RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566914.1

KIFC3-227, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 3

Gene KIFC3, Length 724 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-227	ENST00000566914	ALK	Q9UM73	1620 aa		33.77	■■■■□ 3
KIFC3-227	ENST00000566914	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	33.76	■■■■□ 3
KIFC3-227	ENST00000566914	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		33.73	■■■□□ 2.99
KIFC3-227	ENST00000566914	ZFYVE9	O95405	1425 aa		33.72	■■■□□ 2.99
KIFC3-227	ENST00000566914	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		33.7	■■■□□ 2.99
KIFC3-227	ENST00000566914	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	33.7	■■■□□ 2.99
KIFC3-227	ENST00000566914	HSPA1L	P34931	641 aa		33.69	■■■□□ 2.98
KIFC3-227	ENST00000566914	NAIP	Q13075	1403 aa		33.69	■■■□□ 2.98
KIFC3-227	ENST00000566914	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	33.67	■■■□□ 2.98
KIFC3-227	ENST00000566914	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		33.63	■■■□□ 2.97
KIFC3-227	ENST00000566914	KCNA6	P17658	529 aa		33.61	■■■□□ 2.97
KIFC3-227	ENST00000566914	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	33.61	■■■□□ 2.97
KIFC3-227	ENST00000566914	NWD1	Q149M9	1564 aa		33.6	■■■□□ 2.97
KIFC3-227	ENST00000566914	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	33.59	■■■□□ 2.97
KIFC3-227	ENST00000566914	TMEM94	Q12767	1356 aa		33.59	■■■□□ 2.97
KIFC3-227	ENST00000566914	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	33.57	■■■□□ 2.96
KIFC3-227	ENST00000566914	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	33.56	■■■□□ 2.96
KIFC3-227	ENST00000566914	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	33.56	■■■□□ 2.96
KIFC3-227	ENST00000566914	HFM1	A2PYH4	1435 aa		33.55	■■■□□ 2.96
KIFC3-227	ENST00000566914	TRIM52	Q96A61	297 aa		33.55	■■■□□ 2.96
KIFC3-227	ENST00000566914	CLTCL1	P53675	1640 aa		33.53	■■■□□ 2.96
KIFC3-227	ENST00000566914	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	33.53	■■■□□ 2.96
KIFC3-227	ENST00000566914	ILDR2	Q71H61	639 aa		33.52	■■■□□ 2.96
KIFC3-227	ENST00000566914	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		33.48	■■■□□ 2.95
KIFC3-227	ENST00000566914	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	33.48	■■■□□ 2.95
KIFC3-227	ENST00000566914	TRPM2	O94759	1503 aa		33.48	■■■□□ 2.95
KIFC3-227	ENST00000566914	KIF1B	O60333	1816 aa		33.46	■■■□□ 2.95
KIFC3-227	ENST00000566914	DIP2A	Q14689	1571 aa		33.46	■■■□□ 2.95
KIFC3-227	ENST00000566914	TBX22	Q9Y458	520 aa		33.45	■■■□□ 2.95
KIFC3-227	ENST00000566914	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	33.45	■■■□□ 2.95
KIFC3-227	ENST00000566914	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		33.4	■■■□□ 2.94
KIFC3-227	ENST00000566914	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	33.4	■■■□□ 2.94
KIFC3-227	ENST00000566914	MSH6	P52701	1360 aa		33.39	■■■□□ 2.94
KIFC3-227	ENST00000566914	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		33.39	■■■□□ 2.94
KIFC3-227	ENST00000566914	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		33.36	■■■□□ 2.93
KIFC3-227	ENST00000566914	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		33.34	■■■□□ 2.93
KIFC3-227	ENST00000566914	C14orf37	Q86TY3	774 aa		33.33	■■■□□ 2.93
KIFC3-227	ENST00000566914	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		33.32	■■■□□ 2.92
KIFC3-227	ENST00000566914	PTPRU	Q92729	1446 aa		33.32	■■■□□ 2.92
KIFC3-227	ENST00000566914	FOXD1	Q16676	465 aa		33.31	■■■□□ 2.92
KIFC3-227	ENST00000566914	PIK3R4	Q99570	1358 aa		33.31	■■■□□ 2.92
KIFC3-227	ENST00000566914	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		33.29	■■■□□ 2.92
KIFC3-227	ENST00000566914	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	33.27	■■■□□ 2.92
KIFC3-227	ENST00000566914	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	33.26	■■■□□ 2.92
KIFC3-227	ENST00000566914	SLAIN2	Q9P270	581 aa		33.23	■■■□□ 2.91
KIFC3-227	ENST00000566914	MET	P08581	1390 aa		33.22	■■■□□ 2.91
KIFC3-227	ENST00000566914	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	33.21	■■■□□ 2.91
KIFC3-227	ENST00000566914	PHLPP1	O60346	1717 aa		33.21	■■■□□ 2.91
KIFC3-227	ENST00000566914	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		33.2	■■■□□ 2.91
KIFC3-227	ENST00000566914	PPL	O60437	1756 aa		33.2	■■■□□ 2.91
KIFC3-227	ENST00000566914	SOCS7	O14512	581 aa		33.16	■■■□□ 2.9
KIFC3-227	ENST00000566914	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		33.16	■■■□□ 2.9
KIFC3-227	ENST00000566914	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	33.15	■■■□□ 2.9
KIFC3-227	ENST00000566914	ATF3	P18847	181 aa		33.14	■■■□□ 2.9
KIFC3-227	ENST00000566914	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		33.14	■■■□□ 2.9
KIFC3-227	ENST00000566914	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		33.12	■■■□□ 2.89
KIFC3-227	ENST00000566914	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		33.12	■■■□□ 2.89
KIFC3-227	ENST00000566914	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	33.11	■■■□□ 2.89
KIFC3-227	ENST00000566914	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		33.11	■■■□□ 2.89
KIFC3-227	ENST00000566914	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		33.08	■■■□□ 2.89
KIFC3-227	ENST00000566914	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		33.08	■■■□□ 2.89
KIFC3-227	ENST00000566914	RGL3	Q3MIN7	710 aa		33.06	■■■□□ 2.88
KIFC3-227	ENST00000566914	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	33.06	■■■□□ 2.88
KIFC3-227	ENST00000566914	IFT172	Q9UG01	1749 aa		33.04	■■■□□ 2.88
KIFC3-227	ENST00000566914	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		33.02	■■■□□ 2.88
KIFC3-227	ENST00000566914	DCC	P43146	1447 aa		33.01	■■■□□ 2.87
KIFC3-227	ENST00000566914	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		33	■■■□□ 2.87
KIFC3-227	ENST00000566914	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		33	■■■□□ 2.87
KIFC3-227	ENST00000566914	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	32.99	■■■□□ 2.87
KIFC3-227	ENST00000566914	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		32.98	■■■□□ 2.87
KIFC3-227	ENST00000566914	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		32.96	■■■□□ 2.87
KIFC3-227	ENST00000566914	MST1R	Q04912	1400 aa		32.96	■■■□□ 2.87
KIFC3-227	ENST00000566914	BRINP3	Q76B58	766 aa		32.96	■■■□□ 2.87
KIFC3-227	ENST00000566914	JCAD	Q9P266	1359 aa		32.96	■■■□□ 2.87
KIFC3-227	ENST00000566914	PTCH1	Q13635	1447 aa		32.94	■■■□□ 2.86
KIFC3-227	ENST00000566914	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		32.94	■■■□□ 2.86
KIFC3-227	ENST00000566914	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	32.93	■■■□□ 2.86
KIFC3-227	ENST00000566914	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	32.9	■■■□□ 2.86
KIFC3-227	ENST00000566914	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		32.88	■■■□□ 2.85
KIFC3-227	ENST00000566914	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		32.88	■■■□□ 2.85
KIFC3-227	ENST00000566914	SHPRH	Q149N8	1683 aa		32.87	■■■□□ 2.85
KIFC3-227	ENST00000566914	STK26	Q9P289	416 aa		32.85	■■■□□ 2.85
KIFC3-227	ENST00000566914	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	32.84	■■■□□ 2.85
KIFC3-227	ENST00000566914	LRP6	O75581	1613 aa		32.83	■■■□□ 2.85
KIFC3-227	ENST00000566914	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		32.83	■■■□□ 2.85
KIFC3-227	ENST00000566914	PIK3C2G	O75747	1445 aa		32.82	■■■□□ 2.84
KIFC3-227	ENST00000566914	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		32.81	■■■□□ 2.84
KIFC3-227	ENST00000566914	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		32.8	■■■□□ 2.84
KIFC3-227	ENST00000566914	POTEA	Q6S8J7	498 aa		32.78	■■■□□ 2.84
KIFC3-227	ENST00000566914	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		32.77	■■■□□ 2.84
KIFC3-227	ENST00000566914	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	32.77	■■■□□ 2.84
KIFC3-227	ENST00000566914	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		32.77	■■■□□ 2.84
KIFC3-227	ENST00000566914	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	32.75	■■■□□ 2.83
KIFC3-227	ENST00000566914	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	32.75	■■■□□ 2.83
KIFC3-227	ENST00000566914	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	32.75	■■■□□ 2.83
KIFC3-227	ENST00000566914	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	32.74	■■■□□ 2.83
KIFC3-227	ENST00000566914	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		32.74	■■■□□ 2.83
KIFC3-227	ENST00000566914	ORAI2	Q96SN7	254 aa		32.73	■■■□□ 2.83
KIFC3-227	ENST00000566914	MYOM2	P54296	1465 aa		32.73	■■■□□ 2.83
KIFC3-227	ENST00000566914	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		32.72	■■■□□ 2.83

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms