-222ENST00000567147 FOXD1Q16676 465 aa26.09■■□□□ 1.77
RNPS1-222ENST00000567147 NGLY1Q96IV0 654 aa26.09■■□□□ 1.77
RNPS1-222ENST00000567147 MPHOSPH9Q99550 1183 aa26.07■■□□□ 1.76
RNPS1-222ENST00000567147 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa26.07■■□□□ 1.76
RNPS1-222ENST00000567147 CLTCL1P53675 1640 aa26.06■■□□□ 1.76
RNPS1-222ENST00000567147 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa26.05■■□□□ 1.76
RNPS1-222ENST00000567147 C1orf167Q5SNV9 1468 aa26.04■■□□□ 1.76
RNPS1-222ENST00000567147 ORAI2Q96SN7 254 aa26.03■■□□□ 1.76
RNPS1-222ENST00000567147 USP21Q9UK80 565 aa26■■□□□ 1.75
RNPS1-222ENST00000567147 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
RNPS1-222ENST00000567147 VGFO15240 615 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
RNPS1-222ENST00000567147 KIF1BO60333 1816 aa25.98■■□□□ 1.75
RNPS1-222ENST00000567147 ATAD2Q6PL18 1390 aa25.97■■□□□ 1.75
RNPS1-222ENST00000567147 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa25.97■■□□□ 1.75
RNPS1-222ENST00000567147 LAMC1P11047 1609 aa25.97■■□□□ 1.75
RNPS1-222ENST00000567147 ROBO2Q9HCK4 1378 aa25.96■■□□□ 1.75
RNPS1-222ENST00000567147 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms